Detailed information NTG0997646

Bioinformatically predicted

Overview

• Name: pilY1
• Type: Machinery gene
• Locus tag: ABER85_RS09735
• Genome accession: NZ_CP155547
• Coordinates: 1993062..1996868 (-)
• Length: 1268 a.a.
• NCBI ID: WP_272235813.1
• Uniprot ID: -
• Organism: Acinetobacter sp. 8_A20231192
• Function: assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake

Genomic Context

Location: 1988062..2001868

Locus tag	Gene name	Coordinates (strand)	Size (bp)	Protein ID	Product	Description
ABER85_RS09700 (ABER85_09700)	-	1988825..1989766 (+)	942	WP_346535267.1	triacylglycerol lipase	-
ABER85_RS09705 (ABER85_09705)	rplS	1989819..1990187 (-)	369	WP_000014562.1	50S ribosomal protein L19	-
ABER85_RS09710 (ABER85_09710)	trmD	1990395..1991135 (-)	741	WP_000464598.1	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	-
ABER85_RS09715 (ABER85_09715)	rimM	1991181..1991729 (-)	549	WP_000189236.1	ribosome maturation factor RimM	-
ABER85_RS09720 (ABER85_09720)	rpsP	1991749..1992000 (-)	252	WP_000260334.1	30S ribosomal protein S16	-
ABER85_RS09725 (ABER85_09725)	pilE	1992147..1992572 (-)	426	WP_000788345.1	type IV pilin protein	Machinery gene
ABER85_RS09730 (ABER85_09730)	pilY2	1992569..1993051 (-)	483	WP_001046490.1	type IV pilin protein	Machinery gene
ABER85_RS09735 (ABER85_09735)	pilY1	1993062..1996868 (-)	3807	WP_272235813.1	PilC/PilY family type IV pilus protein	Machinery gene
ABER85_RS09740 (ABER85_09740)	pilX	1996880..1997698 (-)	819	WP_247791466.1	PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein	Machinery gene
ABER85_RS09745 (ABER85_09745)	pilW	1997695..1998696 (-)	1002	WP_272235812.1	PilW family protein	Machinery gene
ABER85_RS09750 (ABER85_09750)	pilV	1998697..1999257 (-)	561	WP_247791464.1	type IV pilus modification protein PilV	Machinery gene
ABER85_RS09755 (ABER85_09755)	fimU	1999251..1999724 (-)	474	WP_346534468.1	GspH/FimT family pseudopilin	Machinery gene
ABER85_RS09760 (ABER85_09760)	ispH	1999894..2000844 (-)	951	WP_000407064.1	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase	-
ABER85_RS09765 (ABER85_09765)	gmk	2000967..2001596 (+)	630	WP_000015937.1	guanylate kinase	-

Sequence

Protein

• Length: 1268 a.a.
• Molecular weight: 135815.62 Da
• Isoelectric Point: 7.4603

>NTDB_id=997646 ABER85_RS09735 WP_272235813.1 1993062..1996868(-) (pilY1) [Acinetobacter sp. 8_A20231192]
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GTTTLKNINLVDAPIYFSYVTYDRRGRVITNYHACTEWNTEGTICNSWDSSSLSNPPVISGLQQASCTANIGWQLLSGTC
YKKTGLITINNLDSGFNKSISGSKNTDQSQYNSPLPAVANRQSCDGQGIYFLSDGEPNKTTDTRSASIMSTALGSTFGAD
FNCSGGLSNTTADSGWACMGEFAKRLFDKTKNPAGVSIQTAFVGFGSDFSSLSSSDVKNACRLSSRTQFDRGGDDLCSPN
QTTNAITAPGYGNGGFFSTQSAQGVTDSVIAFINNLDKVPLEPLTTGAISVPYDALNPKNLQEYGYLRAFEPNPANTYLT
WRGNLKKYHVVLSGTNAGAFEANTGGLVYNATGAFRTGTKDYWNSSTYNDGGKVFFGGSYAKVPLPIAGQNETRDAEGNI
TKYYYAVQSKIRNLFTDVSAVAADGSLTKISTSGTNLLKIPAAPPEGTNPFDTVANTASYVLGKFDPSTGQNILKAFPIS
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VYIIDAKTGQRLWWTSDTGSNTDNANMKHSIVSRISTLDRDADGLVDHLYFGDLGGQIFRVDLNNNQTKTNSTYSSFGVR
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NNVYGIIDRDFVKKNLMSLTDNQLETKDITRTGLRKNPQILRTGETRVAQIFFPTTGVGKGGWYRSLSSTSDGTEKANNS
FRIKGGLKAFEEPMAITGNLIIPVYDPQGTGIVAADPCLPRVVGETDRQTYCLPFGACLNSDGSIDQNKENHSGFETQTG
TNCPVGASECNKNVIGSGIRSVTFVPTEDNPPMTNSCGKLKLSGNEQGTGQWQCTSHLVPTRWYERYR

