Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | pilY1 | Type | Machinery gene |
| Locus tag | ACM0O0_RS01655 | Genome accession | NZ_CP180689 |
| Coordinates | 343212..347066 (+) | Length | 1284 a.a. |
| NCBI ID | WP_416040977.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter lactucae isolate nanjing | ||
| Function | assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake |
||
Genomic Context
Location: 338212..352066
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ACM0O0_RS01625 | gmk | 338493..339122 (-) | 630 | WP_002116973.1 | guanylate kinase | - |
| ACM0O0_RS01630 | ispH | 339245..340195 (+) | 951 | WP_373358443.1 | 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase | - |
| ACM0O0_RS01635 | fimU | 340366..340839 (+) | 474 | WP_416040975.1 | Tfp pilus assembly protein FimT/FimU | Machinery gene |
| ACM0O0_RS01640 | pilV | 340833..341393 (+) | 561 | WP_373358445.1 | type IV pilus modification protein PilV | Machinery gene |
| ACM0O0_RS01645 | pilW | 341393..342394 (+) | 1002 | WP_416040976.1 | PilW family protein | Machinery gene |
| ACM0O0_RS01650 | pilX | 342391..343200 (+) | 810 | WP_200043398.1 | PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein | Machinery gene |
| ACM0O0_RS01655 | pilY1 | 343212..347066 (+) | 3855 | WP_416040977.1 | PilC/PilY family type IV pilus protein | Machinery gene |
| ACM0O0_RS01660 | pilY2 | 347077..347559 (+) | 483 | WP_087089565.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| ACM0O0_RS01665 | pilE | 347556..347981 (+) | 426 | WP_087089564.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| ACM0O0_RS01670 | rpsP | 348129..348380 (+) | 252 | WP_000260334.1 | 30S ribosomal protein S16 | - |
| ACM0O0_RS01675 | rimM | 348400..348948 (+) | 549 | WP_416040978.1 | ribosome maturation factor RimM | - |
| ACM0O0_RS01680 | trmD | 348991..349746 (+) | 756 | WP_057105812.1 | tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD | - |
| ACM0O0_RS01685 | rplS | 349966..350334 (+) | 369 | WP_002116654.1 | 50S ribosomal protein L19 | - |
| ACM0O0_RS01690 | - | 350387..351328 (-) | 942 | WP_082183535.1 | lipase family alpha/beta hydrolase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1284 a.a. Molecular weight: 138012.51 Da Isoelectric Point: 7.7451
>NTDB_id=1097452 ACM0O0_RS01655 WP_416040977.1 343212..347066(+) (pilY1) [Acinetobacter lactucae isolate nanjing]
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Nucleotide
Download Length: 3855 bp
>NTDB_id=1097452 ACM0O0_RS01655 WP_416040977.1 343212..347066(+) (pilY1) [Acinetobacter lactucae isolate nanjing]
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GGAAATTACAACTGTCTGGAAACGAGAGTGGAACGGGCGAGTGGCAATGTACAAGTCACTTAGTTCCTGCGCGCTGGTAT
GAGCGTTATCGCTAA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| pilY1 | Acinetobacter baumannii D1279779 |
84.264 |
100 |
0.847 |