Detailed information NTG0908793

Bioinformatically predicted

Overview

• Name: pilY1
• Type: Machinery gene
• Locus tag: SOI74_RS05290
• Genome accession: NZ_CP139287
• Coordinates: 1129451..1133305 (-)
• Length: 1284 a.a.
• NCBI ID: WP_032052644.1
• Uniprot ID: A0AAN4MG71
• Organism: Acinetobacter pittii strain 564U
• Function: assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake

Genomic Context

Location: 1124451..1138305

Locus tag	Gene name	Coordinates (strand)	Size (bp)	Protein ID	Product	Description
SOI74_RS05255 (SOI74_05255)	lip	1125189..1126130 (+)	942	WP_080612940.1	lipase family alpha/beta hydrolase	-
SOI74_RS05260 (SOI74_05260)	rplS	1126183..1126551 (-)	369	WP_002116654.1	50S ribosomal protein L19	-
SOI74_RS05265 (SOI74_05265)	trmD	1126771..1127526 (-)	756	WP_005067137.1	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	-
SOI74_RS05270 (SOI74_05270)	rimM	1127569..1128117 (-)	549	WP_002116736.1	ribosome maturation factor RimM	-
SOI74_RS05275 (SOI74_05275)	rpsP	1128137..1128388 (-)	252	WP_000260334.1	30S ribosomal protein S16	-
SOI74_RS05280 (SOI74_05280)	pilE	1128536..1128961 (-)	426	WP_014207809.1	type IV pilin protein	Machinery gene
SOI74_RS05285 (SOI74_05285)	pilY2	1128958..1129440 (-)	483	WP_002116770.1	type IV pilin protein	Machinery gene
SOI74_RS05290 (SOI74_05290)	pilY1	1129451..1133305 (-)	3855	WP_032052644.1	PilC/PilY family type IV pilus protein	Machinery gene
SOI74_RS05295 (SOI74_05295)	pilX	1133317..1134126 (-)	810	WP_017481716.1	PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein	Machinery gene
SOI74_RS05300 (SOI74_05300)	pilW	1134123..1135124 (-)	1002	WP_032052645.1	PilW family protein	Machinery gene
SOI74_RS05305 (SOI74_05305)	pilV	1135124..1135684 (-)	561	WP_078219781.1	type IV pilus modification protein PilV	Machinery gene
SOI74_RS05310 (SOI74_05310)	fimU	1135678..1136151 (-)	474	WP_005067119.1	Tfp pilus assembly protein FimT/FimU	Machinery gene
SOI74_RS05315 (SOI74_05315)	ispH	1136321..1137271 (-)	951	WP_032006348.1	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase	-
SOI74_RS05320 (SOI74_05320)	gmk	1137394..1138023 (+)	630	WP_005804544.1	guanylate kinase	-

Sequence

Protein

• Length: 1284 a.a.
• Molecular weight: 137666.17 Da
• Isoelectric Point: 7.7443

>NTDB_id=908793 SOI74_RS05290 WP_032052644.1 1129451..1133305(-) (pilY1) [Acinetobacter pittii strain 564U]
MKLKLKNFKPNNLWYAICSSSVAFTWLMTSSVVQASDLQIYASPTAGKKTIVMMLDTSGSMTNNSYGENRLAMLKNGMNA
FLASNNPVLNDTRVGLGNFSANGDSRSGQVLVAAAPLGDASTLNTVGSQRYKLKQAVANLTAGGSTPSAHAYAEAAAYLM
GTTTYSEANYAIRKDSYIKRVRKSDNRTEYSYCTNYRDSQIDTTNLWQPCRSNSYWSNWSTSNPGVDTATAYDTSSDWTY
SYTYYYTTFNYAVANADSGIPKSKSNDTASNPNIVVDRNASNLNAIYQSPLPAVTNRQSCDGQGIYFLSDGEPNNTTNTR
SATVMSTALGSTLGANFTCSGGLSNTTADSGWACMGEFAKRLFDKTKNPAGVSIQTAFVGFGSDFSSLSSSDVKNACRLS
SRTQSDRKGDDACSPNQTTNAVAAPGYGNGGFFPTQSAQGVTDSVIAFINNLEKVPLQPLTTGAISVPYDALNPKNLQEY
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TLSNSCFTNGKAKGNAVYIIDAKTGERLWWTSDTGSNIDNSNMKHSIVSRISTLDRDADGLVDHLYFGDLGGQIFRIDLN
NNQTKTNSTYSSFGVRVVRLANLATNDATYDSSNDYTAGNAPRFYEPPTVTIHDYGIRTFITVGIASGDRSTPLDVYPLT
GREGMSPSTALSGRPVNNVYGIIDKDFIKKNLMSLTDSQLETKDITRSTLRKNPQILRSGETRVAQIFFPNTGVGQSGWY
RSLSSMSDGTEKANNNFRIKGGLKAFEEPMAITGTLIVPVYDPQGTGIVAADPCLPRVVGETDQQTYCLPFGACLNSDGS
IDQNKENGSGFKTQTGTNCPVGASECNKNVIGSGIRGVTFVPTEDNPPATNSCGKLKLSGNESGTGEWQCTSHLVPARWY
ERYR

