Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | SOI81_RS03150 | Genome accession | NZ_CP139286 |
| Coordinates | 648520..653028 (+) | Length | 1502 a.a. |
| NCBI ID | WP_320541229.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter pittii strain AbaK | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 643520..658028
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SOI81_RS03125 (SOI81_03125) | - | 643962..644600 (-) | 639 | WP_320541228.1 | hypothetical protein | - |
| SOI81_RS03130 (SOI81_03130) | pilG | 644885..645268 (+) | 384 | WP_000389061.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| SOI81_RS03135 (SOI81_03135) | pilH | 645291..645653 (+) | 363 | WP_000101096.1 | response regulator | - |
| SOI81_RS03140 (SOI81_03140) | pilI | 645714..646250 (+) | 537 | WP_016143130.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| SOI81_RS03145 (SOI81_03145) | pilJ | 646293..648371 (+) | 2079 | WP_016143131.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| SOI81_RS03150 (SOI81_03150) | chpA | 648520..653028 (+) | 4509 | WP_320541229.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| SOI81_RS03155 (SOI81_03155) | - | 653028..653495 (+) | 468 | WP_224992802.1 | hypothetical protein | - |
| SOI81_RS03160 (SOI81_03160) | dapE | 653528..654664 (-) | 1137 | WP_016143134.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | - |
| SOI81_RS03165 (SOI81_03165) | - | 654791..654934 (-) | 144 | WP_003655297.1 | entericidin A/B family lipoprotein | - |
| SOI81_RS03170 (SOI81_03170) | - | 655078..655950 (-) | 873 | WP_239975408.1 | DUF1853 family protein | - |
| SOI81_RS03175 (SOI81_03175) | - | 656054..656431 (+) | 378 | WP_016143136.1 | YbaN family protein | - |
| SOI81_RS03180 (SOI81_03180) | elsL | 656533..657036 (+) | 504 | WP_239975407.1 | cell wall-recycling L,D-carboxypeptidase ElsL | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1502 a.a. Molecular weight: 171161.38 Da Isoelectric Point: 4.3782
>NTDB_id=908754 SOI81_RS03150 WP_320541229.1 648520..653028(+) (chpA) [Acinetobacter pittii strain AbaK]
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Nucleotide
Download Length: 4509 bp
>NTDB_id=908754 SOI81_RS03150 WP_320541229.1 648520..653028(+) (chpA) [Acinetobacter pittii strain AbaK]
ATGAAAGAAATATTAAAAACTTTAACTGAAGCAATGATGCTACCGGAAGATAGCTATTCTCAACAAGATGATGAATTCCT
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TTGCTACGCTTACCGAAATCCGCCGTTATTTTCATACATTGAAAGGTTCTGGCCGGATGATTGGTGCAAAATCATCTGCT
GAGCTTGCCTGGACTGTAGAAGATACGCTGAATCGCGTAATCAATCAGAGTCTCGGATTAACTCCTAACATCCAACAATA
TGTTCAGTTGGTATTTAAGTTCTATTTCTTTAAGTTAGTAGATGACTTTAAATCTAAAAAAGATCATACCTTAGACTTTA
