Detailed information NTG0670340

Bioinformatically predicted

Overview

• Name: pilY1
• Type: Machinery gene
• Locus tag: MP622_RS15565
• Genome accession: NZ_CP094643
• Coordinates: 3300607..3304461 (+)
• Length: 1284 a.a.
• NCBI ID: WP_243791717.1
• Uniprot ID: -
• Organism: Acinetobacter sp. PK01
• Function: assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake

Genomic Context

Location: 3295607..3309461

Locus tag	Gene name	Coordinates (strand)	Size (bp)	Protein ID	Product	Description
MP622_RS15535 (MP622_15535)	gmk	3295863..3296486 (-)	624	WP_016168687.1	guanylate kinase	-
MP622_RS15540 (MP622_15540)	ispH	3296622..3297572 (+)	951	WP_044739679.1	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase	-
MP622_RS15545 (MP622_15545)	-	3297738..3298235 (+)	498	WP_044739678.1	GspH/FimT family pseudopilin	-
MP622_RS15550 (MP622_15550)	pilV	3298235..3298777 (+)	543	WP_243791712.1	type IV pilus modification protein PilV	Machinery gene
MP622_RS15555 (MP622_15555)	pilW	3298779..3299765 (+)	987	WP_243791714.1	PilW family protein	Machinery gene
MP622_RS15560 (MP622_15560)	-	3299762..3300589 (+)	828	WP_243791715.1	hypothetical protein	-
MP622_RS15565 (MP622_15565)	pilY1	3300607..3304461 (+)	3855	WP_243791717.1	PilC/PilY family type IV pilus protein	Machinery gene
MP622_RS15570 (MP622_15570)	-	3304542..3305012 (+)	471	WP_243793563.1	type IV pilin protein	-
MP622_RS15575 (MP622_15575)	comF	3305012..3305455 (+)	444	WP_151504383.1	type IV pilin protein	Machinery gene
MP622_RS15580 (MP622_15580)	rpsP	3305602..3305859 (+)	258	WP_016168678.1	30S ribosomal protein S16	-
MP622_RS15585 (MP622_15585)	rimM	3305885..3306433 (+)	549	WP_151504382.1	ribosome maturation factor RimM	-
MP622_RS15590 (MP622_15590)	trmD	3306461..3307195 (+)	735	WP_151504381.1	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	-
MP622_RS15595 (MP622_15595)	rplS	3307383..3307757 (+)	375	WP_016168675.1	50S ribosomal protein L19	-
MP622_RS15600 (MP622_15600)	-	3307814..3308785 (-)	972	WP_151504380.1	triacylglycerol lipase	-

Sequence

Protein

• Length: 1284 a.a.
• Molecular weight: 136320.84 Da
• Isoelectric Point: 7.2059

>NTDB_id=670340 MP622_RS15565 WP_243791717.1 3300607..3304461(+) (pilY1) [Acinetobacter sp. PK01]
MKPNKFERKDRTQIHTGAVFSVVFTGTLLITSSVVQATDLQIYAKPSAGKKTIVMMLDTSGSMGNSDSGQTGSRLYRLQQ
GMYAFLGSNNPILTDVRVGLGNYSTGGDGQTGNILVPAAPLGDVSTLNTVGSQRYKLKQAVQNLTANSYTPTAHAYAEAA
AYLMGTTTYSEMNYDIRKDSFIKRVRRSNNQTNYSYCTQYRDSGIDYTNLWQSCRSNSYWSSWATSQPSGFVNGVQYDTY
YDGTYDYYYYYVVETKTLYDSNSGMPSSKANDTTSNPGIVVDRTASNANARYKSPLPAVADRVSCDGQGVYVLSDGAANN
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ACKLSSRSQADRAGDDACSPNQGAYSVTYPGYGNGGFFTTQSSTGVTDSVIAFINNLGAAPLEPLTTGAISVPVDSLNPN
GLQPYGYLRALEPNPQSNKVIWAGNLKKYQVLLSGTNAGAFAAANGTTLVYNTDGGFQANTKDLWNSASVYQNESYNDGG
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SQFGTQTTLKDFPLLVKQKLLNYLGYSVPLDETATALPTTLTTPNSPYLAMGGSIHSFPVQLTYSGTLDSAGELTSTRSQ
SVLYGTMDGGLHLVDGETGVEQMVFVPAELLRGTVSSKALVKGQDDTNAPVDGVDGAWVADPAYKTQKAASSSESSMVKA
RQMNIYGGLRMGGSSYYGLDVLTPTSPKLLFRVGPDISNYSRMGQSWSKPVLANIRYNGAIRRVMIVGGGYDQCYENPSF
RLGATVATTDYPDTTCNNKSAAQGNAVYIIDAKTGERIWWASSTGADTNNANMTHSVVSRISALDRDADGLIDHLYFGDL
GGQVFRADLNNSQTLSGSTYSAFGVRVARLANLATDGTTGAALTLGKNPRFYEAPTVTIHDQGATTFILVGLASGNRSTP
LDVYPSVGRDGMLPTTALTDRLVNNVYGIIDRDFIKRNLITGSPTLESQNKTLANLQKNPQLLSGVVASTFIGTSASKDG
WYRSLSSNGAGTERAGGSFRVLGGMKAFEEPMAITGNLIVPVYDPQGTGIAPQNPCLPRVVGETDRQRYCLPFGACLTTS
GAVDITREGGTGFVTKTTGCPAGVAECNDNPIGSGIRGIALVPTGSGTGGPDCESTISTNQGGVGKWECRRIVNPTRWYE
KWVQ

