Detailed information
Overview
| Name | pilY1 | Type | Machinery gene |
| Locus tag | K6I41_RS01670 | Genome accession | NZ_CP082274 |
| Coordinates | 356351..360205 (+) | Length | 1284 a.a. |
| NCBI ID | WP_250375095.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter sp. AS23 | ||
| Function | assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake |
||
Genomic Context
Location: 351351..365205
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| K6I41_RS01640 (K6I41_01640) | gmk | 351629..352258 (-) | 630 | WP_004789787.1 | guanylate kinase | - |
| K6I41_RS01645 (K6I41_01645) | ispH | 352381..353331 (+) | 951 | WP_013196710.1 | 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase | - |
| K6I41_RS01650 (K6I41_01650) | fimU | 353502..353975 (+) | 474 | WP_192454566.1 | GspH/FimT family pseudopilin | Machinery gene |
| K6I41_RS01655 (K6I41_01655) | pilV | 353969..354529 (+) | 561 | WP_250375093.1 | type IV pilus modification protein PilV | Machinery gene |
| K6I41_RS01660 (K6I41_01660) | pilW | 354529..355533 (+) | 1005 | WP_250375094.1 | PilW family protein | Machinery gene |
| K6I41_RS01665 (K6I41_01665) | pilX | 355530..356339 (+) | 810 | WP_216070609.1 | PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein | Machinery gene |
| K6I41_RS01670 (K6I41_01670) | pilY1 | 356351..360205 (+) | 3855 | WP_250375095.1 | PilC/PilY family type IV pilus protein | Machinery gene |
| K6I41_RS01675 (K6I41_01675) | pilY2 | 360218..360700 (+) | 483 | WP_111855056.1 | prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein | Machinery gene |
| K6I41_RS01680 (K6I41_01680) | pilE | 360697..361122 (+) | 426 | WP_250375096.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| K6I41_RS01685 (K6I41_01685) | rpsP | 361270..361521 (+) | 252 | WP_000260334.1 | 30S ribosomal protein S16 | - |
| K6I41_RS01690 (K6I41_01690) | rimM | 361542..362090 (+) | 549 | WP_198307888.1 | ribosome maturation factor RimM | - |
| K6I41_RS01695 (K6I41_01695) | trmD | 362133..362888 (+) | 756 | WP_151768238.1 | tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD | - |
| K6I41_RS01700 (K6I41_01700) | rplS | 363108..363476 (+) | 369 | WP_004789772.1 | 50S ribosomal protein L19 | - |
| K6I41_RS01705 (K6I41_01705) | - | 363530..364471 (-) | 942 | WP_192836324.1 | triacylglycerol lipase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1284 a.a. Molecular weight: 137756.92 Da Isoelectric Point: 7.5993
>NTDB_id=600749 K6I41_RS01670 WP_250375095.1 356351..360205(+) (pilY1) [Acinetobacter sp. AS23]
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Nucleotide
Download Length: 3855 bp
>NTDB_id=600749 K6I41_RS01670 WP_250375095.1 356351..360205(+) (pilY1) [Acinetobacter sp. AS23]
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GAGCGTTATCGCTAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| pilY1 | Acinetobacter baumannii D1279779 |
83.566 |
100 |
0.84 |