Detailed information of component protein
Summary
| Component ID | T6CP013381 |
| Component protein type | TssM |
| T6SS ID (Type) | T6SS01032  (Type i4b) |
| Strain | Acinetobacter baumannii AB307-0294 |
| Replicon | chromosome |
| Sequence | Protein sequence (1275 a.a.); Nucleotide sequence (3825 bp) |
| Reference | - |
Bioinformatics investigation has been performed on this T6SSExternal database links
| Locus tag (Gene) | ABBFA_RS11190 |
| Coordinate (Strand) | 2373911..2377735 (-) |
| NCBI ID | WP_000556921.1 |
| RefSeq | NZ_CP001172 |
| Uniprot ID | - |
| KEGG ID | - |
| PDB ID | - |
Pfam domain hit(s)
| Domain | Pfam ID | E-value | Aligned region |
|---|---|---|---|
| IcmF-related | PF06761.14 | 8e-83 | 496..837 |
| IcmF-related_N | PF14331.8 | 7.8e-79 | 188..444 |
| IcmF_C | PF06744.14 | 3.8e-18 | 1107..1197 |
Transmembrane helices
- Transmembrane helices are predicted using TMHMM 2.0 software.
| Prediction | Region | Sequence |
|---|
Signal peptides
- Sec/SPI: "standard" secretory signal peptides transported by the Sec translocon and cleaved by Signal Peptidase I (Lep).
- Sec/SPII: lipoprotein signal peptides transported by the Sec translocon and cleaved by Signal Peptidase II (Lsp).
- Tat/SPI: Tat signal peptides transported by the Tat translocon and cleaved by Signal Peptidase I (Lep).
| Prediction | Probability | Cleavage site | Signal peptide sequence |
|---|---|---|---|
| - | - |
Protein sequence: 1275 a.a.
>T6CP013381 NZ_CP001172:c2377735-2373911 [Acinetobacter baumannii AB307-0294] [TssM]
MHTILGYLWQYITNPKAIIALSLFVALMSSYTSIPRHIFWALASAYALGLIAYGIYWLIQRKKHAVQGEELAQAIEKDTQ
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Nucleotide sequence: 3825 bp
>T6CP013381 NZ_CP001172:c2377735-2373911 [Acinetobacter baumannii AB307-0294] [TssM]
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