Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | I9190_RS17880 | Genome accession | NZ_CP066121 |
| Coordinates | 3871965..3876458 (-) | Length | 1497 a.a. |
| NCBI ID | WP_151781311.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter bereziniae strain GD0320 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 3866965..3881458
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| I9190_RS17860 (I9190_17860) | - | 3866986..3867483 (-) | 498 | WP_119386286.1 | hypothetical protein | - |
| I9190_RS17865 (I9190_17865) | fimA | 3867537..3868073 (-) | 537 | WP_009585666.1 | type 1 fimbrial major subunit FimA | - |
| I9190_RS17870 (I9190_17870) | - | 3868471..3870534 (-) | 2064 | WP_151781682.1 | EAL domain-containing protein | - |
| I9190_RS17875 (I9190_17875) | - | 3871489..3871956 (-) | 468 | WP_009586246.1 | hypothetical protein | - |
| I9190_RS17880 (I9190_17880) | chpA | 3871965..3876458 (-) | 4494 | WP_151781311.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| I9190_RS17885 (I9190_17885) | - | 3876603..3878672 (-) | 2070 | WP_004827618.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| I9190_RS17890 (I9190_17890) | - | 3878715..3879251 (-) | 537 | WP_004827616.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| I9190_RS17895 (I9190_17895) | - | 3879255..3879623 (-) | 369 | WP_004827615.1 | response regulator | - |
| I9190_RS17900 (I9190_17900) | pilG | 3879644..3880027 (-) | 384 | WP_004827613.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| I9190_RS17905 (I9190_17905) | - | 3880312..3880953 (+) | 642 | WP_171496514.1 | hypothetical protein | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1497 a.a. Molecular weight: 169267.17 Da Isoelectric Point: 4.4388
>NTDB_id=517523 I9190_RS17880 WP_151781311.1 3871965..3876458(-) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain GD0320]
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Nucleotide
Download Length: 4494 bp
>NTDB_id=517523 I9190_RS17880 WP_151781311.1 3871965..3876458(-) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain GD0320]
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AAGATAAGGAATTGGTGAATGTACGTCGCTATTTCCATACCCTTAAAGGCTCTGGACGTATGGTGGGGGCAAAGCGTTCA
GGTGAGTTGGCTTGGACTGTTGAAGATACATTAAATCGTGTAATTGCAAAAAACTTGGAATTAAGTACTGAAATTCAACA
ATATGTCAGTGCTGTATTTAATGTGTATAAGTTCAAATTGTATGCTGAGTTTTTAAATAAACAACCACATCATTTAGATT
TGGCACCATTGGTGTATTTGGGGCAACAATTACAGCAGAAACAGAGTTTAGAACCTGCTTTGGCGGATCTACTGTCACTT
GCGCATACCCTCAATCATGAGAATGTGCTGACGGGTTTAGAAATTGCTGATAGCGAGCCACTTGTAGAGCATATAGAAAC
AGTAGCAGCTATGGCAAACCACGAAAATGCCGAAGAGCATGCAGTGGCAGACCTGATTCAAATTGATGAATCTGCTGTGG
AAACAACGCCGACTTCGGATGAAAGTTTAATCTCTGAAACCCTGACGATTTTTGTTGAAGAGTCGGAAGAACATCTGGCA
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AAGAAGATACGGAGTCTTCTAAAAATGAAAACGCCCTATTGACTTATTATGCTGAATTCGTCAGTGATTATTTGCATGTA
CTCAAGCAAACCGGTGATCAAGATACGCAATTAGCCCAGATTTATCAAAAATTTAATGATGCTTGGGAGCGTTATGATTT
CCAACATCAATATCAACAAGATCATCAGTCACAAGCAGGTTTAGTGACTCAATTGGTCGATTTGGAAATTGATCTATTGT
TGGATGCTGAATTCGAGTTTGATAAACGCGCTCAAGTTGAATATCCAGAATATTTCCAACAACTGATTCAACAGGCTCAG
