Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | U6038_RS04465 | Genome accession | NZ_CP140715 |
| Coordinates | 935551..940029 (+) | Length | 1492 a.a. |
| NCBI ID | WP_333655666.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter johnsonii strain FAHZZU3110hy | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 930551..945029
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| U6038_RS04440 (U6038_04440) | - | 931023..931661 (-) | 639 | WP_058869160.1 | hypothetical protein | - |
| U6038_RS04445 (U6038_04445) | pilG | 931942..932325 (+) | 384 | WP_004694493.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| U6038_RS04450 (U6038_04450) | - | 932353..932721 (+) | 369 | WP_004694491.1 | response regulator | - |
| U6038_RS04455 (U6038_04455) | - | 932727..933263 (+) | 537 | WP_004694490.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| U6038_RS04460 (U6038_04460) | - | 933314..935386 (+) | 2073 | WP_333655663.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| U6038_RS04465 (U6038_04465) | chpA | 935551..940029 (+) | 4479 | WP_333655666.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| U6038_RS04470 (U6038_04470) | - | 940034..940489 (+) | 456 | WP_078388412.1 | hypothetical protein | - |
| U6038_RS04475 (U6038_04475) | dapE | 940555..941688 (-) | 1134 | WP_176537359.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | - |
| U6038_RS04480 (U6038_04480) | - | 941805..941951 (-) | 147 | WP_010326244.1 | entericidin A/B family lipoprotein | - |
| U6038_RS04485 (U6038_04485) | - | 942109..942987 (-) | 879 | WP_062034334.1 | DUF1853 family protein | - |
| U6038_RS04490 (U6038_04490) | - | 943085..943438 (+) | 354 | Protein_862 | YbaN family protein | - |
| U6038_RS04495 (U6038_04495) | elsL | 943478..943981 (+) | 504 | WP_178896076.1 | cell wall-recycling L,D-carboxypeptidase ElsL | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1492 a.a. Molecular weight: 166769.43 Da Isoelectric Point: 4.3846
>NTDB_id=915119 U6038_RS04465 WP_333655666.1 935551..940029(+) (chpA) [Acinetobacter johnsonii strain FAHZZU3110hy]
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Nucleotide