Nucleotide

• Length: 3855 bp

>NTDB_id=670340 MP622_RS15565 WP_243791717.1 3300607..3304461(+) (pilY1) [Acinetobacter sp. PK01]
ATGAAACCAAATAAGTTTGAGCGAAAAGATCGCACCCAAATTCATACTGGTGCTGTATTTTCAGTAGTGTTCACAGGGAC
GTTGCTCATTACGTCATCTGTGGTACAAGCAACAGATTTGCAAATTTACGCTAAGCCAAGTGCGGGTAAAAAAACAATTG
TCATGATGTTGGATACATCAGGATCTATGGGTAATTCAGATTCAGGACAAACAGGCTCACGTTTATACCGTTTGCAACAA
GGGATGTATGCATTTTTGGGAAGTAATAACCCTATTTTGACCGATGTGCGAGTTGGGTTAGGGAATTATTCTACAGGGGG
TGATGGGCAGACAGGTAATATCTTGGTCCCTGCTGCTCCATTAGGTGATGTGAGTACCTTAAATACAGTCGGTTCCCAAC
GATATAAACTTAAACAGGCTGTTCAGAATTTAACGGCAAATAGCTATACACCTACAGCACATGCGTATGCTGAGGCGGCA
GCGTACTTAATGGGAACCACTACATATTCAGAAATGAATTATGATATTCGGAAAGACAGTTTTATTAAGCGAGTCAGAAG
ATCAAATAACCAGACCAATTATAGCTATTGTACCCAGTATCGGGACAGTGGCATCGATTACACAAACTTATGGCAAAGTT
GTAGAAGTAATAGCTATTGGTCAAGTTGGGCTACATCCCAACCGTCAGGTTTTGTTAATGGTGTCCAATATGACACTTAT
TATGATGGTACTTATGACTATTATTATTATTACGTGGTTGAAACAAAAACACTATATGATAGTAACAGTGGTATGCCAAG
CTCCAAGGCGAACGATACAACATCTAATCCGGGAATTGTGGTTGATCGTACTGCTTCAAATGCGAATGCAAGGTATAAAT
CACCATTACCAGCTGTAGCAGACAGAGTCTCATGTGATGGACAAGGGGTTTATGTCTTATCGGATGGTGCAGCGAATAAT
ACTTCAGTAAGTGAAGCAACAAAAATTATGTCTACTGCATTAGGTAGTACCTATGGAGCAGATTTTAGTTGTTCAGGTGG
TTTAACTGGTGGGGGAAGTGATTCTGGTTGGGACTGTATGGGGGAATTTGCTAAGAAGCTCTTTAATGCATCTACCAATC
CAGCAGGTGTTTCTATCCAAACTGCTTTTGTAGGTTTTGGTAATGAAATGAATAGCTTGAGTCAGTCTTATGTGCAGAAT
GCATGTAAGCTAAGTTCACGTTCGCAGGCTGATAGAGCGGGTGACGATGCTTGTTCTCCGAACCAAGGAGCATACTCGGT
AACTTATCCTGGTTATGGTAATGGTGGATTCTTTACAACACAAAGTTCGACAGGGGTAACTGATAGTGTAATTGCCTTTA
TTAATAACTTGGGTGCTGCACCTTTGGAGCCATTAACTACGGGTGCGATTTCAGTGCCAGTGGATAGTTTGAACCCAAAT
GGTTTGCAACCTTATGGTTATTTGCGTGCTTTAGAGCCAAACCCTCAGAGTAATAAAGTTATTTGGGCTGGGAACTTAAA
GAAATATCAAGTTTTGCTTTCTGGTACGAATGCTGGTGCTTTCGCTGCGGCGAATGGTACAACCTTGGTTTATAATACAG
ATGGTGGTTTCCAAGCCAACACCAAGGACTTATGGAACAGTGCAAGTGTTTATCAGAATGAAAGTTATAATGATGGCGGC
ATTATTACTCTAGGTGGTGCTTATTCCAAAGTTCCAATGCCAATTCTAGGGCAATCTCAAAATTTAAGTGTGACCCCAAA
ACAATATGCTTATACAGCAAATGCTAATCAACTACGTCGCTTGTATACCGATGTATCTGCGACTGGGGGAGCTACTTTAA
CGAATGCTGCAAATGGCGCGAGCTTGCTTACTATTCCAAGTGGAACTTTACCCTCTTCTAATATCACAACCTATATTTTG
AGTCAGTTTGGTACCCAAACAACGCTTAAAGATTTCCCATTATTGGTCAAGCAAAAGTTATTAAACTATTTGGGTTATAG
