Escherichia coli APEC O11

TA loci of Escherichia coli APEC O1

Number of TA loci: experimental0; insolico26

TA ID Related MGEs Organism (replicon) Genome accession Toxin Antitoxin Family/Domain
in_silico TA021742 - Escherichia coli APEC O1 (chromosome) NC_008563 APECO1_RS31470 (ccdB) APECO1_RS00275 (ccdA) ccdAB/CcdA(antitoxin)
in_silico TA021743 GI Escherichia coli APEC O1 (chromosome) NC_008563 APECO1_RS01330 (yafO) APECO1_RS01325 (yafN) yafN-yafO (relBE)/YafO-YafN
in_silico TA021744 - Escherichia coli APEC O1 (chromosome) NC_008563 APECO1_RS02335 (Hha) APECO1_RS02340 (TomB) Hha-TomB/-
in_silico TA021745 GI Escherichia coli APEC O1 (chromosome) NC_008563 APECO1_RS02465 (higB) APECO1_RS02470 (higA) higBA (relBE)/HigB-HTH_XRE
in_silico TA021756 GI Escherichia coli APEC O1 (chromosome) NC_008563 APECO1_RS08325 (hipA) APECO1_RS08330 (hipB) hipBA/HipA-HipB
in_silico TA021765 - Escherichia coli APEC O1 (chromosome) NC_008563 APECO1_RS11220 (yoeB) APECO1_RS11225 (yefM) yefM-yoeB (relBE)/YoeB-YefM
in_silico TA021766 - Escherichia coli APEC O1 (chromosome) NC_008563 APECO1_RS15785 (mazF) APECO1_RS15790 (mazE) mazEF/PRK09907-MazE
in_silico TA021769 - Escherichia coli APEC O1 (chromosome) NC_008563 APECO1_RS22190 (higB) APECO1_RS22195 (higA) higBA (relBE)/HTH(antitoxin)
in_silico TA022479 Plasmid Escherichia coli APEC O1 (plasmid pAPEC-O1-ColBM) NC_009837 APECO1_RS25970 (vapC) APECO1_RS25975 (vapB) vapBC/VapC-VagC
in_silico TA022484 Plasmid Escherichia coli APEC O1 (plasmid pAPEC-O1-ColBM) NC_009837 APECO1_RS26035 (relE) APECO1_RS26030 (relB) relBE/ParE-YafN
in_silico TA022485 Plasmid Escherichia coli APEC O1 (plasmid pAPEC-O1-ColBM) NC_009837 APECO1_RS26085 (vagD) APECO1_RS26090 (vagC) vagCD/VapC-VagC
in_silico TA022486 Plasmid IScluster/Tn Escherichia coli APEC O1 (plasmid pAPEC-O1-ColBM) NC_009837 APECO1_RS26210 (relE) APECO1_RS26205 (relB) relBE/RHH(antitoxin)
in_silico TA022487 Plasmid IScluster/Tn Escherichia coli APEC O1 (plasmid pAPEC-O1-ColBM) NC_009837 APECO1_RS26235 (vagD) APECO1_RS26240 (vagC) vagCD/VapC-VagC
in_silico TA022488 Plasmid Escherichia coli APEC O1 (plasmid pAPEC-O1-ColBM) NC_009837 APECO1_RS26315 (parE) APECO1_RS26310 (parD) parDE/RelE-RHH
in_silico TA022489 Plasmid Escherichia coli APEC O1 (plasmid pAPEC-O1-R) NC_009838 APECO1_RS27080 (hipA) APECO1_RS27075 (hipB) hipBA/HipA-HipB
experimentalExperimentally validated     insolicoBioinformatically predicted