Nucleotide

• Length: 3855 bp

>NTDB_id=908793 SOI74_RS05290 WP_032052644.1 1129451..1133305(-) (pilY1) [Acinetobacter pittii strain 564U]
GTGAAACTAAAATTGAAGAATTTTAAGCCAAATAATTTATGGTATGCCATCTGTTCGAGTTCAGTTGCTTTTACATGGCT
AATGACAAGCTCCGTTGTGCAGGCGAGTGATTTACAAATTTATGCTTCACCTACAGCTGGTAAAAAAACTATTGTGATGA
TGTTGGATACATCAGGAAGTATGACCAACAATAGTTATGGCGAAAACCGTCTGGCCATGCTTAAAAATGGTATGAATGCT
TTTTTAGCAAGTAATAATCCTGTTTTAAATGACACTCGTGTGGGGTTGGGAAATTTCTCTGCAAATGGTGATAGCCGAAG
TGGGCAGGTTTTAGTGGCTGCTGCTCCTTTAGGAGATGCGAGTACGTTAAATACAGTGGGTTCTCAACGTTATAAATTAA
AACAGGCTGTTGCAAATTTAACTGCTGGCGGGTCAACGCCTTCAGCACATGCTTATGCGGAAGCTGCTGCTTATTTGATG
GGTACAACGACCTATTCAGAGGCGAATTATGCTATCCGAAAAGATAGCTATATAAAGCGTGTGCGAAAATCTGATAATAG
AACGGAATACTCATATTGTACGAATTATCGCGATTCACAAATCGATACCACAAATCTATGGCAACCTTGTCGCTCTAATA
GCTATTGGAGTAACTGGTCAACTTCTAATCCGGGTGTGGATACGGCAACTGCTTATGATACTTCGTCGGATTGGACCTAT
TCTTATACTTATTACTACACCACCTTTAATTATGCTGTAGCAAATGCAGATAGTGGTATCCCAAAATCAAAATCAAACGA
TACAGCCAGCAATCCCAATATTGTTGTAGATAGAAATGCCTCTAATTTAAATGCTATTTACCAATCTCCTTTACCTGCGG
TGACCAATCGCCAGAGTTGTGATGGGCAAGGAATCTACTTTTTATCAGATGGGGAGCCGAACAATACAACAAATACGCGT
TCTGCAACTGTCATGTCGACAGCCCTAGGCAGCACTTTGGGAGCAAATTTTACTTGTTCTGGAGGTTTGTCTAACACTAC
AGCAGACTCTGGTTGGGCCTGTATGGGGGAATTTGCAAAAAGATTATTTGATAAAACAAAAAACCCAGCTGGGGTTTCTA
TTCAAACAGCATTTGTCGGTTTTGGTAGTGACTTTTCTAGTTTAAGTTCTTCTGATGTAAAAAATGCCTGTCGTTTAAGT
TCGAGAACCCAATCTGACCGAAAAGGAGATGATGCGTGTTCACCGAATCAGACCACAAATGCGGTCGCTGCACCTGGTTA
TGGGAATGGAGGTTTTTTCCCTACCCAAAGTGCGCAAGGTGTAACAGACAGTGTTATCGCATTTATTAATAACTTAGAAA
AAGTTCCGTTACAACCCTTAACCACTGGCGCTATCTCAGTTCCTTATGATGCACTAAACCCTAAAAATTTACAGGAATAT
GGTTACTTACGGGCTTTAGAGCCAAACCCAGCTAACACCTACTTAACATGGCGTGGAAATTTAAAGAAATATCATGTTGT
TTTATCAGGGGGCAATGCAGGTGCTTTTGAAGCTAACACTGGTGGGTTGGTTTACAATGCAAGTGGGGCTTTTAGAACGG
GTACGAAAGATTATTGGAATAGCTCTAATTATAATGATGGAGGTAACGTCTTTTTAGGTGGTTCATATGCAAAAGTTCCT
TTACCAATTGCTGGACAAAATGAAACACGTGATGAAGATGGAAATATCATAAAATATTATTACGCAGTACAAACTAAAAT
CCGCAACTTATTTACTGATGTTTCCGCTGTTGCGGCAGATGGTAGCTTAACGAAAATATCGACTTCTGGAACTAATTTGC
TAAAAATCCCAGCTGCTCCCCCCGAAGGAACTAATCCTTTTGATAGTGTGGCTAATACAGCAAGTTATGTTTTAGGAAAA
TTTAATGCATCAACTGGACAAGATATTTTAAAAGCTTTCCCGATTGGCTTGAAATTAAAAATATTAAATTATCTAGGTTA