Download Length: 4479 bp
>NTDB_id=915119 U6038_RS04465 WP_333655666.1 935551..940029(+) (chpA) [Acinetobacter johnsonii strain FAHZZU3110hy]
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TGAAATTTTTGTTGAAGAAATTGAAGAAATCTTCGTTGAGTTAGATCCATTATTTGAAAAGTGGTATGCTGAACCGACAC
ATCAAGAAACCTTGTTGAGCATACGTCGTCACTTCCATACCTTAAAAGGTTCTGGTCGTATGGTGGGGGCAAAGTCAGCA
GGTGAAACGGCGTGGGTAGTTGAAGACACCTTAAACCGTGTGATTTCAGGGGCTGTACCGCTTACAGCAACGGTTCAAAA
ATTTGCTAAGACAGTATTCAAACTGTTTCAATTTAAACTGTATCCTATATTCAAAGCGGTACAGGAAATTGATCTTGATC
TTCGTCCATTGGTTTTAATTGGACAACAATTACAACAAAATCAAAGTTTAGAACCTGCTCTAGAAGAGTTGCTACAACTG
TCTAATCATCTAAATAGTAATGATGTCGTGACAGGATTAGAGCTGAGCGATATTGAAGTGGTTGACTCTGAGCCGCAAGT
TGCAGACGCATCTGAACAGGATGATCAAGTACATGATGTCCTTGAAGAAACTTTAGCGATCTTCATTGAAGAAGCGGAAG
ACCATTTAGCGACTATCGATCAGTTCTTAAATGTAGATGAAACCAAAGTACAAGATTACAATGGTTTAATCCGTGCTTTA
CATACATTGCGCGGTAGTTCGTCTATGGCGCAAATTGAGCATGTCTTTAATGCCAGCTCAAAAGTTGAAAATCTATTTAA
AACCTTGGTTCAAGAAGAGATCGTTTCTACCTCGAAGGAGATCTCTTTACTCACCCAATATGCTGAATTTGTACGTGATT
ATTTACATGTGCTTGGGCGTGGTACGAACGAACAGCTTGACGTGATTTACGCCACGTTCACTACGGCTTGGGATAACTAT
GGTTTCAGTATTGAAGACGTAGCTGATGAGCTAAACCCACAAGGTATGGTCTCGAAGCTGATTGAGTTAAATATTGACCT
GTTGCTTGATGCCGAGTTTGAGTTTGATCAGCGTGCTAAGGTTGAATATCCAGACTATATTCAGCACTTAGGTGAACAAG
CAAAACAATTGCTGGAATTCACCAATAACCGTGCTGCTCAAGGAATTCATGATTTTACTTTTGAGCTATATGCAGGTTAT
CAAGCCTTACTGGAAAAGCCTGAATTACTCAATGTAGATTATGCATACGAGTTATTTGGTCAGGCACATCAAGAATTTAT
CCATTTATTTGACACTTTAGCTGCGGGTCAGCGCGTCATTCTGACTGAAGAAGTGCATAAAGTTCTGAATGAATTAATGG
CCTTCGTACAGCAAGATGTTGAATCGACTTCGACGACCGTAATTGAACCTGTTGCTGAGGCTATTGTTTCTAGAAATACT
TTACAACCAAGCCTTGATCTTGCGCAGATTTCGCAGCAAATTGCATCGGATCATCAGTACAAGCAATCGAATACGGCCAA
TACCAATTTTGATGATGATTTGCTTGATATCTTCTTGGAAGAAGCTGAAGAATTATTGATGGGGATGGATCAGGATCTTA
ATACTTGGTCTAAAAATGGCAATGATACCGCGGCACTCAATAATTTAATGCGTTATTTGCACACCTTAAAAGGTGGTGCC
AATATGATTTCTGCACCTTTTATTGGTTCGATTGCACACGAATTAGAGTCTATTTATGAGCGTGTGATTCGTCAGCAAAT
AGCCACAACGCCACAGTTGATCAGCATCATTCGCTTAGTACAGGATGACGTCGCAGACCGAATTCAGGTCATTCGTACCG
ATAAGGTTGATTATCCAGCAACAGCGACGATCAATGTACTGCATAACATTCAGAGCTTAGTTGAGGGTACGACTGTTACA
ACTACAGTATCCGAGCCTTTAGTTGAAGCGTTTGTTGCGGCAGTTGAAGAACCTTTATCTAATATAGATAGAACGATTGA
