Detailed information NTG0628634

Bioinformatically predicted

Overview

• Name: pilY1
• Type: Machinery gene
• Locus tag: LO012_RS01930
• Genome accession: NZ_CP087317
• Coordinates: 378084..381938 (+)
• Length: 1284 a.a.
• NCBI ID: WP_000768943.1
• Uniprot ID: A0A0J0ZLJ4
• Organism: Acinetobacter baumannii strain OC064
• Function: assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake

Genomic Context

Location: 373084..386938

Locus tag	Gene name	Coordinates (strand)	Size (bp)	Protein ID	Product	Description
LO012_RS01900	gmk	373356..373985 (-)	630	WP_000015937.1	guanylate kinase	-
LO012_RS01905	ispH	374108..375058 (+)	951	WP_000407064.1	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase	-
LO012_RS01910	fimU	375228..375701 (+)	474	WP_001214060.1	Tfp pilus assembly protein FimT/FimU	Machinery gene
LO012_RS01915	pilV	375695..376255 (+)	561	WP_002194578.1	type IV pilus modification protein PilV	Machinery gene
LO012_RS01920	pilW	376256..377257 (+)	1002	WP_000079197.1	PilW family protein	Machinery gene
LO012_RS01925	pilX	377254..378072 (+)	819	WP_000149374.1	PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein	Machinery gene
LO012_RS01930	pilY1	378084..381938 (+)	3855	WP_000768943.1	VWA domain-containing protein	Machinery gene
LO012_RS01935	pilY2	381949..382431 (+)	483	WP_001046489.1	type IV pilin protein	Machinery gene
LO012_RS01940	pilE	382428..382853 (+)	426	WP_000788336.1	type IV pilin protein	Machinery gene
LO012_RS01945	rpsP	383000..383251 (+)	252	WP_000260334.1	30S ribosomal protein S16	-
LO012_RS01950	rimM	383271..383819 (+)	549	WP_000189236.1	ribosome maturation factor RimM	-
LO012_RS01955	trmD	383865..384605 (+)	741	WP_000464595.1	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	-
LO012_RS01960	rplS	384813..385181 (+)	369	WP_000014562.1	50S ribosomal protein L19	-
LO012_RS01965	-	385233..386174 (-)	942	WP_085916958.1	triacylglycerol lipase	-

Sequence

Protein

• Length: 1284 a.a.
• Molecular weight: 138115.41 Da
• Isoelectric Point: 7.3066

>NTDB_id=628634 LO012_RS01930 WP_000768943.1 378084..381938(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain OC064]
MKLKLKNFKPNNLWYAVCSSSMIFTWLMTSSVVQASDLQIYASPTAGKKTIVMMLDTSGSMTNNSYGENRLAMLKNGMNA
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GTTTYSETNYAIRKDSYIKRVRRSDNRTEYSYCTNYRDSQIDTANLWQPCRSNSYWSSWSTNNPGVDNATAYDTSSDWTY
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NNQTKTNSTYSSFGVRVVRLANLATNDSTYDGTNDYTGGNAPRFYEPPTVTIHDYGIHTFITVGIASGDRSTPLDVYPLT
GREGMTPASALSGRPVNNVYGIIDRDFVKKNLMSLTDNQLETKDITRTGLRKNPQILRTGETRVAQIFFPTTGVGKGGWY
RSLSSTSDGTEKANNSFRIKGGLKAFEEPMAITGNLIILVYDPQGTGIVAADPCLPRVVGETDRQTYCLPFGACLNSDGS
IDQNKENHSGFETQTGTNCPVGASECNKNVIGSGIRSVTFVPTEDNPPTTNSCGKLKLSGNEQGTGQWQCTSHLVPTRWY
ERYR

