Detailed information
Overview
| Name | pilY1 | Type | Machinery gene |
| Locus tag | MKL45_RS16350 | Genome accession | NZ_CP102934 |
| Coordinates | 3440421..3444266 (-) | Length | 1281 a.a. |
| NCBI ID | WP_025469982.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter sp. AOR07_HL | ||
| Function | assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake |
||
Genomic Context
Location: 3435421..3449266
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MKL45_RS16315 (MKL45_16320) | - | 3436182..3437123 (+) | 942 | WP_097355459.1 | triacylglycerol lipase | - |
| MKL45_RS16320 (MKL45_16325) | rplS | 3437176..3437544 (-) | 369 | WP_000014562.1 | 50S ribosomal protein L19 | - |
| MKL45_RS16325 (MKL45_16330) | trmD | 3437752..3438492 (-) | 741 | WP_000464599.1 | tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD | - |
| MKL45_RS16330 (MKL45_16335) | rimM | 3438538..3439086 (-) | 549 | WP_000189236.1 | ribosome maturation factor RimM | - |
| MKL45_RS16335 (MKL45_16340) | rpsP | 3439106..3439357 (-) | 252 | WP_000260334.1 | 30S ribosomal protein S16 | - |
| MKL45_RS16340 (MKL45_16345) | pilE | 3439504..3439929 (-) | 426 | WP_005127886.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| MKL45_RS16345 (MKL45_16350) | pilY2 | 3439926..3440408 (-) | 483 | WP_001046423.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| MKL45_RS16350 (MKL45_16355) | pilY1 | 3440421..3444266 (-) | 3846 | WP_025469982.1 | PilC/PilY family type IV pilus protein | Machinery gene |
| MKL45_RS16355 (MKL45_16360) | pilX | 3444278..3445096 (-) | 819 | WP_000149376.1 | PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein | Machinery gene |
| MKL45_RS16360 (MKL45_16365) | pilW | 3445093..3446094 (-) | 1002 | WP_000079197.1 | PilW family protein | Machinery gene |
| MKL45_RS16365 (MKL45_16370) | pilV | 3446095..3446655 (-) | 561 | WP_002194578.1 | type IV pilus modification protein PilV | Machinery gene |
| MKL45_RS16370 (MKL45_16375) | fimU | 3446649..3447122 (-) | 474 | WP_001214065.1 | GspH/FimT family pseudopilin | Machinery gene |
| MKL45_RS16375 (MKL45_16380) | ispH | 3447292..3448242 (-) | 951 | WP_000407064.1 | 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase | - |
| MKL45_RS16380 (MKL45_16385) | gmk | 3448365..3448994 (+) | 630 | WP_000015937.1 | guanylate kinase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1281 a.a. Molecular weight: 137559.17 Da Isoelectric Point: 7.8780
>NTDB_id=719965 MKL45_RS16350 WP_025469982.1 3440421..3444266(-) (pilY1) [Acinetobacter sp. AOR07_HL]
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Nucleotide
Download Length: 3846 bp
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CGCTAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| pilY1 | Acinetobacter baumannii D1279779 |
88.733 |
100 |
0.891 |