Detailed information NTG0491982

Bioinformatically predicted

Overview

• Name: pilY1
• Type: Machinery gene
• Locus tag: IMO23_RS16450
• Genome accession: NZ_CP062919
• Coordinates: 3389505..3393248 (-)
• Length: 1247 a.a.
• NCBI ID: WP_407070926.1
• Uniprot ID: -
• Organism: Acinetobacter baumannii strain Res13-Abat-PEA21-P4-01-A
• Function: assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake

Genomic Context

Location: 3384505..3398248

Locus tag	Gene name	Coordinates (strand)	Size (bp)	Protein ID	Product	Description
IMO23_RS16415 (IMO23_16415)	-	3385266..3386207 (+)	942	WP_085941363.1	triacylglycerol lipase	-
IMO23_RS16420 (IMO23_16420)	rplS	3386260..3386628 (-)	369	WP_000014562.1	50S ribosomal protein L19	-
IMO23_RS16425 (IMO23_16425)	trmD	3386836..3387576 (-)	741	WP_000464598.1	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	-
IMO23_RS16430 (IMO23_16430)	rimM	3387622..3388170 (-)	549	WP_000189236.1	ribosome maturation factor RimM	-
IMO23_RS16435 (IMO23_16435)	rpsP	3388190..3388441 (-)	252	WP_000260334.1	30S ribosomal protein S16	-
IMO23_RS16440 (IMO23_16440)	pilE	3388588..3389013 (-)	426	WP_000788339.1	type IV pilin protein	Machinery gene
IMO23_RS16445 (IMO23_16445)	pilY2	3389010..3389492 (-)	483	WP_109291820.1	type IV pilin protein	Machinery gene
IMO23_RS16450 (IMO23_16450)	pilY1	3389505..3393248 (-)	3744	WP_407070926.1	PilC/PilY family type IV pilus protein	Machinery gene
IMO23_RS16455 (IMO23_16455)	pilX	3393323..3394141 (-)	819	WP_000149374.1	PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein	Machinery gene
IMO23_RS16460 (IMO23_16460)	pilW	3394138..3395139 (-)	1002	WP_000079197.1	PilW family protein	Machinery gene
IMO23_RS16465 (IMO23_16465)	pilV	3395140..3395700 (-)	561	WP_002194578.1	type IV pilus modification protein PilV	Machinery gene
IMO23_RS16470 (IMO23_16470)	fimU	3395694..3396167 (-)	474	WP_109291824.1	Tfp pilus assembly protein FimT/FimU	Machinery gene
IMO23_RS16475 (IMO23_16475)	ispH	3396337..3397287 (-)	951	WP_195707635.1	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase	-
IMO23_RS16480 (IMO23_16480)	gmk	3397410..3398039 (+)	630	WP_000015937.1	guanylate kinase	-

Sequence

Protein

• Length: 1247 a.a.
• Molecular weight: 133033.45 Da
• Isoelectric Point: 7.1392

>NTDB_id=491982 IMO23_RS16450 WP_407070926.1 3389505..3393248(-) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain Res13-Abat-PEA21-P4-01-A]
MIFTWLMTSSVVQASDLQIYASPTAGKKTIVMMLDTSLSMTSNSYGENRLAMLKEGMNAFLASNNPVLNDTRVGLGNFSA
NGDSRSGQILVAAAPLGDASTLNTVGSQRYKLKQAVANLTARGSTPSAHAYAEAAAYLMGTTTLNNINLVDAPIYFSYVT
SDRRGREITNYHACTGWNTEGTTCNGWDSSSLSNPPVITGLQQASCTVNIGWQPLLGTCYKKTGLMTINNLDSGFNKSIS
GSKNTDQSAYNSPLPAVANRQSCDGQGIYFLSDGEPNNTTNTRSASVMSTALGSTFGADFNCSGGLSNTTADSGWACMGE
FAKRLFDKTKNPAGVSIQTAFVGFGSDFSSLSSSDVKNACRLSSRTQSDRKGDDACSPNQSTNAVAAPGYGNGGFFPTQS
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ANSGGLVYNASGAFRTGTKDYWNSSTYTDGGKVFLGGSYANVPLPIAGQPETRDAEGNITKYYYAVQSKIRNLFTDVSAV
AADGSLTKISTSGTNLLKIPAAPPEGTNPFDTVANTASYVLGKFDPSTGQNILKAFPISLKLKILNYLGYSTDINATTLP
PSLVTSNEPYLSMGGSIHSLPVQLTYNGTLDDNGNLTSAREQSILYGTMEGGLHIVDASSGIEQMVFVPADILNDSVASK
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TDYSRMGQSWSKPVLANIRYNGSIRRVLIVGGGYDQCYEKPNITLTDACFTNGKAKGNAVYIIDAKTGQRLWWTSDTGSN
TDNANMKHSIVSRISTLDRDADGLVDHLYFGDLGGQIFRVDLNNNQTKTNSTYSSFGVRVVRLANLATNDSTYDGTNDYT
GGNAPRFYEPPTVTIHDYGIHTFITVGIASGDRSTPLDVYPLTGREGMTPASALSGRPVNNVYGIIDKDFVKKNLMSLTD
NQLETKDITRTGLRKNPQILRTGETRVAQIFFPTTGVGKGGWYRSLSSTSDGTEKANNSFRIKGGLKAFEEPMAITGNLI
IPVYDPQGTGIVAADPCLPRVVGETDRQTYCLPFGACLNPDGTINSNKENPSGFQTKTGSNCPAGVSECNTNVIGAGIRN
ITFVPKRDEPPVTNSCGKLQLSGNENGTGEWQCTSHLLPVRWYERYR

