Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | SOI71_RS03365 | Genome accession | NZ_CP139251 |
| Coordinates | 690670..695199 (+) | Length | 1509 a.a. |
| NCBI ID | WP_104075254.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter pittii strain MCR53 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 685670..700199
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SOI71_RS03340 (SOI71_03340) | - | 686109..686747 (-) | 639 | WP_069124015.1 | hypothetical protein | - |
| SOI71_RS03345 (SOI71_03345) | pilG | 687032..687415 (+) | 384 | WP_000389061.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| SOI71_RS03350 (SOI71_03350) | pilH | 687439..687801 (+) | 363 | WP_046811934.1 | response regulator | - |
| SOI71_RS03355 (SOI71_03355) | pilI | 687858..688394 (+) | 537 | WP_104075253.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| SOI71_RS03360 (SOI71_03360) | - | 688441..690522 (+) | 2082 | WP_068565018.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| SOI71_RS03365 (SOI71_03365) | chpA | 690670..695199 (+) | 4530 | WP_104075254.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| SOI71_RS03370 (SOI71_03370) | - | 695196..695663 (+) | 468 | WP_069124007.1 | hypothetical protein | - |
| SOI71_RS03375 (SOI71_03375) | - | 695968..696849 (+) | 882 | WP_104075255.1 | alpha/beta fold hydrolase | - |
| SOI71_RS03380 (SOI71_03380) | dapE | 696985..698121 (-) | 1137 | WP_005072799.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | - |
| SOI71_RS03385 (SOI71_03385) | - | 698248..698391 (-) | 144 | WP_014207555.1 | entericidin A/B family lipoprotein | - |
| SOI71_RS03390 (SOI71_03390) | - | 698515..699396 (-) | 882 | WP_104075256.1 | DUF1853 family protein | - |
| SOI71_RS03395 (SOI71_03395) | - | 699500..699868 (+) | 369 | WP_017400240.1 | YbaN family protein | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1509 a.a. Molecular weight: 172270.05 Da Isoelectric Point: 4.3334
>NTDB_id=908330 SOI71_RS03365 WP_104075254.1 690670..695199(+) (chpA) [Acinetobacter pittii strain MCR53]
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Nucleotide
Download Length: 4530 bp
>NTDB_id=908330 SOI71_RS03365 WP_104075254.1 690670..695199(+) (chpA) [Acinetobacter pittii strain MCR53]
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CTGCTACGCTCACTGAAATTCGCCGCCATTTCCATACCTTAAAAGGTTCTGGGAGAATGATTGGTGCTAAATCTTCAGCT
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AATACGCTTACTGCCGAAACAATAACTGGACTTGAGCTAGACTATCTTGAGCAAGATTCATTGGCTGAGTCAATTGTTGA
AGATGTACATACTGAAATTGAAATAAATCTAAATGAAACCTTAGCCTTATTTATGGAAGAAGCGGAGGAGCATTTATCGA
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TATCTAGCAATAGTTCAAGTGAACAGCTTGAAGTGAGATTAGAGCAGTTTAATCAATCATGGGATGTCTACGTTGAGGAG
CATAGTGATCGAACAGATCCATTAATGCCTTCACATGGTTTGGTATCGCAATTATTACTGTTAGATGTTTCTGAGCTACT
CGATGCAGAATTAGATTTTGAGAAAGGAATTCGTAACGAGTTTCCTGGTTATCTTGAACGTCTAAGTGAACAGGCTGATT
TGTTGCTACAGCATACCCACTCTCAAGCAATGCTAGGTTTACATGAATATACGAGCCAATTGAAAGACAGCTATAATGTA