CTCAACTGATATTAGCGCTACGACTTTACCTTCGTCATTAGTTACATTGAATGAACCCTATTTATCGATGGGCGGTAGTA
TTCACTCTTTACCAGTACAGCTTACCTATAATGGAACATTAGATGAAAATGGGAATTTAACATCTGCTCGTGCACAATCT
ATTCTCTATGGAACGATGGAAGGTGGTCTGCATATTGTGGATGCTTCAACTGGTGTAGAACAAATGGCTTTCGTTCCCGC
TGATATATTAAATGATCCAGTTGCATCAAAAGCTTTAGTGGTTGGCCAAAGTGACACTACAGCTCCGGCTCACGGTATGG
ATGGGGCTTGGGTATCTGATCCTGCATATAGTATTACTACAACAGGAAGCGGTAGTTCAGCAGTATCAAAAGTAACTGCA
AAGCAAATGAATATTTATGGTGGCATGCGAATGGGGGGCAGCAGTTATTATGGCTTAAATGTCTTAAATCCTGCTTCACC
TAAGCTCCTCTTTAGAGTAGGAGCAGACCAAACTGATTATAGTCGTATGGGGCAGAGTTGGTCTAAACCTGTACTTGCAA
ATATACGTTATAACGGAGTTATTAAACGCGTTATGATTGTTGGTGGTGGCTACGACCAATGTTATGAAAACCCGAATATT
ACCTTGAGCAATTCTTGCTTTACGAATGGAAAAGCAAAAGGGAATGCTGTTTATATTATTGATGCTAAAACTGGGGAGCG
CTTATGGTGGACTAGTGATACAGGCTCTAATATAGATAACTCTAATATGAAGCACAGTATTGTTAGTCGCATTAGTACCT
TAGATCGAGATGCTGATGGTTTAGTCGACCATTTATATTTTGGCGATTTAGGCGGGCAAATTTTCCGTATCGATCTTAAT
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TGCTACTTATGATAGCTCGAACGACTATACCGCTGGGAATGCGCCGCGTTTTTATGAACCGCCCACAGTGACAATTCACG
ATTATGGAATCCGCACTTTTATTACTGTCGGTATTGCTTCAGGTGACCGTAGTACACCTTTAGATGTTTATCCGCTTACA
GGCCGTGAGGGGATGTCACCAAGTACAGCATTAAGTGGAAGACCTGTAAACAACGTTTATGGAATTATCGATAAAGACTT
TATTAAAAAGAATTTAATGTCTTTAACAGATAGCCAGCTTGAAACAAAAGATATTACTCGATCGACGCTTCGAAAAAATC
CACAAATTTTACGGTCTGGGGAAACACGAGTAGCACAGATTTTCTTTCCAAACACTGGGGTCGGGCAAAGTGGTTGGTAT
CGCTCGCTTTCTAGTATGAGCGATGGTACCGAGAAAGCTAATAATAATTTCCGTATTAAAGGTGGGCTAAAAGCTTTTGA
AGAGCCTATGGCAATTACAGGGACTTTAATTGTGCCTGTTTATGACCCGCAGGGAACAGGTATTGTAGCGGCAGACCCAT
GTTTACCCCGTGTAGTAGGTGAAACGGATCAACAGACTTACTGTTTACCATTTGGTGCCTGTCTTAATTCTGATGGGTCA
ATTGATCAAAATAAAGAGAATGGAAGTGGATTCAAAACACAAACTGGTACTAATTGCCCAGTAGGAGCTTCCGAATGTAA
TAAAAACGTTATTGGCTCCGGTATTCGTGGCGTAACATTTGTACCAACGGAGGATAACCCACCTGCGACTAATAGTTGTG
GGAAATTAAAGCTGTCTGGAAACGAGAGTGGAACGGGCGAGTGGCAATGTACAAGTCACTTAGTTCCTGCGCGCTGGTAT
GAGCGTTATCGCTAA

Domains

Predicted by InterproScan.

• Neisseria PilC beta-propeller domain (T4P_PilY1) (710-965)

• von Willebrand factor type A domain (VWA_2) (51-161)

Similar proteins

Only experimentally validated proteins are listed.

Protein	Organism	Identities (%)	Coverage (%)	Ha-value
pilY1	Acinetobacter baumannii D1279779	84.806	100	0.852