Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | K6I41_RS03285 | Genome accession | NZ_CP082274 |
| Coordinates | 672945..677447 (+) | Length | 1500 a.a. |
| NCBI ID | WP_250375194.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter sp. AS23 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 667945..682447
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| K6I41_RS03260 (K6I41_03250) | - | 668384..669019 (-) | 636 | WP_013196908.1 | hypothetical protein | - |
| K6I41_RS03265 (K6I41_03255) | pilG | 669305..669688 (+) | 384 | WP_000389061.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| K6I41_RS03270 (K6I41_03260) | - | 669712..670074 (+) | 363 | WP_004789266.1 | response regulator | - |
| K6I41_RS03275 (K6I41_03265) | - | 670134..670670 (+) | 537 | WP_005309806.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| K6I41_RS03280 (K6I41_03270) | - | 670715..672796 (+) | 2082 | WP_107881234.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| K6I41_RS03285 (K6I41_03275) | chpA | 672945..677447 (+) | 4503 | WP_250375194.1 | hybrid sensor histidine kinase/response regulator | Regulator |
| K6I41_RS03290 (K6I41_03280) | - | 677447..677914 (+) | 468 | WP_198307108.1 | hypothetical protein | - |
| K6I41_RS03295 (K6I41_03285) | dapE | 677950..679086 (-) | 1137 | WP_250375195.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | - |
| K6I41_RS03300 (K6I41_03290) | - | 679213..679356 (-) | 144 | WP_003655297.1 | entericidin A/B family lipoprotein | - |
| K6I41_RS03305 (K6I41_03295) | - | 679479..680360 (-) | 882 | WP_250375196.1 | DUF1853 family protein | - |
| K6I41_RS03310 (K6I41_03300) | - | 680464..680823 (+) | 360 | WP_005309821.1 | YbaN family protein | - |
| K6I41_RS03315 (K6I41_03305) | elsL | 680922..681425 (+) | 504 | WP_198307111.1 | cell wall-recycling L,D-carboxypeptidase ElsL | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1500 a.a. Molecular weight: 171474.98 Da Isoelectric Point: 4.4604
>NTDB_id=600756 K6I41_RS03285 WP_250375194.1 672945..677447(+) (chpA) [Acinetobacter sp. AS23]
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Nucleotide
Download Length: 4503 bp
>NTDB_id=600756 K6I41_RS03285 WP_250375194.1 672945..677447(+) (chpA) [Acinetobacter sp. AS23]
ATGAAAGAAATATTAAAAACTTTAACTGAAGCAATGATGCTACCGGAAGATAGCTATTCTCAACAAGATGCTGAATTTCT
TGATATCTTCGTTGAAGAAATTGAAGAAATTTTTGTTGAATTGCAATCTTTGATTCATGAATGGATGCAATCTAAAAATG
TTGCTACGCTGACTGAGATCCGTCGCCATTTTCATACCTTGAAAGGTTCAGGGCGAATGATTGCAGCGAAATCCTCTGCT
GAGCTTGCTTGGACTGTAGAAGATACGCTTAATCGGATTATCAATGAGAGTCTCACATTAACTCCTAACATCCAACAATA