Nucleotide

• Length: 3744 bp

>NTDB_id=491982 IMO23_RS16450 WP_407070926.1 3389505..3393248(-) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain Res13-Abat-PEA21-P4-01-A]
ATGATATTCACATGGCTGATGACAAGCTCTGTGGTGCAGGCAAGTGATTTACAAATTTATGCCTCACCTACAGCAGGTAA
AAAAACAATTGTGATGATGTTGGATACATCATTAAGTATGACCAGCAATAGTTATGGTGAAAACCGTTTGGCTATGCTTA
AAGAGGGTATGAATGCTTTTTTAGCTAGCAATAACCCTGTCTTAAATGATACGCGAGTAGGTTTAGGAAATTTCTCGGCA
AATGGTGATAGCCGAAGTGGACAAATTTTAGTGGCTGCTGCCCCTTTAGGAGATGCGAGTACTTTAAATACGGTAGGCTC
ACAACGTTATAAATTAAAACAAGCTGTTGCTAATTTAACTGCAAGAGGCTCAACACCTTCAGCCCACGCTTATGCTGAAG
CAGCTGCTTACTTAATGGGAACAACGACTTTAAATAATATTAATTTGGTGGATGCACCTATATATTTTTCATATGTAACA
TCTGATCGACGAGGTCGAGAAATAACGAATTATCATGCTTGTACAGGATGGAATACAGAAGGAACAACATGTAATGGTTG
GGATAGTTCATCTTTAAGTAATCCCCCTGTAATAACTGGATTGCAACAAGCCTCATGTACTGTAAATATTGGGTGGCAAC
CGTTATTAGGCACTTGTTATAAAAAAACAGGTTTAATGACAATTAATAATTTAGATAGTGGATTCAATAAATCTATTAGT
GGATCTAAAAATACAGATCAAAGTGCATATAACTCTCCTTTGCCTGCGGTAGCGAATCGCCAGAGTTGTGATGGGCAAGG
TATTTACTTCTTATCGGATGGCGAACCGAACAATACAACAAATACACGTTCGGCAAGTGTTATGTCGACTGCTTTAGGTA
GTACTTTCGGAGCTGATTTTAATTGTTCTGGAGGTTTATCTAATACTACGGCAGACTCTGGTTGGGCTTGTATGGGGGAG
TTTGCAAAAAGATTATTTGATAAAACAAAGAACCCTGCCGGAGTTTCTATTCAAACAGCATTTGTCGGTTTTGGTAGTGA
CTTTTCTAGTTTGAGTTCTTCTGATGTAAAAAATGCCTGCCGTTTAAGTTCGAGAACCCAGTCTGACCGAAAAGGAGATG
ATGCGTGTTCACCGAATCAATCTACAAATGCGGTAGCTGCACCAGGTTATGGGAATGGTGGTTTTTTCCCTACTCAGAGT
TCACAAGGCGTAACAGACAGCGTTATCGCATTTATTAATAATTTAGATAAAGTTCCTTTAGAACCCTTAACCACAGGTGC
TATCTCAGTTCCATATGATGCATTGAATCCCAAAAATTTACAGGAATATGGTTATTTACGAGCTTTTGAGCCAAATCCAG
CTAACACGTACTTAACATGGCGTGGAAATTTAAAGAAATATCATGTTGTTTTATCTGGAGCGAATGCAGGTGCTTTTGAG
GCCAATTCTGGCGGATTAGTCTACAATGCAAGTGGGGCTTTTAGGACTGGAACAAAGGATTATTGGAATAGCTCTACTTA
TACTGACGGAGGCAAAGTCTTTTTAGGTGGTTCATATGCGAATGTACCTTTACCCATTGCTGGACAACCTGAAACACGTG
ATGCAGAAGGGAATATCACAAAATATTATTACGCAGTACAAAGTAAAATCCGCAACTTATTTACTGATGTTTCCGCCGTT
GCAGCAGATGGTAGCTTAACGAAAATTTCAACTTCTGGAACTAATTTGCTAAAAATTCCAGCTGCTCCACCAGAAGGAAC
TAATCCTTTTGATACGGTGGCTAATACAGCAAGTTATGTTTTAGGTAAATTTGATCCATCAACTGGACAAAATATTTTAA
AAGCTTTTCCTATAAGCTTGAAATTAAAAATATTAAATTATTTAGGTTATTCAACAGATATTAATGCAACAACTCTGCCT