Nucleotide

• Length: 3855 bp

>NTDB_id=628634 LO012_RS01930 WP_000768943.1 378084..381938(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain OC064]
ATGAAACTAAAATTGAAGAATTTTAAGCCAAATAATTTATGGTATGCCGTCTGTTCAAGCTCAATGATATTCACATGGCT
GATGACAAGCTCTGTGGTGCAAGCAAGTGATTTACAAATTTATGCCTCACCTACAGCAGGTAAAAAAACAATTGTGATGA
TGTTGGATACATCAGGAAGTATGACCAACAATAGTTATGGTGAAAACCGCTTAGCCATGCTTAAAAATGGTATGAATGCT
TTTTTGGCTAGCAATAACCCTGTCTTAAATGATACGCGAGTAGGTTTAGGAAATTTCTCGGCAAATGGTGACAGCCGAAG
TGGACAAATTTTAGTGGCTGCTGCTCCTTTAGGTGATGCAAGTACTTTAAATACGGTAGGCTCACAACGTTATAAATTAA
AACAAGCTGTTGCTAATTTAACTGCGGGAGGCTCAACACCTTCAGCCCACGCTTATGCTGAAGCAGCTGCTTACTTAATG
GGGACAACCACATATTCAGAGACGAATTATGCTATTCGTAAAGATAGTTATATCAAACGTGTAAGAAGATCTGATAATAG
AACTGAATATTCATATTGTACTAATTACCGTGATTCGCAAATTGATACAGCCAACCTATGGCAACCTTGTCGTTCAAATA
GTTATTGGAGTAGCTGGTCAACAAATAATCCAGGTGTGGATAATGCTACTGCTTATGATACTTCATCTGACTGGACTTAT
TACTATACTTATTACTACACCACTTTTAATTATGCTGTAGCAAATGCAGATAGCGGTATTCCAAAATCTAAATCAAACGA
TACAGCTAGCAATCCGAATATTGTTGTAGACCGAAATGCTACTAACTCCAATGCAGTGTATCAGTCACCTTTACCTGCAG
TAGCGAATCGCCAGAGTTGTGATGGACAAGGTATTTACTTCTTATCGGATGGCGAACCGAACAATACAACAAATACACGT
TCGGCAAGTGTCATGTCGACTGCTTTAGGTAGTACTTTTGGAGCTGATTTTAATTGTTCTGGAGGTTTATCTAACACTAC
GGCAGACTCTGGTTGGGCTTGTATGGGAGAGTTTGCAAAAAGATTATTTGATAAAACAAAGAACCCTGCCGGAGTTTCTA
TTCAAACAGCATTTGTCGGTTTTGGTAGTGACTTTTCTAGTTTGAATTCTTCTGATGTAAAAAATGCCTGCCGTTTAAGT
TCGAGAACCCAGTCTGACCGAAAAGGAGATGATGCGTGTTCACCGAATCAATCTACAAATGCGGTAGCTGCACCAGGTTA
TGGAAATGGTGGTTTTTTCCCTACTCAGAGTTCACAAGGCGTAACAGACAGCGTTATCGCATTTATTAATAATTTAGATA
AAGTTCCTTTAGAACCCTTAACCACAGGTGCTATCTCAGTTCCATATGATGCATTGAATCCCAAAAATTTACAGGAATAT
GGTTATTTACGAGCTTTTGAGCCAAATCCAGCTAACACGTACTTAACATGGCGTGGAAATTTAAAGAAATATCATGTTGT
TTTATCTGGAGCGAATGCTGGTGCTTTTGAGGCCAATTCTGGCGGATTAGTCTACAATGCAAGTGGGGCTTTTAGAACTG
GAACAAAGGATTATTGGAATAGCTCTACTTATACTGACGGAGGCAAAGTCTTTTTAGGTGGTTCATATGCGAATGTGCCT
TTACCCATTGCTGGACAACCTGAAACACGTGATGCAGAAGGGAATATCACAAAATATTATTACGCAGTACAAAGTAAAAT
CCGCAACTTATTTACTGATGTTTCCGCCGTTGCAGCAGATGGTAGCTTAACGAAAATTTCAACTTCTGGAACTAATTTGC
TAAAAATTCCAGCTGCTCCACCAGAAGAAACTAATCCTTTTGATACGGTGGCTAATACAGCAAGTTATGTTTTAGGTAAA
TTTGATCCATCAACTGGACAAAATATTTTAAAAGCTTTTCCTATAAGCTTGAAATTAAAAATATTAAATTATTTAGGTTA