TGTTCAGTTGGTATTTAAGTTCTATTTCTTTAAATTAGTAGATGACTTTAAATCTAAAAAGGAACATGCAGTAGATTTTA
GACCTCTTATTTTATTGGGACAACAATTACAACAACAGCAAAGTTTAGAGCCTGCTTTAGAAGAACTTTTATTATTGTCT
GATACTCTCACTGCGGAAACTAAAACTGGTTTAGAGGTGAATGATTTAGAGCCGGTGTCAGATAATTTAATTCTAGAAAC
CACGATAGAAAGTGAACATAATCTTGCTGAAACCTTAGTTTTATTTATGGAAGAAGCGGAAGAGCACTTAGCGACCATTG
ATCAATTTTTAGAACAAGAAATACATCAGCACGAAAGTTATAATGCGCTCATACGTGCGTTACATACATTGCGCGGTAGC
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ACTTTCTTCTCATTCAGAAGAGATATTATTACTCCGTGATTACAGAAAGTTTATTCGAAATTGTTTAGATCTATTAGCTG
CACACTGCTCTAATGACCAATTAGATTCTGACCTGAAACAATTCAATCAGGTTTGGGATGCGTATATGGAGCAGCATGGG
GAGCATTCAAGCCCACTCATGCCTCCACATGGTCTGGTATCTCAGCTGTTACAGCTCAATGTTTCAGAATTACTTGATGC
AGAGTTAGATTTTGAGAAGGGAATTCGTTCTGAGTTTCCTCACTATCTTGAACGATTAAGTGAACAAGCTAACTTGTTAC
TGCAACATACTCAGTCTCAGGCCATGGTTGGTTTATATGAATATACGAACCAACTAAAAGATAGCTATGATGTATTGCTT
GATCGACCTGATTTATTGCAATCAGATTATGTTTTTGAAATTTATCAGAAAGCACATCAACAATTAATTCAGTTATTTGA
CGCATTAGCTGCGGGTCAAAGAGTTAGTATTATTGAGCAACACCAAAATGTTTTGGAAGAGCTAAAACTATATACCCAAC
ATATTCCAAGCCTTAATTCTGAACCATTAGATAATCAGGATGTTGTTGAATCATTATTTAGTGTTGATGTAGAACAAACA
TCAGATGAATCTCCGGCATCTATCGAAAGTGTATTAACTGATCATGTAGCAATGAGTCAGAGTATGCATTTAGATCGCCA
GTTCATGACTACTGAGCACGTAAATCGTTATTTTGATCCAGAACTGTTAGATATTTTTCTTGAAGAAGCTGATGAGTTGC
TTGAAGGAATGGATACAGATCTTAATATTTGGGTTAATGATCAAGAGAACTTTGCTGCTCTTAATAACCTGATGCGTTAT
TTGCATACCTTAAAAGGTGGGGCAAATATGATTCAGGCAAATTATATTGGTTTAATTGCACATGAATTAGAAAGTATTTA
TGAGCGCATAATTCAAAGACAGTTGGTTGCTTCATCTGCTCTTATTGATTTTATCCGTCTGGTTCAAGATGATTTAGCTG
ACCGTCTACAAATAGTACGTGAGCAGCACCTCGATTATGCTGCTTTTCATACTATTCAAGCGCTTAAGAGTGCCGGTAAG
GTATATGAGTCACTTGGCTCTGTTGTTGAAGAGATGCAAGCAGAGTCTGAAACAGATGTTATATCAGAATTAAATGTTGA
AGTATTACAGCAAGAAGCTATACACGATACTGCGTTAAATCTCGATGAGTTAACTTCTAATTTTGAGCAGATTGTTGAGT
CTAATACTCGACTTGTTGAGCACACAGAATTACAAATTTTTGATGCAGAAGGCTATACAGACAGTATCCAAGATCAGGAT
ATTGATTCTGTTGTCGAGCAGACATTTATGGAGGAAGCGGCCGAGCTGTTAGAGATGGCCGATCATCTGTTAAAGCAGTG
GTTTGAGCAGCGTACCAATCGTAGTATCTTGCTTCAGCTACAAAGAGCAGTGCACAGTTTGAAGGGGGGGTCCCGTATGT
TGGGACTAGAAACTGTGCAAGCAATTGCTTATCAACTTGAGAATGCTTTTGAAAAATTTGCGCTTTATCATTTTAGTTCA
AATATTTATGACAACCTATTAGAGAGTGCAATTGTCTGGTTAAAAGAGGCAATTTTTAAGCAAAATTATCAACATTTCGA
TGGTTTACAGCATAGTCTAGAAAATATTCAGTTTATTGAAACGGCAATTCAAATTCCGAGTAAATTGACTAGAACTGATC
TATTTGGCACGGAACCTGTAATGAGTTTTGTACAAGGTGATGGTACAGAACCACCGCCAATGATGGGTGCATGGGAACAT
ACCCAGCATCTTGAACAAAACAATGAGATGATTCGTGTTTCAGCAGATTTAATCGAGAAAATGATTGATTTGTCTGGTGA
AAATTCGATTAACCGTTCACGAATTGAAATGGATCTAAGTCAATTTGGTCATACGCTCGTAGAAATGGAATTAGCCATTC
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CGTTATACAGAATTTGATCCTCTAGAGATGGATCAATATTCTTCATTGAATCAATTATCGAAATCACTTGCCGAATCTGC