TTGCTTGATAAACCTGTGTTATTGCAATCGGACTATATTTTTGAAATTTATCAAAAAGCGCATCAACAACTTATTCAATT
GTTCGATGCTTTAGCTGCTGGTCAGCGAGTCGGTATTGTTAAGCAACATCAAAGTATTCTAGAAGAATTAAAACTTTATA
CGCTACATACACCTAGTATTCAAAATGATGTATCTCAGCAGAATTTTACTTTTGATGAGTCACTATTCAATATTGAACTA
GAGTCTGAAGTTCCAGAAGTTATTAGAGTAGAGAATTTATCAGACTCTGCTGACTGGACCCTATTAAGCCAAAGTGTACA
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CTGATGAGTTGCTTGAAGGAATGGATACAGATCTTAATATTTGGATTAATGATCAAGAGAACTTTGCGGCTCTCAATAAT
TTGATGCGTTATTTGCACACCTTAAAAGGTGGAGCAAATATGATCCAAGCAATTTATATTGGCTTAATTGCACATGAATT
GGAAAGTATTTATGAGCGATTAATTCAAAGACAGCTAATTGCTTCATCTGCTCTCATTGATTTTATACGTCTGGTTCAAG
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AGAGCATGTCAAAACTCTAACTTCCAATCTGCACCTGAGATTGAAGTATCTGATATTGAACGTGAGATATTCTCTGAACA
AGAGGTGATATCTGAAGTATTAATAGATGAAGTACCGGCAGAAATTGAAGCTGTTATTGAAGAATTAGAAGCTCATCATG
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GGCTGATATGCTATTGAAACAATGGTTTGATCAGCGTACGAATCGTAGTATCTTGCTTCAATTACAAAGGGCCGTGCACA
GCTTGAAGGGTGGTGCACGAATGGTTGGTTTAGAAGCCGTGTATGCGATTGCCTATCAACTTGAGAATGCTTTTGAACAA
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GAGCTTGCTTGGACAGTTGAAGACACGCTCAATCGAGTAATCAATCAAAGCCTTAAGTTGACTCCAGCTATCCAGAGTTA
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TTGCTTGATAAACCTGTGTTATTGCAATCGGACTATATTTTTGAAATTTATCAAAAAGCGCATCAACAACTTATTCAATT
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TTGATGCGTTATTTGCACACCTTAAAAGGTGGAGCAAATATGATCCAAGCAATTTATATTGGCTTAATTGCACATGAATT
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ATCAAGTATTTGATACAGTTGTTACTGAATTGGCTGCGCCAGTTGAAGCAATAACATCAGTTGTATCGTCGCACGAGAAT
GACGCTCTGGTTGATGAAGAGGACATTACTGCTGTTGTTGAGCAGACATTCCTCGAAGAAGCTGCTGAATTGTTAGAAAT
GGCTGATATGCTATTGAAACAATGGTTTGATCAGCGTACGAATCGTAGTATCTTGCTTCAATTACAAAGGGCCGTGCACA
GCTTGAAGGGTGGTGCACGAATGGTTGGTTTAGAAGCCGTGTATGCGATTGCCTATCAACTTGAGAATGCTTTTGAACAA
TTTGCACTACATCACTTCAACTCGAATATTTATGACCATTTGCTCGAAAGTGCAATTGCATGGCTAAAAGACGCAATTTT
CAAGTACAACTACCAGCATTTTGATGGACTACAACAAAGTTTAGAAAATATTCAATTCTTTGAAACGAATATCCAAATTC
CAGCTAAGTTAAGTAAAGCTGATTTGTTTAGCTCAGAACCCGTGATGACCTTTATACAAGGTGATGGTACAGAACCACCG
CCAATGATGGGAGCATGGGAACAAACTCAACGGCTTGATCAAAATAATGAGATGATCCGAGTTTCGGCAGATTTAATTGA
AAAAATGATTGATCTGTCAGGTGAAAATTCGATTAACCGTTCGCGAATTGAAATGGATTTAAGCCAATTTGGACATACGC
TAGCGGAAATGGAATTGGCCATTCAGCGACTTGCAGATCAGTTGCGTCGAATGGAAGGTGAATTGGAAACCCAAATTATT
GCAAAACACGGTATTGAGCACTCTCGATATACGGAGTTTGATCCGTTAGAGATGGATCGATATTCGTCTTTAAATCAATT
ATCAAAATCTCTTGCTGAATCTGCATCGGATTTGGTCGACTTTAAAAATACATTATCTGACAAAATCAGAGATACAGAAA
GCTTACTTTTACAACAGTCACGGATTCAAGCAGAAATTCAAGAAGGTTTGATGCGAACGCGATTAGTACCTTTCTCTCGA
TTACTGCCGCGTTTACAGCGAATTGTCCGTCAGACATCTACAGCTTTGAACAGACCTGCAGAGCTTTTTGTAAATAATAC
CGAAGGTGAGTTAGATCGCAATATTTTAGAACGGTTAGTGACCCCGCTTGAGCATATGCTCAGAAATGCAATTGACCATG
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AGAATATCGATGCTTTACTTGTGGCGTTTGAAAGTGAGGTCAAATCATGA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
88.999 |
100 |
0.89 |