GGCCCCTTATTTTATTAGGACAACAATTACAACAACAGCAAAGTATAGAACCCGCATTAGATGAACTTTTATTATTATCA
GATACTCTTACTGCTGAAACTCAAACTGGTTTAGAAACGAATGACTTCGAACCACAGTCAACTAATGTTTTAACTATCGC
CACTCCAGAGGTTGCTATAGAAACTGAACAGACTCTTGCTGAAACCTTAATTTTATTTATGGAAGAGGCAGAAGAGCACT
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TTACGTGGCAGTTCTGCTATGGCTCATGTAGAACCAATATTTGATGCCAGTACCAAAGTTGAGCATTTATTTAAAATACT
ATTACAAGAAGAGCTTTCTTCTCATTCAGAAGAAATTTCATTACTTCGTGATTACCGCGAGTTTATTCGAAATTGTTTAG
ATTCATTGGCTAGCCATTGTTCTACTGAGCAATTGGAATCTGATCTACAAAAATTTAATCAGATTTGGGATGCTTATATG
GAGCAGCATGGTGAGCATTCAAGCCCGCTCATGCCTCCACATGGTTTAGTGTCTCAGCTATTGCAGTTAGATGTTTCAGA
ATTGCTTGATGCAGAGTTAGATTTTGAGAAGGGAATACGGACAGAGTTTCCTCATTATCTTGAACGCTTAAGTGAACAAG
CAGATGTGTTGTTGCAACATACTCAGTCGCAGGCAATGGTTGGTTTATATGAATATACTAACCAGCTCAAAGACAGCTAT
AAGGTATTACTTGAACGACCTGATTTATTGCAATCGGATTATGTTTTTGAAATTTATCAAAAAGCACACCAACAATTAAT
TCAGTTATTTGATGCCTTAGCTGCGGGACAAAGAGTAAGTATTATTGAGCAACATCAAAATGTCTTGGAAGAGCTAAAAC
TATATACTCAACATATTCCGAGTCTTAATGTTGAACCATTAGAAACTCATCAGGAAATTATTGAATTAACCTTTAATACT
GAAGTTGAACAAACAACGAATGAACCTCTAGTCTCAACAGAAAATGTATTCACTGATCAGATCTTAATGAGTCAAAGTGT
ACAACTAGATCGACAGTTCATTTCGACTGAACAGGTAAACCGTAATTTTGATCCAGATCTATTAGATATTTTTCTTGAAG
AAGCTGATGAGTTGCTTGAAGGAATGGATACAGATCTTAATATTTGGGTTAATGATCAAGAAAACTTTGCAGCTCTTAAT
AACCTGATGCGTTATTTGCATACCTTAAAAGGTGGGGCAAATATGATTCAGGCAGGCTATATTGGTTTAATTGCACATGA
GTTAGAAAGTATTTATGAGCGCTTAATTCAAAAACAGTTGATAGCTTCGTCTGCTCTCATTGATGTTATTCGACTAGTTC
AAGATGACTTGGCTGACCGTCTTCAAATAGTACGTGAACAGCATCTAGATTATGCTGCTTCTCATACTATTCAAGCGCTT
AAAAATGCAGGCCAAGTATTTGATTCTCGTATTAAAGAAGTGCAAGCAGAATCTGAAACCTATGTTATACCTGAAGTAAA
TTTTGCAGAATTACCACAAGAAACGATAAATAATACAGCGTTAAGCTTCAGTGAGTTAACTTCTGAGTCTGAGCAGATTG
CTGAGTCTAATAATCGACTTGTTGGGCAAACCGAATTACAAGTTCTCGCTGACCAAGGCTATACAGAAAATCTTCAAGAT
CAGGATATTAGCTCTGTTGTTGAGCAGACATTCATGGAGGAAGCGGCTGAACTATTAGAAACGGCCGATCATCTATTAAA
ACAATGGTTCGAGCAGCGTACTAACCGTAGTATCTTGCTTCAGCTACAAAGGGCTGTGCATAGCTTGAAAGGCGGTTCCC
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CAGGGCACTGTCTTTACCATACGTGTTCCAACTACGGTAGCTGTTAGTGATGCCTTAATGGTTAAAGTTGCTGATCAGCA
ATTTGCAATCCCATTGGCTCAAATTGATCGAATTGTGCGGGTTTCACCAGCCTCATTAGAACAATATTTCGGAAGTGCAC
AAGAGTTCTTTGAATTTGAAAATAAGCGCTATCCATTACGTTATTTATCTGAATTTGTTGGTAATCAACCCATTCCGCGT
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CTATTTTAGGTGATGGCCAAGTTTGTCTAATTTTAGATGGACAAAATATTGCTCGCCAGATCCAATCTACCCAACGGCAT
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AGCAATTGGAAAATATTAAACCAGATCTGATGCTGCTTGATATTGAAATGCCACGAATGGATGGCTTTGAGGTTCTCAAT
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TCATGGCATTTGAAGGGGGACTTGCCTAA
