Detailed information NTG0483658

Bioinformatically predicted

Overview

• Name: pilY1
• Type: Machinery gene
• Locus tag: IC781_RS16775
• Genome accession: NZ_CP061626
• Coordinates: 3539441..3543625 (-)
• Length: 1394 a.a.
• NCBI ID: WP_191010542.1
• Uniprot ID: -
• Organism: Acinetobacter seifertii strain AS48
• Function: assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake

Genomic Context

Location: 3534441..3548625

Locus tag	Gene name	Coordinates (strand)	Size (bp)	Protein ID	Product	Description
IC781_RS16740 (IC781_16740)	-	3535175..3536116 (+)	942	WP_191011548.1	lipase family alpha/beta hydrolase	-
IC781_RS16745 (IC781_16745)	rplS	3536169..3536537 (-)	369	WP_002116654.1	50S ribosomal protein L19	-
IC781_RS16750 (IC781_16750)	trmD	3536757..3537512 (-)	756	WP_191010539.1	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	-
IC781_RS16755 (IC781_16755)	rimM	3537558..3538106 (-)	549	WP_191010540.1	ribosome maturation factor RimM	-
IC781_RS16760 (IC781_16760)	rpsP	3538126..3538377 (-)	252	WP_000260334.1	30S ribosomal protein S16	-
IC781_RS16765 (IC781_16765)	pilE	3538524..3538949 (-)	426	WP_191010541.1	type IV pilin protein	Machinery gene
IC781_RS16770 (IC781_16770)	pilY2	3538946..3539428 (-)	483	WP_004884685.1	type IV pilin protein	Machinery gene
IC781_RS16775 (IC781_16775)	pilY1	3539441..3543625 (-)	4185	WP_191010542.1	PilC/PilY family type IV pilus protein	Machinery gene
IC781_RS16780 (IC781_16780)	pilX	3543625..3544440 (-)	816	WP_191010543.1	PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein	Machinery gene
IC781_RS16785 (IC781_16785)	pilW	3544437..3545435 (-)	999	WP_191010544.1	PilW family protein	Machinery gene
IC781_RS16790 (IC781_16790)	pilV	3545435..3545995 (-)	561	WP_134262473.1	type IV pilus modification protein PilV	Machinery gene
IC781_RS16795 (IC781_16795)	fimU	3545989..3546462 (-)	474	WP_191010545.1	Tfp pilus assembly protein FimT/FimU	Machinery gene
IC781_RS16800 (IC781_16800)	ispH	3546629..3547579 (-)	951	WP_004705229.1	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase	-
IC781_RS16805 (IC781_16805)	gmk	3547702..3548331 (+)	630	WP_191001035.1	guanylate kinase	-

Sequence

Protein

• Length: 1394 a.a.
• Molecular weight: 149338.47 Da
• Isoelectric Point: 7.2175

>NTDB_id=483658 IC781_RS16775 WP_191010542.1 3539441..3543625(-) (pilY1) [Acinetobacter seifertii strain AS48]
MGNIMKLHFKPNKLWYAIYSTSMTFTCLMTSSVVQASDLQIYASPTAGKKTIVMMLDTSGSMGRTIQSGYSIYDDYGITS
CSTTYVNSTTTPSYRRYYCGVSSNTTNSKVTNLSTGCEKQADNSYRCYDRLTRLKDGMFSFLENNNPIFNNVSVGLGHFS
TYSSGTTGDNNSGEILVPAANLGIVGSAQRVALKNAVAGLEASGGTPTANAFAEAAAYLMGTRTLSSTIANVAMYFKYYP
VLTQTSQTVYYACGNTSASGSTDNTKCTYTPTTIPSQSNLSNYSSNTTSSTNGNITTYTTYYYKTTGWFYPTTTYYYKTT
YSETKVTSSTPNYQSCTAYNSNGCTTWSAASLTNPTTDTYDTQCTINTVSGTCVYQTKTILGTNSYSGFNSSVQSSKDPD
TNYTTYKSPLPPVTQRQSCDGQGVYILSDGEPTNNVNSSVLASALNLSSFSNSGGLSGGTNWDYMSNFAKALFNGGLIQS
DANNATNPANVSIQTAFVGFGSALNALSTTDAKNACKMSSRTQIDRSGDDACSPNQGTNAVSAPGYGNGGFFPTQSAQGV
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NMKHSIVSRISTLDRDGDGLVDHLYFGDLGGQVFRVDLNNNQTQTNSTYSSFGIRVVRLANLATNDTTNDSGNDYTAGNA
PRFYEPPTVTIHDYGVRSFITVGIASGDRSTPLDVYPIIGREGMSPSTALSGRPVNNVYGIIDRDFIKKNLMSLSDSQLE
TKDLIRSNLRKNPQILRAGETSVGQVFFPSTGTGQAGWYRSLSSTSNGTEKADNSFRIKGGMKAFEEPIAITGNLIVPVY
DPQGTGIVASDPCLPRVVGETDRQTYCLPFGVCLNTDGSINHNKEDNSGFGTDGTKNLNVIGSGVRNITFVPSEDNPSPQ
NSCGKLKLSGNEQGTGQWQCTSYLIPARWYERYR