TTCAACAGATATTAATGCAACAACTCTGCCTTCATCTTTGGTTACATCGAATGAACCTTATTTATCGATGGGGGGAAGTA
TTCACTCTTTACCGGTTCAACTAACCTACAATGGAACCCTAGATGATAATGGGAATTTAACATCTGCCCGAGAACAATCC
ATCCTCTATGGAACTATGGAAGGCGGATTACATATTGTGGATGCTTCATCTGGTATTGAGCAAATGGTCTTTGTTCCTGC
AGATATTTTAAATGATTCAGTTGCTTCCAAAGCTTTAGTTGTTGGTCAAAGTGATGCTTCAGCTCCCGCTCATGGTATGG
ACGGAGCTTGGGTATCTGATCCAGCCTATAATATTACTACAGTGGGAAGTGGTAGCTCGGCAGTATCAAAAGTAACTGCA
AAGCAAATGAATATTTATGGCGGCATGCGTATGGGAGGAAGTAGCTACTACGGACTAGATGTATTAAGCCCTACTTCACC
GAAACTGCTTTTTAGAATAGGGGCAGACCAGAATGACTATAGCCGTATGGGTCAAAGCTGGTCTAAACCCGTACTCGCGA
ACATCCGTTATAACGGTTCTATTAGACGCGTCCTGATTGTTGGCGGTGGTTATGATCAGTGTTATGAAAAACCAAATATT
ACGTTGACTGACGCTTGCTTTACCAATGGAAAAGCAAAAGGAAATGCTGTCTATATTATTGACGCAAAAACTGGTCAGCG
TTTGTGGTGGACAAGTGATACAGGTTCTAATACTGATAACGCCAATATGAAGCATAGTATTGTTAGCCGTATTAGTACTT
TAGACCGTGATGCTGATGGCTTAGTCGACCATCTATATTTTGGAGATTTAGGCGGACAAATTTTTCGCGTAGACCTTAAT
AATAATCAGACAAAAACCAATTCGACCTATAGCAGTTTTGGTGTCAGAGTTGTGCGTTTAGCGAATTTAGCAACAAATGA
TTCAACTTATGATGGCACAAATGATTATACAGGTGGGAATGCTCCTCGTTTTTATGAGCCTCCAACAGTAACGATCCACG
ATTATGGAATTCACACTTTTATTACAGTAGGAATTGCATCAGGAGACCGTAGTACACCTTTAGATGTTTACCCACTCACA
GGTCGTGAAGGTATGACGCCTGCAAGTGCATTAAGTGGACGTCCTGTAAATAATGTATATGGAATTATTGATAGAGACTT
TGTTAAAAAGAACTTAATGTCTTTAACTGATAATCAGCTTGAAACAAAAGATATTACACGGACAGGCTTAAGAAAAAATC
CACAAATTCTAAGAACAGGTGAAACAAGAGTAGCTCAAATTTTCTTCCCAACTACAGGAGTAGGTAAAGGTGGTTGGTAT
CGCTCGCTTTCTAGTACGAGCGATGGTACAGAAAAAGCTAATAATAGTTTTCGTATTAAAGGAGGACTCAAAGCTTTTGA
GGAACCAATGGCAATTACGGGTAATTTAATTATTCTAGTTTATGACCCTCAAGGAACGGGAATTGTTGCGGCAGATCCTT
GCCTACCTCGTGTTGTGGGAGAAACAGACCGACAAACTTATTGTTTACCATTTGGAGCTTGTCTTAATTCTGATGGGTCA
ATCGATCAAAATAAAGAGAATCACAGTGGGTTTGAAACACAAACTGGTACTAATTGCCCAGTAGGGGCTTCTGAATGTAA
TAAAAACGTTATTGGCTCTGGTATTCGTAGCGTAACATTTGTACCAACGGAGGATAACCCACCTACGACTAATAGTTGTG
GGAAATTAAAGCTGTCTGGTAATGAGCAAGGGACTGGACAGTGGCAATGTACGAGTCATTTAGTTCCTACGCGTTGGTAT
GAGCGTTATCGTTAA

Domains

Predicted by InterproScan.

• Neisseria PilC beta-propeller domain (T4P_PilY1) (715-964)

• von Willebrand factor type A domain (VWA_2) (51-162)

Similar proteins

Only experimentally validated proteins are listed.

Protein	Organism	Identities (%)	Coverage (%)	Ha-value
pilY1	Acinetobacter baumannii D1279779	90	100	0.904