Detailed information
Overview
| Name | pilY1 | Type | Machinery gene |
| Locus tag | ACEN3H_RS01795 | Genome accession | NZ_CP168231 |
| Coordinates | 376763..380617 (+) | Length | 1284 a.a. |
| NCBI ID | WP_373358448.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter lactucae strain 2024CK-01095 | ||
| Function | assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake |
||
Genomic Context
Location: 371763..385617
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ACEN3H_RS01765 (ACEN3H_01765) | gmk | 372044..372673 (-) | 630 | WP_002116973.1 | guanylate kinase | - |
| ACEN3H_RS01770 (ACEN3H_01770) | ispH | 372796..373746 (+) | 951 | WP_373358443.1 | 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase | - |
| ACEN3H_RS01775 (ACEN3H_01775) | fimU | 373917..374390 (+) | 474 | WP_373358444.1 | Tfp pilus assembly protein FimT/FimU | Machinery gene |
| ACEN3H_RS01780 (ACEN3H_01780) | pilV | 374384..374944 (+) | 561 | WP_373358445.1 | type IV pilus modification protein PilV | Machinery gene |
| ACEN3H_RS01785 (ACEN3H_01785) | pilW | 374944..375945 (+) | 1002 | WP_373358446.1 | PilW family protein | Machinery gene |
| ACEN3H_RS01790 (ACEN3H_01790) | pilX | 375942..376751 (+) | 810 | WP_373358447.1 | PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein | Machinery gene |
| ACEN3H_RS01795 (ACEN3H_01795) | pilY1 | 376763..380617 (+) | 3855 | WP_373358448.1 | PilC/PilY family type IV pilus protein | Machinery gene |
| ACEN3H_RS01800 (ACEN3H_01800) | pilY2 | 380628..381110 (+) | 483 | WP_373358449.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| ACEN3H_RS01805 (ACEN3H_01805) | pilE | 381107..381532 (+) | 426 | WP_005078455.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| ACEN3H_RS01810 (ACEN3H_01810) | rpsP | 381680..381931 (+) | 252 | WP_000260334.1 | 30S ribosomal protein S16 | - |
| ACEN3H_RS01815 (ACEN3H_01815) | rimM | 381951..382499 (+) | 549 | WP_002116736.1 | ribosome maturation factor RimM | - |
| ACEN3H_RS01820 (ACEN3H_01820) | trmD | 382542..383297 (+) | 756 | WP_057105812.1 | tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD | - |
| ACEN3H_RS01825 (ACEN3H_01825) | rplS | 383517..383885 (+) | 369 | WP_002116654.1 | 50S ribosomal protein L19 | - |
| ACEN3H_RS01830 (ACEN3H_01830) | - | 383937..384878 (-) | 942 | WP_080648732.1 | triacylglycerol lipase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1284 a.a. Molecular weight: 138083.59 Da Isoelectric Point: 7.7452
>NTDB_id=1043306 ACEN3H_RS01795 WP_373358448.1 376763..380617(+) (pilY1) [Acinetobacter lactucae strain 2024CK-01095]
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Nucleotide
Download Length: 3855 bp
>NTDB_id=1043306 ACEN3H_RS01795 WP_373358448.1 376763..380617(+) (pilY1) [Acinetobacter lactucae strain 2024CK-01095]
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GAGCGTTATCGCTAA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| pilY1 | Acinetobacter baumannii D1279779 |
84.884 |
100 |
0.853 |