Nucleotide

• Length: 4185 bp

>NTDB_id=483658 IC781_RS16775 WP_191010542.1 3539441..3543625(-) (pilY1) [Acinetobacter seifertii strain AS48]
ATGGGGAATATCATGAAACTACATTTCAAACCAAATAAATTATGGTATGCCATCTATTCAACTTCGATGACATTTACATG
TCTTATGACAAGTTCTGTAGTGCAGGCAAGTGATTTACAAATTTATGCTTCACCTACAGCAGGTAAAAAAACGATTGTCA
TGATGCTAGATACTTCTGGATCAATGGGACGTACGATCCAGTCTGGTTATAGTATTTATGATGATTATGGTATTACAAGT
TGTTCAACTACTTATGTAAACTCAACAACTACTCCCAGTTATCGTCGATATTATTGCGGGGTTTCCTCAAATACCACTAA
TAGCAAAGTAACTAATTTATCAACCGGATGTGAGAAACAGGCAGATAATAGTTATCGTTGCTATGACCGATTAACGCGTC
TGAAAGATGGTATGTTTTCTTTTTTAGAAAATAATAATCCTATATTTAATAATGTAAGTGTTGGATTGGGACATTTCTCT
ACATATAGCAGTGGCACTACTGGAGATAATAATAGTGGTGAAATTTTAGTTCCAGCAGCAAATTTGGGTATTGTCGGATC
TGCTCAACGAGTTGCATTAAAAAATGCTGTAGCTGGATTAGAAGCAAGTGGTGGTACCCCTACAGCGAATGCTTTTGCTG
AGGCTGCAGCTTACTTAATGGGAACACGAACATTAAGCTCGACTATAGCAAACGTGGCAATGTATTTTAAATATTATCCA
GTTTTAACTCAGACGTCACAAACCGTTTATTATGCCTGTGGTAATACTTCAGCTAGTGGTTCAACAGATAATACAAAGTG
TACATATACGCCGACCACAATCCCAAGCCAGTCTAATTTATCTAACTATAGTAGTAATACTACAAGCTCAACAAATGGAA
ATATAACGACTTACACCACTTATTATTATAAAACGACTGGATGGTTTTATCCCACAACGACCTATTACTATAAAACTACT
TATAGTGAAACTAAAGTAACCAGTTCAACACCTAATTATCAAAGCTGTACAGCATATAACTCTAATGGCTGTACTACTTG
GAGTGCCGCTTCTTTAACTAATCCAACAACAGATACCTATGATACGCAATGTACAATTAATACAGTGTCTGGTACATGTG
TCTATCAAACTAAAACAATTTTAGGTACAAACAGTTATAGTGGGTTTAATAGTTCTGTTCAAAGTTCAAAAGATCCAGAT
ACCAATTACACTACATATAAATCACCATTACCTCCCGTTACTCAGCGTCAAAGTTGTGATGGACAAGGGGTTTATATTTT
GTCTGATGGTGAACCAACGAATAACGTAAACTCTTCTGTTTTAGCCTCTGCCTTGAACCTTAGTTCGTTTAGTAATAGTG
GTGGACTGAGCGGTGGTACAAACTGGGATTATATGAGTAACTTCGCTAAAGCCTTGTTTAATGGCGGGCTAATTCAAAGT
GATGCTAATAATGCTACAAACCCAGCTAATGTATCTATACAAACTGCTTTTGTTGGTTTTGGTTCAGCTTTAAATGCCTT
AAGCACTACAGATGCGAAAAACGCTTGTAAAATGAGTTCTCGTACTCAAATAGATAGAAGCGGAGATGATGCATGCTCTC
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ACCGATAGCGTTATTGCATTTATTAATAACTTAGGGAAAGTACCTTTAGAGCCTCTTACTACTGGAGCGATTTCTGTACC
TTATGATGCATTGAATCCTAAAAACCTACAGGAATATGGTTATTTACGAGCTTTTGAGCCAGATCCGGCAAATTCTTATT
TGACTTGGCGAGGTAACTTAAAAAAATATCATGTGATTTTATCTGGTTCAAATGCTGGTGCATTTGAAGCGAACTCTGGT
GGGCTGGTCTATGATGCAAATGGAGCATTCCGTAGTGGTACAAAAGATTATTGGAATAGCTCTAGTTATAATGATGGCGG
AAAAGTTTTCTTAGGAGGAGCCTATAGCAATGTACCATTACCAACTTTAGGTCAGGCAGAAGAGGTAAATTCTCAAGGTA
ATATTACTAAATATTATTATGCAGCAAAAAATAAAATCCGAAATCTATTTACTGATGTTTCTACCGTGGCTGCAGATGGT