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TTCAGGCTGAAATTCAAGAAGGGCTAATGCGAACGCGATTAGTACCATTCTCTCGATTGCTACCTCGTTTACAACGAATT
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GCTAGAGCGTTTGGTTACACCGCTTGAGCACATGCTTCGAAATGCAATTGACCACGGTCTAGAAGATCGTGTGCAACGCG
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GATGATGGTCGAGGTATTGATATTGAGAAGGTCCGTCAAAAGGCTCTCTTGTCTGGTTTGATTAATTCTGAACAAGTATT
AGAACATCAAGATATTTTGCAGTTGATTTTCCATCCAGGGTTAAGTACAGCCGATCAAGTCACTCAGATTTCAGGTCGTG
GTGTAGGGCTTGATGTTGTACAAAGTGATATTAAAGCTTTGGGCGGACATGTGACTGTTGACTCTGTTTATGGGCAAGGA
ACAATCTTTACCATACGTGTTCCAACCACAGTAGCTGTTAGTGATGCCTTGATGGTTAAAGTTGCTGATCAACAATTTGC
AATTCCGTTAGCTCAAATCGATCGAATTGTTCGAGTTTCACCAACATCGTTAGAACAGTATTTTGGAAGTGCACAAGAGT
TCTTTGAATTTGAAAATAAACGCTATCCATTACGCTATTTATCTGAGTTTGTTGGTAATCAACCGATTCCACGTTTAAGT
GGGATGATGTATTCGCTACCAGTATTAATGATTAAGGCCAATAATGGGCAAACCATTGCATTATTGGTTGATCAACTTAT
TGGTTCACGTGCGCAGATTGTAGTTAAGCCAATCGGGCAGCAGTTCTCTAGTATTGGTGCGATTGCAGGTGCAACTATTT
TAGGTGATGGTCAAGTTTGTCTAATTTTAGATGGACAAAATATTGCTCGCCAAATTCAGTCTACTCGTCGACATAAGTCG
CTCAATGAGACTGTCTATAGACAACGCGAGTCTGACGAACGCCGTCTCATTATGATTGTAGATGACTCTGTTACAGTCCG
TAAGGTAACGACTCGTTTACTCGAACGTCAGGGCTATGACGTAGTCACTGCTAAAGATGGTATTGATGCAATTGAGCAGT
TGGAAAATATTAAGCCAGATCTAATGTTGCTTGATATTGAAATGCCGCGAATGGATGGTTTTGAGGTACTTAACCTCGTA
CGACATCATGATCTACATCAACATATGCCAGTCATTATGATTACATCAAGAACTGGTGAAAAACACCGTGAACGAGCATT
TGCTTTAGGAGTTAACCAATACATGGGTAAACCTTTCCAAGAAGAAGACTTACTTCACAATATTGATGCTTTTTTCACGA
CACGTGAAGAGGAGCTTGCCTAA
ATGAAAGAAATATTAAAAACTTTAACTGAAGCAATGATGCTACCGGAAGATAGCTATTCTCAACAAGATGCTGAATTTCT
TGATATCTTCGTTGAAGAAATTGAAGAAATTTTTGTTGAATTGCAATCTTTGATTCATGAATGGATGCAATCTAAAAATG
TTGCTACGCTGACTGAGATCCGTCGCCATTTTCATACCTTGAAAGGTTCAGGGCGAATGATTGCAGCGAAATCCTCTGCT
GAGCTTGCTTGGACTGTAGAAGATACGCTTAATCGGATTATCAATGAGAGTCTCACATTAACTCCTAACATCCAACAATA
TGTTCAGTTGGTATTTAAGTTCTATTTCTTTAAATTAGTAGATGACTTTAAATCTAAAAAGGAACATGCAGTAGATTTTA
GACCTCTTATTTTATTGGGACAACAATTACAACAACAGCAAAGTTTAGAGCCTGCTTTAGAAGAACTTTTATTATTGTCT
GATACTCTCACTGCGGAAACTAAAACTGGTTTAGAGGTGAATGATTTAGAGCCGGTGTCAGATAATTTAATTCTAGAAAC
CACGATAGAAAGTGAACATAATCTTGCTGAAACCTTAGTTTTATTTATGGAAGAAGCGGAAGAGCACTTAGCGACCATTG
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ACTTTCTTCTCATTCAGAAGAGATATTATTACTCCGTGATTACAGAAAGTTTATTCGAAATTGTTTAGATCTATTAGCTG
CACACTGCTCTAATGACCAATTAGATTCTGACCTGAAACAATTCAATCAGGTTTGGGATGCGTATATGGAGCAGCATGGG
GAGCATTCAAGCCCACTCATGCCTCCACATGGTCTGGTATCTCAGCTGTTACAGCTCAATGTTTCAGAATTACTTGATGC
AGAGTTAGATTTTGAGAAGGGAATTCGTTCTGAGTTTCCTCACTATCTTGAACGATTAAGTGAACAAGCTAACTTGTTAC
