Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | addA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | A4W87_RS05160 | Genome accession | NZ_CP017273 |
| Coordinates | 1018768..1022502 (-) | Length | 1244 a.a. |
| NCBI ID | WP_241782023.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Latilactobacillus sakei strain TMW 1.1396 | ||
| Function | homologous recombination; plasmid transformation (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 1013768..1027502
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A4W87_RS05145 (A4W87_05105) | asnS | 1013905..1015203 (-) | 1299 | WP_076631860.1 | asparagine--tRNA ligase | - |
| A4W87_RS05150 (A4W87_05110) | - | 1015314..1015790 (-) | 477 | WP_011374615.1 | DUF5590 domain-containing protein | - |
| A4W87_RS05155 (A4W87_05115) | - | 1015868..1018702 (-) | 2835 | WP_076631861.1 | helicase C-terminal domain-containing protein | - |
| A4W87_RS05160 (A4W87_05120) | addA | 1018768..1022502 (-) | 3735 | WP_241782023.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| A4W87_RS05165 (A4W87_05125) | - | 1022495..1026055 (-) | 3561 | WP_076631863.1 | PD-(D/E)XK nuclease family protein | - |
| A4W87_RS05170 (A4W87_05130) | mvk | 1026318..1027283 (+) | 966 | WP_076631864.1 | mevalonate kinase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1244 a.a. Molecular weight: 141273.15 Da Isoelectric Point: 4.8148
>NTDB_id=167722 A4W87_RS05160 WP_241782023.1 1018768..1022502(-) (addA) [Latilactobacillus sakei strain TMW 1.1396]
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Nucleotide
Download Length: 3735 bp
>NTDB_id=167722 A4W87_RS05160 WP_241782023.1 1018768..1022502(-) (addA) [Latilactobacillus sakei strain TMW 1.1396]
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| addA | Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 |
37.353 |
100 |
0.383 |