ATGAAAGAAATATTAAAAACTTTAACTGAAGCAATGATGCTACCGGAAGATAGCTATTCTCAACAAGATGATGAATTCCT
TGAAATCTTTGTCGAAGAAATTGAGGAAATTTTTATTGAATTACAATCTTTGATTGACGAATGGATGCAATCTGAAAATA
TTGCTACGCTTACCGAAATCCGCCGTTATTTTCATACATTGAAAGGTTCTGGCCGGATGATTGGTGCAAAATCATCTGCT
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CACTCCAGAGGTTGCTATAGAAACTGAACAGACTCTTGCTGAAACCTTAATTTTATTTATGGAAGAGGCAGAAGAGCACT
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ATTGCTTGATGCAGAGTTAGATTTTGAGAAGGGAATACGGACAGAGTTTCCTCATTATCTTGAACGCTTAAGTGAACAAG
CAGATGTGTTGTTGCAACATACTCAGTCGCAGGCAATGGTTGGTTTATATGAATATACTAACCAGCTCAAAGACAGCTAT
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TATATACTCAACATATTCCGAGTCTTAATGTTGAACCATTAGAAACTCATCAGGAAATTATTGAATTAACCTTTAATACT
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GTTAGAAAGTATTTATGAGCGCTTAATTCAAAAACAGTTGATAGCTTCGTCTGCTCTCATTGATGTTATTCGACTAGTTC
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AAAAATGCAGGCCAAGTATTTGATTCTCGTATTAAAGAAGTGCAAGCAGAATCTGAAACCTATGTTATACCTGAAGTAAA
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CTGAGTCTAATAATCGACTTGTTGGGCAAACCGAATTACAAGTTCTCGCTGACCAAGGCTATACAGAAAATCTTCAAGAT
CAGGATATTAGCTCTGTTGTTGAGCAGACATTCATGGAGGAAGCGGCTGAACTATTAGAAACGGCCGATCATCTATTAAA
ACAATGGTTCGAGCAGCGTACTAACCGTAGTATCTTGCTTCAGCTACAAAGGGCTGTGCATAGCTTGAAAGGCGGTTCCC
GTATGCTGGGACTTGAAACCGTGCAAGCGATTGCTTATCAGCTTGAGAATGCTTTTGAACAATTTGCACTTCATCATTTC
AGTTCAAATATTTATGACAATTTATTAGAGAGTGCAATTGTCTGGTTAAAAGAGGCTATTTTTAAACAAAATTATCAACA
CTTCGATGGTTTACAACAAAGTCTGGAAAATATTCAGTTCATTGAAACAGCAATTCAAATTCCTAGTAAATTAACTCGAA
CTGATCTATTCAGCACAGAACCTGTCATAAGTTTTGTGCAAGGTGACGGTACAGAGCCACCGGCAATGATGGGTGCGTGG
GAACAAACACAACGTCTTGATCAAAATAATGAGATGATTCGAGTCTCGGCAGATTTAATTGAAAAAATGATTGATCTGTC
TGGCGAAAATTCAATTAACCGTTCGCGAATTGAAATGGATTTAAGCCAATTTGGCCATACGCTTGCAGAAATGGAATTGG
CTATTCAAAGACTTGCAGATCAGTTGCGTCGAATGGAAGGTGAATTAGAAACTCAAATTATTGCAAAACACGGTATTGAA
AACTCTCGGTATACGGAATTTGATCCTTTAGAGATGGATCAATATTCTTCATTAAATCAGTTGTCAAAATCTCTTGCCGA
ATCTGCATCAGATTTAGTGGATTTTAAAAATACATTATCTGAAAAGATCAGAGACACCGAAGGTCTATTGATTCAACAAT
CACGTATTCAGGCTGAAATTCAAGAAGGTCTCATGCGAACACGCTTAGTACCATTTTCTCGGTTGCTGCCTCGTTTACAA
AGAATTGTGAGACAGACTTCTACTGCGTTAAATCGACCAGCAGAGCTTTTCGTGAATAATACTGAAGGTGAGTTGGACCG
GACAATGTTAGAGCGTTTGGTCACACCACTTGAGCACATGCTTAGAAATGCAATTGACCATGGTTTAGAAGACCGTGCGC
AACGTGAACAAGCGCAAAAACCAGAAACTGGACGCATTGAGCTGAATATTCATCGTCAAGGTACAGATGTTGTCGTTACA
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AGTATTAGAACATCAAGATATTTTACAGCTGATTTTCCATCCTGGTTTAAGTACAGCCGATCAAGTCACTCAGATTTCAG
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TCATGGCATTTGAAGGGGGACTTGCCTAA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
79.894 |
100 |
0.804 |