CCATCTTTGGTTACATCGAATGAACCTTATTTATCGATGGGGGGAAGTATTCACTCTTTACCGGTTCAACTAACCTACAA
TGGAACACTAGATGATAATGGGAATTTAACATCTGCCCGAGAACAATCCATCCTCTATGGAACTATGGAAGGCGGATTAC
ATATTGTGGATGCTTCATCTGGTATTGAGCAAATGGTCTTTGTTCCTGCAGATATTTTAAATGATTCAGTTGCTTCCAAA
GCTTTAGTTGTTGGTCAAAGTGATGCTTCAGCTCCCGCTCATGGTATGGACGGAGCTTGGGTATCTGATCCAGCCTATAA
TATTACTACAGTGGGAAGTGGTAGCTCGGCAGTATCAAAAGTAACTGCAAAGCAAATGAATATTTATGGCGGCATGCGCA
TGGGGGGAAGTAGCTACTACGGACTAGATGTATTAAGCCCTACTTCACCGAAACTGCTTTTTAGAATAGGGGCAGACCAG
ACTGACTATAGCCGTATGGGGCAAAGCTGGTCTAAACCCGTACTCGCGAACATCCGTTATAACGGTTCTATTAGACGCGT
CCTGATTGTTGGCGGTGGTTATGATCAGTGTTATGAAAAACCAAATATTACGTTGACTGACGCTTGCTTTACCAATGGAA
AAGCAAAAGGAAACGCTGTCTATATTATTGACGCAAAAACTGGTCAGCGTTTGTGGTGGACAAGTGATACAGGTTCTAAT
ACTGATAACGCCAATATGAAGCATAGTATTGTTAGCCGTATTAGTACTTTAGACCGTGATGCTGATGGCTTAGTCGACCA
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GCAGTTTTGGTGTCAGAGTTGTGCGTTTAGCGAATTTAGCAACAAATGATTCAACTTATGATGGCACAAATGATTATACA
GGTGGGAATGCTCCTCGTTTTTATGAGCCCCCAACAGTAACGATCCACGATTATGGAATTCACACTTTTATTACAGTAGG
TATTGCATCAGGAGACCGTAGTACACCTTTAGACGTTTACCCACTCACAGGTCGTGAAGGTATGACGCCTGCAAGTGCAT
TAAGTGGACGTCCTGTAAATAATGTATATGGAATTATTGATAAAGACTTTGTTAAAAAGAACTTAATGTCTTTAACTGAT
AATCAGCTTGAAACAAAAGATATTACACGGACAGGCTTAAGAAAAAATCCACAAATTCTAAGAACAGGTGAAACAAGAGT
AGCTCAAATTTTCTTCCCCACTACAGGAGTAGGTAAAGGTGGTTGGTATCGCTCGCTTTCTAGTACGAGCGATGGTACAG
AAAAAGCTAATAATAGTTTTCGTATTAAAGGAGGACTCAAAGCTTTTGAGGAACCAATGGCAATTACGGGTAATTTAATT
ATTCCAGTTTATGACCCTCAAGGAACGGGAATTGTTGCGGCAGATCCTTGTCTACCTCGTGTTGTGGGAGAAACAGACCG
ACAAACTTATTGTTTACCATTTGGTGCTTGTCTTAATCCGGATGGAACCATTAATTCAAATAAAGAAAACCCGAGCGGGT
TTCAAACAAAAACTGGTAGTAACTGTCCAGCTGGAGTCTCTGAATGTAATACAAATGTCATTGGTGCAGGTATTCGTAAT
ATCACATTTGTTCCAAAAAGAGATGAACCTCCTGTGACTAATAGTTGTGGGAAATTACAGCTGTCTGGAAACGAGAACGG
AACAGGTGAGTGGCAATGTACAAGTCATTTACTTCCTGTGCGCTGGTATGAGCGCTATCGCTAG

Domains

Predicted by InterproScan.

• Neisseria PilC beta-propeller domain (T4P_PilY1) (678-927)

• von Willebrand factor type A domain (VWA_2) (30-136)

Similar proteins

Only experimentally validated proteins are listed.

Protein	Organism	Identities (%)	Coverage (%)	Ha-value
pilY1	Acinetobacter baumannii D1279779	94.868	100	0.949