AGTTGAGGCAGCTGCGGTTGAGTCAGCAACTGCGATTGAAGAGCCGAGTGTAGTTGATAACACTGACGTTACTGTCGTTG
AACAGCTGGATACTCCGTCACTTGTCCAAGAAGAAGCAGTCAACGCTGTTGAAGAAGCAGCTAGTCTTTTATCAATTGTT
GAAGAAACCTTCTTGGAAGAAGCTGAAGAAATTTTAGCGACTACGGATGGCTTACTGAAACAGTGGACTGAACAACGTAG
TGACCGTAGTGTGTTACTACAATTGCAACGTGCTGCGCACAGCTTAAAAGGCGGCGCGCGTATGGCGGAGAATGAACCCG
TTGGTGCGATTGCTTATGAACTAGAAACCACATTTGAGCAATTTGCTGTACATAATTTCAGTTCAAACGTGTATGACCCA
TTATTGCAGACTGCATTTGAATGGTTAAAACAAGCCATCTTCAAACGTGATTTTAGTAATTATGATGGTCTGAAAAACAG
CTTAGCATCTATTGACTATGTGGATGTGATTGCGCAATTACCAACGCGTCTAACACAAATTGATTTACTTAATGCGGTAC
CAAGTTTTGAGTTTGTACAGGGTGATGGTACTGAGCCGCCAGCAATGCTGGGTGAGTGGAAAGAAACGACACACTTGGAT
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TTCGCGTATAGAGATGGACTTAGGTCAGCTCGGCAATACGTTGAACGAGATGGAGCTTGCAATTAAACGTTTGGCGGATC
AGTTACGTCGAATGGAAGGTGAGCTTGAAAGTCAAATTATTGCGAAGCACGGTTCTGAAAACTCGCGCTACGCAGACTTT
GACCCCTTGGAAATGGACCAATACTCATCGCTCAACCAATTGTCTAAATCCTTAGCAGAATCGGCTTCGGATTTGGTCGA
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AAGAAAGCTTAATGCGGACACGTTTGGTACCGTTCTCACGTATGCTGCCGCGTTTGCAACGTATTGTACGTCAGACCGCA
TCAACTTTGAACCGTCCAACGGAATTGGTCGTCCATAACACCGAAGGTGAATTAGACCGTACGATTCTTGAACGTTTGGT
TACGCCGTTTGAGCATATGCTACGTAACGCAATCGACCACGGTATTGAAGATGCGGAACAACGTGGCGCTGCGAAAAAAT
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ATTGATGAAAGCACGATTAAAGCGAAAGCGCTAAACCTAGGTTTAATTAAAGCCGATCAAGTGCTAGATAAACAGGAAAT
CTTACAGTTTATTTTCCATCCGGGTTTCAGTACGGCCAAAGAAGTGACGCAAATTTCTGGACGTGGTGTCGGTCTTGATG
TGGTACAAAGTGAAATTAAAGCACTGGGTGGACATGTCACGGTTGAATCGGAAATTGGTTTCGGCACAACCTTCATTATT
CGCGTACCGACTACGGTAGCGGTGAGTGATGCGTTGATGGTGAAAGCCGGTGATCAACAATATGCGATTCCATTGGCGCA
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TTGCCGGTGTTATTGATTAAAGGCAATAGTGGACAAACCATTGCCTTATTGGTTGATCAGCTCATTGGTTCACGTGCGCA
AATTGTAGTGAAGCCAGTTGGACAACAGTTTGCCAGCATTGGTGCAATTGCTGGTGCAACGATTTTGGGTGATGGCCATG
TGTGTTTGATTTTAGATGGTCAGAACATTGCACGTCAGATTTTAAGTACCAAGCGTGTGACGCATGCAGCAGATCATCGT
GACTTTGGTCGCCATCAGGATACACGTCGTTTAGTGATGATTGTGGATGACTCGGTAACGGTTCGTAAGGTCACATCGCG
CTTATTAGAGCGCCAAGGCTTTGATATTGTGACTGCAAAAGATGGTGTCGATGCGATGGAGCAGCTGGAGAGTGTTAAAC