Nucleotide

• Length: 3807 bp

>NTDB_id=997646 ABER85_RS09735 WP_272235813.1 1993062..1996868(-) (pilY1) [Acinetobacter sp. 8_A20231192]
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AATGACAAGCTCCGTTGTGCAGGCGAGTGATTTACAAATTTATGCTTCACCTACAGCAGGTAAAAAAACTATTGTGATGA
TGTTGGATACATCAGGAAGTATGACCAACAATAGTTATGGTGAAAACCGTCTGGCTATGCTTAAAAATGGTATGAATGCT
TTTTTAGCAAGTAACAACCCAGTTTTAAATGATACTCGTGTAGGATTGGGAAATTTCTCTGCAGATGGTGATAGTCGAAG
TGGGCAAATTTTGGTGGCTGCTGCTCCTTTAGGAGATGCAAGTACTTTAAATACAATGGGTTCTCAGCGTTATAAATTAA
AGCAAGCAGTTGCTAGCTTAACTGCAAGTGGATATACCCCTTCAGCACATGCTTATGCAGAAGCCGCTGCTTATTTGATG
GGAACAACGACTTTAAAAAATATTAATTTGGTGGATGCACCTATATATTTTTCATATGTAACGTATGATCGACGAGGTCG
AGTAATAACGAATTATCATGCTTGTACAGAATGGAATACAGAAGGAACAATATGTAATAGTTGGGATAGTTCATCTTTAA
GTAATCCCCCTGTAATAAGTGGATTGCAACAAGCCTCATGTACTGCAAATATTGGGTGGCAATTGTTATCAGGTACCTGT
TATAAAAAAACAGGTTTAATAACAATTAATAATTTAGATAGCGGATTCAATAAATCTATTAGTGGATCTAAAAATACAGA
TCAAAGTCAATATAACTCTCCTTTGCCAGCGGTAGCTAATCGTCAAAGCTGTGATGGGCAGGGTATTTATTTTTTGTCAG
ATGGTGAGCCGAATAAAACCACAGATACACGTTCAGCAAGTATCATGTCGACTGCTTTAGGTAGTACTTTTGGAGCTGAT
TTTAATTGTTCTGGAGGTTTGTCTAACACGACAGCAGACTCTGGTTGGGCCTGTATGGGGGAGTTTGCAAAACGACTATT
TGATAAAACAAAGAATCCTGCTGGAGTTTCTATTCAAACCGCATTTGTTGGTTTTGGTAGTGATTTTTCTAGTTTAAGTT
CTTCTGATGTAAAAAATGCCTGTCGTCTGAGTTCGAGAACCCAATTTGACCGTGGGGGGGATGATCTATGTTCGCCAAAT
CAAACTACAAATGCGATTACAGCACCTGGCTATGGGAATGGTGGCTTTTTTTCAACTCAAAGTGCGCAAGGTGTAACAGA
TAGTGTTATCGCATTTATTAATAACTTAGATAAAGTTCCTTTAGAACCCTTAACCACAGGTGCTATCTCTGTTCCTTATG
ATGCACTAAATCCTAAAAATTTACAGGAATATGGTTACTTACGTGCTTTTGAGCCAAACCCGGCTAACACCTACTTAACA
TGGCGTGGAAATTTAAAGAAATATCATGTTGTTTTATCGGGAACAAATGCTGGTGCTTTTGAAGCTAATACTGGTGGGTT
GGTTTACAACGCAACTGGGGCATTTAGAACGGGTACGAAAGATTATTGGAATAGCTCTACTTATAATGATGGAGGTAAAG
TCTTTTTTGGTGGTTCATATGCAAAAGTTCCTTTACCAATTGCTGGACAAAATGAAACACGTGATGCAGAAGGAAATATT
ACAAAATATTATTACGCAGTACAAAGTAAAATCCGCAACTTATTTACTGATGTTTCCGCCGTTGCAGCAGATGGTAGCTT
AACGAAAATTTCAACTTCTGGAACTAATTTGCTAAAAATTCCAGCTGCTCCACCAGAAGGAACTAATCCTTTTGATACGG
TGGCTAATACAGCAAGTTATGTTTTAGGTAAATTTGATCCATCAACTGGACAAAATATTTTAAAAGCTTTTCCTATAAGC
TTGAAATTAAAAATATTAAATTATTTAGGTTATTCAACAGATATTAGTGCAACAACTCTGCCTTCATCTTTGGTTACATC