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GATCGACCTGATTTATTGCAATCAGATTATGTTTTTGAAATTTATCAGAAAGCACATCAACAATTAATTCAGTTATTTGA
CGCATTAGCTGCGGGTCAAAGAGTTAGTATTATTGAGCAACACCAAAATGTTTTGGAAGAGCTAAAACTATATACCCAAC
ATATTCCAAGCCTTAATTCTGAACCATTAGATAATCAGGATGTTGTTGAATCATTATTTAGTGTTGATGTAGAACAAACA
TCAGATGAATCTCCGGCATCTATCGAAAGTGTATTAACTGATCATGTAGCAATGAGTCAGAGTATGCATTTAGATCGCCA
GTTCATGACTACTGAGCACGTAAATCGTTATTTTGATCCAGAACTGTTAGATATTTTTCTTGAAGAAGCTGATGAGTTGC
TTGAAGGAATGGATACAGATCTTAATATTTGGGTTAATGATCAAGAGAACTTTGCTGCTCTTAATAACCTGATGCGTTAT
TTGCATACCTTAAAAGGTGGGGCAAATATGATTCAGGCAAATTATATTGGTTTAATTGCACATGAATTAGAAAGTATTTA
TGAGCGCATAATTCAAAGACAGTTGGTTGCTTCATCTGCTCTTATTGATTTTATCCGTCTGGTTCAAGATGATTTAGCTG
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GTATATGAGTCACTTGGCTCTGTTGTTGAAGAGATGCAAGCAGAGTCTGAAACAGATGTTATATCAGAATTAAATGTTGA
AGTATTACAGCAAGAAGCTATACACGATACTGCGTTAAATCTCGATGAGTTAACTTCTAATTTTGAGCAGATTGTTGAGT
CTAATACTCGACTTGTTGAGCACACAGAATTACAAATTTTTGATGCAGAAGGCTATACAGACAGTATCCAAGATCAGGAT
ATTGATTCTGTTGTCGAGCAGACATTTATGGAGGAAGCGGCCGAGCTGTTAGAGATGGCCGATCATCTGTTAAAGCAGTG
GTTTGAGCAGCGTACCAATCGTAGTATCTTGCTTCAGCTACAAAGAGCAGTGCACAGTTTGAAGGGGGGGTCCCGTATGT
TGGGACTAGAAACTGTGCAAGCAATTGCTTATCAACTTGAGAATGCTTTTGAAAAATTTGCGCTTTATCATTTTAGTTCA
AATATTTATGACAACCTATTAGAGAGTGCAATTGTCTGGTTAAAAGAGGCAATTTTTAAGCAAAATTATCAACATTTCGA
TGGTTTACAGCATAGTCTAGAAAATATTCAGTTTATTGAAACGGCAATTCAAATTCCGAGTAAATTGACTAGAACTGATC
TATTTGGCACGGAACCTGTAATGAGTTTTGTACAAGGTGATGGTACAGAACCACCGCCAATGATGGGTGCATGGGAACAT
ACCCAGCATCTTGAACAAAACAATGAGATGATTCGTGTTTCAGCAGATTTAATCGAGAAAATGATTGATTTGTCTGGTGA
AAATTCGATTAACCGTTCACGAATTGAAATGGATCTAAGTCAATTTGGTCATACGCTCGTAGAAATGGAATTAGCCATTC
AACGACTTGCAGATCAGTTACGTCGAATGGAAGGCGAATTAGAAACCCAGATTATTGCAAAACACGGTATTGAGCACTCT
CGTTATACAGAATTTGATCCTCTAGAGATGGATCAATATTCTTCATTGAATCAATTATCGAAATCACTTGCCGAATCTGC
ATCCGACTTAGTCGATTTCAAAAATACATTATCCGAAAAAATCAGAGATACCGAAAGTTTATTGGTACAGCAATCACGTA
TTCAGGCTGAAATTCAAGAAGGGCTAATGCGAACGCGATTAGTACCATTCTCTCGATTGCTACCTCGTTTACAACGAATT
GTGAGACAGACTTCTACTGCATTGGATCGACCAGCAGAACTTTTTGTTAATAATACCGAAGGTGAGCTAGACCGGACAAT
GCTAGAGCGTTTGGTTACACCGCTTGAGCACATGCTTCGAAATGCAATTGACCACGGTCTAGAAGATCGTGTGCAACGCG
AACAAGCAAAAAAAACAGAAACTGGACGTATTGAACTAAATATTCACCGTCAAGGTACGGATGTTGTTGTTACGTTTAAA
GATGATGGTCGAGGTATTGATATTGAGAAGGTCCGTCAAAAGGCTCTCTTGTCTGGTTTGATTAATTCTGAACAAGTATT
AGAACATCAAGATATTTTGCAGTTGATTTTCCATCCAGGGTTAAGTACAGCCGATCAAGTCACTCAGATTTCAGGTCGTG
GTGTAGGGCTTGATGTTGTACAAAGTGATATTAAAGCTTTGGGCGGACATGTGACTGTTGACTCTGTTTATGGGCAAGGA
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CACGTGAAGAGGAGCTTGCCTAA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
79.073 |
100 |
0.796 |