CAGACTTGATGTTGCTGGATATTGAAATGCCACGTATGGATGGTTTTGAAGTAACGAACTTGGTTCGTCACCACGAAATT
CACCAGAACTTGCCGATTATTATGATTACATCGCGTACGGGTGAAAAACACCGTGAACGTGCTTTCAGCTTGGGCGTAAC
GCACTACATGGGCAAACCATTCCAAGAGGCAGAATTACTTGCCAACATTCAGCAGTTATTGGCTGAAAAGCAGGGGTAA
ATGAAAGAAATATTAAAACATTTAGTTGAAACGACAACGCTTCCGGAAGATAGTTATCTAGATCAAGATGCAGAAATTCT
TGAAATTTTTGTTGAAGAAATTGAAGAAATCTTCGTTGAGTTAGATCCATTATTTGAAAAGTGGTATGCTGAACCGACAC
ATCAAGAAACCTTGTTGAGCATACGTCGTCACTTCCATACCTTAAAAGGTTCTGGTCGTATGGTGGGGGCAAAGTCAGCA
GGTGAAACGGCGTGGGTAGTTGAAGACACCTTAAACCGTGTGATTTCAGGGGCTGTACCGCTTACAGCAACGGTTCAAAA
ATTTGCTAAGACAGTATTCAAACTGTTTCAATTTAAACTGTATCCTATATTCAAAGCGGTACAGGAAATTGATCTTGATC
TTCGTCCATTGGTTTTAATTGGACAACAATTACAACAAAATCAAAGTTTAGAACCTGCTCTAGAAGAGTTGCTACAACTG
TCTAATCATCTAAATAGTAATGATGTCGTGACAGGATTAGAGCTGAGCGATATTGAAGTGGTTGACTCTGAGCCGCAAGT
TGCAGACGCATCTGAACAGGATGATCAAGTACATGATGTCCTTGAAGAAACTTTAGCGATCTTCATTGAAGAAGCGGAAG
ACCATTTAGCGACTATCGATCAGTTCTTAAATGTAGATGAAACCAAAGTACAAGATTACAATGGTTTAATCCGTGCTTTA
CATACATTGCGCGGTAGTTCGTCTATGGCGCAAATTGAGCATGTCTTTAATGCCAGCTCAAAAGTTGAAAATCTATTTAA
AACCTTGGTTCAAGAAGAGATCGTTTCTACCTCGAAGGAGATCTCTTTACTCACCCAATATGCTGAATTTGTACGTGATT
ATTTACATGTGCTTGGGCGTGGTACGAACGAACAGCTTGACGTGATTTACGCCACGTTCACTACGGCTTGGGATAACTAT
GGTTTCAGTATTGAAGACGTAGCTGATGAGCTAAACCCACAAGGTATGGTCTCGAAGCTGATTGAGTTAAATATTGACCT
GTTGCTTGATGCCGAGTTTGAGTTTGATCAGCGTGCTAAGGTTGAATATCCAGACTATATTCAGCACTTAGGTGAACAAG
CAAAACAATTGCTGGAATTCACCAATAACCGTGCTGCTCAAGGAATTCATGATTTTACTTTTGAGCTATATGCAGGTTAT
CAAGCCTTACTGGAAAAGCCTGAATTACTCAATGTAGATTATGCATACGAGTTATTTGGTCAGGCACATCAAGAATTTAT
CCATTTATTTGACACTTTAGCTGCGGGTCAGCGCGTCATTCTGACTGAAGAAGTGCATAAAGTTCTGAATGAATTAATGG
CCTTCGTACAGCAAGATGTTGAATCGACTTCGACGACCGTAATTGAACCTGTTGCTGAGGCTATTGTTTCTAGAAATACT
TTACAACCAAGCCTTGATCTTGCGCAGATTTCGCAGCAAATTGCATCGGATCATCAGTACAAGCAATCGAATACGGCCAA
TACCAATTTTGATGATGATTTGCTTGATATCTTCTTGGAAGAAGCTGAAGAATTATTGATGGGGATGGATCAGGATCTTA
ATACTTGGTCTAAAAATGGCAATGATACCGCGGCACTCAATAATTTAATGCGTTATTTGCACACCTTAAAAGGTGGTGCC
AATATGATTTCTGCACCTTTTATTGGTTCGATTGCACACGAATTAGAGTCTATTTATGAGCGTGTGATTCGTCAGCAAAT
AGCCACAACGCCACAGTTGATCAGCATCATTCGCTTAGTACAGGATGACGTCGCAGACCGAATTCAGGTCATTCGTACCG