TGTTCCTCTAGACGAGACGGCTACAGCTCTGCCAACCACGTTGACTACTCCAAATTCGCCATATTTAGCAATGGGCGGAA
GTATTCACTCCTTCCCAGTTCAGTTGACTTACTCAGGTACGCTAGACAGTGCTGGAGAATTAACTAGTACCCGAAGTCAA
TCAGTATTGTATGGAACAATGGATGGCGGTTTGCATTTGGTCGATGGTGAAACTGGTGTAGAGCAAATGGTATTTGTTCC
TGCTGAATTATTAAGAGGCACAGTATCATCTAAAGCATTGGTAAAAGGACAAGATGACACCAATGCGCCTGTAGATGGCG
TGGATGGTGCATGGGTGGCAGATCCTGCTTATAAAACTCAAAAAGCTGCATCATCTTCAGAAAGTAGTATGGTTAAAGCA
CGCCAAATGAATATTTATGGCGGGTTACGTATGGGGGGGAGCAGCTATTATGGTTTAGATGTGTTGACCCCTACGAGTCC
GAAGTTATTATTTAGAGTTGGTCCTGATATCTCTAATTACAGTCGAATGGGACAGTCTTGGTCTAAACCAGTATTGGCAA
ATATTCGTTATAACGGCGCAATTCGTCGCGTTATGATTGTTGGTGGGGGCTATGATCAATGTTATGAAAACCCTAGCTTC
CGTTTAGGAGCAACTGTTGCAACAACAGATTATCCTGATACCACTTGTAATAATAAGTCAGCTGCTCAAGGAAATGCAGT
TTATATTATTGATGCAAAAACAGGTGAGCGTATCTGGTGGGCAAGTTCGACTGGTGCAGACACAAATAATGCCAATATGA
CGCACAGTGTGGTAAGCCGCATCAGTGCACTGGATCGTGATGCAGATGGTCTGATTGATCATCTTTATTTCGGTGATTTA
GGTGGGCAAGTCTTTCGTGCTGACTTAAATAATAGCCAAACTTTATCTGGGTCAACTTACAGTGCATTTGGTGTGCGTGT
TGCTCGTTTAGCAAATCTTGCAACGGATGGGACGACTGGTGCGGCATTGACTTTAGGTAAAAATCCACGTTTTTATGAGG
CACCAACCGTAACGATTCATGATCAAGGGGCGACTACATTTATTCTTGTTGGTTTGGCATCCGGTAACCGAAGCACACCA
CTTGATGTTTATCCGAGTGTAGGTCGTGATGGTATGTTACCAACCACAGCCTTGACTGATCGGTTGGTCAATAACGTATA
TGGTATTATTGATCGTGACTTTATTAAGCGTAATTTAATTACAGGTTCTCCAACCTTAGAGTCTCAAAATAAGACCCTCG
CGAATTTGCAAAAAAATCCACAATTATTATCAGGTGTTGTTGCATCTACCTTTATTGGTACAAGTGCAAGTAAAGATGGT
TGGTATCGTTCACTTTCAAGTAATGGAGCTGGTACAGAGCGTGCTGGAGGAAGCTTCCGTGTACTAGGTGGAATGAAGGC
CTTTGAAGAACCAATGGCGATTACGGGAAATCTAATTGTGCCGGTATATGACCCGCAAGGTACGGGTATTGCACCACAAA
ACCCATGTTTACCGCGTGTGGTGGGTGAAACAGACCGTCAAAGGTATTGCTTACCATTTGGTGCATGTTTGACTACGAGC
GGTGCCGTTGATATTACTCGAGAAGGTGGGACAGGATTTGTTACAAAAACGACAGGATGCCCTGCTGGTGTGGCTGAGTG
TAATGATAATCCAATTGGTTCGGGTATTCGTGGTATTGCTTTAGTGCCAACAGGTTCGGGTACAGGTGGACCGGACTGCG
AATCAACTATCAGTACCAATCAGGGAGGGGTGGGTAAATGGGAATGCCGTCGAATTGTCAATCCAACACGGTGGTATGAA
AAATGGGTGCAATAA

Domains

Predicted by InterproScan.

• Neisseria PilC beta-propeller domain (T4P_PilY1) (685-972)

Similar proteins

Only experimentally validated proteins are listed.

Protein	Organism	Identities (%)	Coverage (%)	Ha-value
pilY1	Acinetobacter baumannii D1279779	58.52	100	0.591