Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | addA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | A4W86_RS04880 | Genome accession | NZ_CP017272 |
| Coordinates | 970966..974700 (+) | Length | 1244 a.a. |
| NCBI ID | WP_226474277.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Latilactobacillus sakei strain TMW 1.1239 | ||
| Function | homologous recombination; plasmid transformation (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 965966..979700
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A4W86_RS04870 (A4W86_04835) | mvk | 966189..967136 (-) | 948 | WP_025015793.1 | mevalonate kinase | - |
| A4W86_RS04875 (A4W86_04840) | - | 967413..970973 (+) | 3561 | WP_016265071.1 | PD-(D/E)XK nuclease family protein | - |
| A4W86_RS04880 (A4W86_04845) | addA | 970966..974700 (+) | 3735 | WP_226474277.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| A4W86_RS04885 (A4W86_04850) | - | 974766..977600 (+) | 2835 | WP_085391439.1 | helicase C-terminal domain-containing protein | - |
| A4W86_RS04890 (A4W86_04855) | - | 977678..978154 (+) | 477 | WP_011374615.1 | DUF5590 domain-containing protein | - |
| A4W86_RS04895 (A4W86_04860) | asnS | 978265..979563 (+) | 1299 | WP_011374616.1 | asparagine--tRNA ligase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1244 a.a. Molecular weight: 141274.03 Da Isoelectric Point: 4.7686
>NTDB_id=167641 A4W86_RS04880 WP_226474277.1 970966..974700(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain TMW 1.1239]
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Nucleotide
Download Length: 3735 bp
>NTDB_id=167641 A4W86_RS04880 WP_226474277.1 970966..974700(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain TMW 1.1239]
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| addA | Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 |
37.51 |
100 |
0.383 |