AGTTTAACTAAAATATCAACTACAAATATTAATTTACTGAAAATTCCTGCTGCGCCTGCTGTAAATACAAATCCTTTTGA
TACACCAGCAAATACTGCAAGTTATGTGCTAGGAAAATTTAATAGCTCTACGGGACAAGATGTGTTGAAGGCATTTCCTG
TGAGCTTAAAATTAAAATTATTAAATTACTTGGGTTATCCGACAGATATTACGGCGACAGCTCTACCAAGCACATTAACC
ACATCAAATGCCCCTTATTTATCGATGGGCGGGAGTATCCACTCTTTTCCGGTACAGCTGACTTATAGTGGTACTTTAGA
TCAAAACGGAAATTTAACCAGTGCACGTGAGCAATCTATTCTTTACGGAAGTATGGAAGGCGGATTGCATATCGTAGATG
CCTCTACTGGGGTTGAGCAAATGGTATTTATCCCAGCCGATATATTAAATGATACGGTGGCGTCTAAAGCTTTAGTGGTA
GGGCAAAGTGATTCAACAGCCCCTGCTCAAGGTATGGATGGAGCATGGGTATCGGACCCAGCATATAACATTACCACTAC
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GCTATTATGGATTAAATGTATTAAATCCAAGTTCCCCACAATTAATGTTTAGAATAGGTGCAGATCAATCTGACTATAGC
CGTATGGGGCAAAGCTGGTCTAAGCCCGTACTTGCAAATATTCGTTATAACGGTGCGATTAGACGTGTCATGATTGTTGG
CGGTGGTTATGATCAATGTTACGAGAAACCAAATATCACGTTGAGTGACTCATGCTTTAGTAATGGTAAGGCAAAAGGAA
ATGCTGTCTATATTATCGATGCTAAAACCGGAGAGCGTTTATGGTGGGCCAGTGATACAGGTTCAAATAATGATAACGCT
AATATGAAGCATAGTATTGTTAGCCGTATTAGTACTTTGGATCGAGATGGTGATGGTTTAGTAGATCATTTGTATTTTGG
CGATTTAGGCGGACAAGTCTTTCGTGTAGATCTTAATAATAATCAGACTCAAACTAACTCGACTTATAGTAGTTTCGGTA
TACGAGTTGTGAGATTGGCAAATCTGGCAACAAACGATACAACAAATGATAGTGGAAATGATTACACAGCTGGAAATGCC
CCTCGTTTTTATGAGCCGCCTACCGTAACAATTCATGATTATGGTGTTCGCTCATTTATTACTGTTGGTATCGCTTCTGG
TGATCGAAGTACACCACTAGATGTTTATCCAATTATTGGCCGGGAAGGTATGTCTCCTAGTACGGCGCTTAGTGGTCGAC
CTGTAAATAATGTTTATGGAATTATTGATAGAGACTTTATAAAAAAGAATTTAATGTCGTTAAGTGATAGTCAGCTTGAA
ACTAAGGATCTTATTCGCTCAAATCTGCGGAAAAACCCACAAATATTAAGAGCAGGCGAAACGAGCGTAGGGCAGGTTTT
CTTTCCAAGTACGGGTACAGGTCAGGCAGGTTGGTACCGATCACTTTCTAGTACGAGTAATGGTACTGAAAAAGCTGATA
ATAGCTTCCGTATTAAAGGGGGAATGAAAGCCTTTGAAGAACCAATAGCAATTACAGGTAATTTAATCGTTCCTGTCTAT
GATCCTCAAGGAACAGGTATTGTTGCGTCAGACCCTTGTTTGCCACGTGTAGTCGGTGAAACAGATCGACAAACTTATTG
TCTACCATTTGGAGTGTGTCTGAATACTGATGGATCGATTAATCATAATAAGGAAGATAATAGTGGTTTTGGAACAGATG
GAACAAAGAACCTAAATGTAATTGGTTCAGGGGTTCGCAATATTACGTTTGTGCCTAGTGAAGATAATCCATCTCCGCAA
AACAGTTGTGGAAAATTAAAGCTATCTGGTAATGAGCAAGGAACAGGGCAGTGGCAATGCACAAGCTATTTGATCCCTGC
ACGCTGGTATGAGCGTTATCGCTAA

Domains

Predicted by InterproScan.

• Neisseria PilC beta-propeller domain (T4P_PilY1) (824-1084)

Similar proteins

Only experimentally validated proteins are listed.

Protein	Organism	Identities (%)	Coverage (%)	Ha-value
pilY1	Acinetobacter baumannii D1279779	76.217	78.121	0.595