ATAAGGTTGATTATCCAGCAACAGCGACGATCAATGTACTGCATAACATTCAGAGCTTAGTTGAGGGTACGACTGTTACA
ACTACAGTATCCGAGCCTTTAGTTGAAGCGTTTGTTGCGGCAGTTGAAGAACCTTTATCTAATATAGATAGAACGATTGA
AGTTGAGGCAGCTGCGGTTGAGTCAGCAACTGCGATTGAAGAGCCGAGTGTAGTTGATAACACTGACGTTACTGTCGTTG
AACAGCTGGATACTCCGTCACTTGTCCAAGAAGAAGCAGTCAACGCTGTTGAAGAAGCAGCTAGTCTTTTATCAATTGTT
GAAGAAACCTTCTTGGAAGAAGCTGAAGAAATTTTAGCGACTACGGATGGCTTACTGAAACAGTGGACTGAACAACGTAG
TGACCGTAGTGTGTTACTACAATTGCAACGTGCTGCGCACAGCTTAAAAGGCGGCGCGCGTATGGCGGAGAATGAACCCG
TTGGTGCGATTGCTTATGAACTAGAAACCACATTTGAGCAATTTGCTGTACATAATTTCAGTTCAAACGTGTATGACCCA
TTATTGCAGACTGCATTTGAATGGTTAAAACAAGCCATCTTCAAACGTGATTTTAGTAATTATGATGGTCTGAAAAACAG
CTTAGCATCTATTGACTATGTGGATGTGATTGCGCAATTACCAACGCGTCTAACACAAATTGATTTACTTAATGCGGTAC
CAAGTTTTGAGTTTGTACAGGGTGATGGTACTGAGCCGCCAGCAATGCTGGGTGAGTGGAAAGAAACGACACACTTGGAT
GGTGGTAATGAGATGATCCGTATCTCAGCTGATTTGGTTGAGAAAATGATCGACCTGTCAGGTGAAAATGCGATTAACCG
TTCGCGTATAGAGATGGACTTAGGTCAGCTCGGCAATACGTTGAACGAGATGGAGCTTGCAATTAAACGTTTGGCGGATC
AGTTACGTCGAATGGAAGGTGAGCTTGAAAGTCAAATTATTGCGAAGCACGGTTCTGAAAACTCGCGCTACGCAGACTTT
GACCCCTTGGAAATGGACCAATACTCATCGCTCAACCAATTGTCTAAATCCTTAGCAGAATCGGCTTCGGATTTGGTCGA
TTTTAAGAGCACTTTGGCTGAGAAAATTCGTGATGCGGAAGGCTTGTTATTACAACAATCCCGTATTCAAGCGGAGATTC
AAGAAAGCTTAATGCGGACACGTTTGGTACCGTTCTCACGTATGCTGCCGCGTTTGCAACGTATTGTACGTCAGACCGCA
TCAACTTTGAACCGTCCAACGGAATTGGTCGTCCATAACACCGAAGGTGAATTAGACCGTACGATTCTTGAACGTTTGGT
TACGCCGTTTGAGCATATGCTACGTAACGCAATCGACCACGGTATTGAAGATGCGGAACAACGTGGCGCTGCGAAAAAAT
CAGCGACAGGCCAAATTGAACTGAACATTAGTCGTCAAGGTACAGATGTTATCGTCAGCTTTAAAGATGATGGTAAGGGT
ATTGATGAAAGCACGATTAAAGCGAAAGCGCTAAACCTAGGTTTAATTAAAGCCGATCAAGTGCTAGATAAACAGGAAAT
CTTACAGTTTATTTTCCATCCGGGTTTCAGTACGGCCAAAGAAGTGACGCAAATTTCTGGACGTGGTGTCGGTCTTGATG
TGGTACAAAGTGAAATTAAAGCACTGGGTGGACATGTCACGGTTGAATCGGAAATTGGTTTCGGCACAACCTTCATTATT
CGCGTACCGACTACGGTAGCGGTGAGTGATGCGTTGATGGTGAAAGCCGGTGATCAACAATATGCGATTCCATTGGCGCA
GATTGATCGTATTGTGCGTATTGCTCCAACAGCATTGGATCAGTATTTCCACAGCAAAGATGACCAATTCAAAATTGATG
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GCACTACATGGGCAAACCATTCCAAGAGGCAGAATTACTTGCCAACATTCAGCAGTTATTGGCTGAAAAGCAGGGGTAA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
60.99 |
100 |
0.619 |