BLAST results



Show/hide
alignment
Query Subject Identities (%) Coverage (%) E-value Score Alignment
Seq_1 oriT_R1162

100.0

100.0

1.13e-82 296
 Score = 296 bits (160),  Expect = 1e-82
 Identities = 160/160 (100%), Gaps = 0/160 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60

Query  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120

Query  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160


Seq_1 oriT_pQLICE

99.3

93.1

1.90e-75 272
 Score = 296 bits (160),  Expect = 1e-82
 Identities = 160/160 (100%), Gaps = 0/160 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60

Query  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120

Query  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160


Seq_1 oriT_pMMS

98.9

54.4

5.56e-41 158
 Score = 296 bits (160),  Expect = 1e-82
 Identities = 160/160 (100%), Gaps = 0/160 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60

Query  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120

Query  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160


Seq_1 oriT_pMMRS

98.9

54.4

5.56e-41 158
 Score = 296 bits (160),  Expect = 1e-82
 Identities = 160/160 (100%), Gaps = 0/160 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60

Query  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120

Query  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160


Seq_1 oriT_pMMB66EH

98.9

54.4

5.56e-41 158
 Score = 296 bits (160),  Expect = 1e-82
 Identities = 160/160 (100%), Gaps = 0/160 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60

Query  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120

Query  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160


Seq_1 oriT_pAY201

98.9

54.4

5.56e-41 158
 Score = 296 bits (160),  Expect = 1e-82
 Identities = 160/160 (100%), Gaps = 0/160 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60

Query  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120

Query  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160


Seq_1 oriT_pAY205

98.9

54.4

5.56e-41 158
 Score = 296 bits (160),  Expect = 1e-82
 Identities = 160/160 (100%), Gaps = 0/160 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GGCCAGTTTCTCGAAGAGAAACCGGTAAATGCGCCCTCCCCTACAAAGTAGGGTCGGGAT  60

Query  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61   TGCCGCCGCTGTGCCTCCATGATAGCCTACGAGACAGCACATTAACAATGGGGTGTCAAG  120

Query  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGGTTAAGGGGAGCAACAAGGCGGCGGATCGGCTGGCCA  160