GAATGAACCTTATTTATCGATGGGGGGAAGTATTCACTCTTTACCGGTTCAACTAACCTACAATGGAACACTAGATGATA
ATGGGAATTTAACATCTGCCCGAGAACAATCCATCCTCTATGGAACCATGGAAGGCGGGTTACATATTGTGGATGCTTCA
TCTGGTATTGAGCAAATGGTCTTTGTTCCTGCAGATATTTTAAATGATTCAGTTGCTTCCAAAGCTTTAGTTGTTGGTCA
AAGTGATGCTTCAGCTCCCGCTCATGGTATGGACGGAGCTTGGGTATCTGATCCAGCCTATAATATTACTACAGTGGGAA
GTGGTAGCTCGGCAGTATCAAAAGTAACTGCAAAGCAAATGAATATTTATGGCGGCATGCGTATGGGAGGAAGTAGCTAC
TACGGACTAGATGTATTAAGCCCTACTTCACCGAAACTGCTTTTTAGAATAGGGGCAGACCAGACTGACTATAGCCGTAT
GGGTCAAAGCTGGTCTAAACCCGTACTCGCGAACATCCGTTATAACGGTTCTATTAGACGTGTCCTGATTGTTGGCGGTG
GTTATGATCAGTGTTATGAAAAACCAAATATTACGTTGACTGACGCTTGCTTTACCAATGGAAAAGCAAAAGGAAATGCT
GTCTATATTATTGACGCAAAAACTGGTCAGCGTTTATGGTGGACAAGTGATACAGGCTCTAATACTGATAACGCCAATAT
GAAGCATAGTATTGTTAGCCGTATTAGTACTTTAGACCGTGATGCTGATGGCTTAGTCGACCATCTATATTTTGGAGATT
TAGGCGGACAAATTTTTCGCGTGGACCTTAATAATAATCAGACAAAAACCAATTCGACCTATAGCAGTTTTGGTGTCAGA
GTTGTGCGTTTAGCGAATTTAGCAACAAATGATTCAACTTATGATGGCACAAATGATTATACAGGTGGGAATGCTCCTCG
TTTTTATGAGCCTCCAACAGTAACGATCCACGATTATGGAATTCACACTTTTATTACAGTAGGCATTGCTTCAGGGGACC
GTAGTACACCTTTAGATGTTTACCCACTCACAGGTCGTGAAGGTATGACGCCTGCAAGTGCATTAAGTGGACGTCCTGTA
AATAATGTATATGGAATTATTGATAGAGACTTTGTTAAAAAGAACTTAATGTCTTTAACTGATAATCAGCTTGAAACAAA
AGATATTACACGGACAGGCTTAAGAAAAAATCCACAAATTCTAAGAACAGGTGAAACAAGAGTAGCTCAAATTTTCTTCC
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TTTCGTATTAAAGGAGGACTCAAAGCTTTTGAGGAACCAATGGCAATTACGGGTAATTTAATTATTCCAGTTTATGACCC
TCAAGGAACGGGAATTGTTGCGGCAGATCCTTGCCTACCTCGTGTTGTGGGAGAAACAGACCGACAAACTTATTGTTTAC
CATTTGGAGCTTGTCTTAATTCTGATGGGTCAATCGATCAAAATAAAGAGAATCACAGTGGGTTTGAAACACAAACTGGT
ACTAATTGCCCAGTAGGGGCTTCTGAATGTAATAAAAACGTTATTGGCTCTGGTATTCGTAGCGTAACATTTGTACCAAC
GGAGGATAACCCACCTATGACTAATAGTTGTGGGAAATTAAAGCTGTCTGGTAATGAGCAAGGGACTGGACAGTGGCAAT
GTACGAGTCATTTAGTTCCTACGCGTTGGTATGAGCGTTATCGTTAA

Domains

Predicted by InterproScan.

• Neisseria PilC beta-propeller domain (T4P_PilY1) (699-948)

• von Willebrand factor type A domain (VWA_2) (51-102)

Similar proteins

Only experimentally validated proteins are listed.

Protein	Organism	Identities (%)	Coverage (%)	Ha-value
pilY1	Acinetobacter baumannii D1279779	99.606	100	0.996