ATCCTCGTCGATCATACCGACAATCGTGCGTCACAAGGTATTCATGATTTCAGTCTTGCACTCAAAGACGGATATACACA
GATTATTGCCAAGCCTGATTTGTTGAATACGGATTATGCTTTCGAAATATTCTCTAAAGCACATCAAGAATTCATTCATT
TATTTGATACCTTGGCATCTGGTCAGCGTGTCAGCTTGAGTGGTGCAACTCAGGCGATTTTGGATGAGCTTCATGATTAT
GTACATCAAGAAATTGATGTAGACCAGATTCAAATTGCTGAACCAAGCATTGAGCCAGCAGTTCAACATGCGGTAGTAGC
TGTATCTGATATTAACGCTGTTGAGACAGGTAATCATTATGTCTTAACTCAAATTAATCTCGATAAGCAAAATATAGATT
CTGCGCAAAGTCAGCGTGAGTTTGATGCTGACGTTCTTGATATTTTTATTGAGGAGGCAGATGAGCTGTTGGTAGGTATG
GATCATGACCTAAATACATGGTCAAGTCATCCAGATGATACCACTGCACTCAATAATTTAATGCGCTATTTGCACACTTT
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TTAAAGGTCAGCTCAAAGCTGGACCACAAGTTATTCAATCTATTCGTTTGATTCAAGATGATGTCGCAGATCGTATTCAG
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GCATGATACGAATGTTGAGATAGCTGAAAAAGCCCAAGATGAGATTGTTTTAGTTGACGAGTCTGTTACTCCAGAATTTG
ATGTTATTTCTGCAGATCAGCAGCAAGCAACGCTTGAACAAGCTGAGCCATTCGTTGAACAGATTCAAGTACATGACTTG
GATGACGCCGAACGTGTTGCTCAAGAAACCTTCATTGAGGAAGCTCGTGAGCTGATTGATGATGGGTTAAATATCTTGAA
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AAATGGTGAAATTGGAAGGTGTTGCGGATATTGCTTATGAGCTTGAAAATGCATTTGAACAATTTGGTCAGCACAACTTT
AATTCCAATGTCTATGACGGTTTATTGGAAAGTGCTTTTCACTGGTTAGATGCAGCAATTTTCAAACAGAGTTACGATAA
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CCAATTTGATTTTTGAACAGACCAATAATGAGTTTGTTCAAGGAGATGGAACTGAACCACCATCTATGTTGGGTGAATGG
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CACGTATTCAAGCTGAAATTCAAGAAAGCCTGATGCGTACCCGACTTGTTCCTTTCTCTCGTTTATTACCACGATTACAG
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ATGACTATTTCGATATAGATTACCAAAGTTATAAATTGCGTTATCTTGGTGAGTTTACAGCCAATCAGGTGACGCCACGT
TTACATGGCTTTGCACATTCATTACCTGTGTTATTGATTAAAGGGAGCTTAGGTCAATCTGTCGCGATTCTGGTTGATCA
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TTGGTTCGCCATCATGAAATTCATCGTGACTTGCCAATTATTATGATTACCTCACGAACAGGTGAAAAACATCGCGAACG
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TGACGGTTAAATAG
ATGAAAGAAATATTAAAACATTTAGTTGAACACGTCACTTTACCTGAAGATGCTTATCTTGATCAGGATGATGAGATTTT
AGAAATTTTTGTAGAAGAACTTGAAGAAATTTTTGAACAGTTGCAAGCTTCTCTTGATCAATGGCTAAATGATGAGTCCA
AAGATAAGGAATTGGTGAATGTACGTCGCTATTTCCATACCCTTAAAGGCTCTGGACGTATGGTGGGGGCAAAGCGTTCA
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GCGCATACCCTCAATCATGAGAATGTGCTGACGGGTTTAGAAATTGCTGATAGCGAGCCACTTGTAGAGCATATAGAAAC
AGTAGCAGCTATGGCAAACCACGAAAATGCCGAAGAGCATGCAGTGGCAGACCTGATTCAAATTGATGAATCTGCTGTGG
AAACAACGCCGACTTCGGATGAAAGTTTAATCTCTGAAACCCTGACGATTTTTGTTGAAGAGTCGGAAGAACATCTGGCA
ACGATCAAAGACTTTTTGCATTTAGAGCAACATACACCGGAACAATATAATCGCTTGATTCGGGCATTACATACTTTGCG
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CCAACATCAATATCAACAAGATCATCAGTCACAAGCAGGTTTAGTGACTCAATTGGTCGATTTGGAAATTGATCTATTGT
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GATTATTGCCAAGCCTGATTTGTTGAATACGGATTATGCTTTCGAAATATTCTCTAAAGCACATCAAGAATTCATTCATT
TATTTGATACCTTGGCATCTGGTCAGCGTGTCAGCTTGAGTGGTGCAACTCAGGCGATTTTGGATGAGCTTCATGATTAT
GTACATCAAGAAATTGATGTAGACCAGATTCAAATTGCTGAACCAAGCATTGAGCCAGCAGTTCAACATGCGGTAGTAGC
TGTATCTGATATTAACGCTGTTGAGACAGGTAATCATTATGTCTTAACTCAAATTAATCTCGATAAGCAAAATATAGATT
CTGCGCAAAGTCAGCGTGAGTTTGATGCTGACGTTCTTGATATTTTTATTGAGGAGGCAGATGAGCTGTTGGTAGGTATG
GATCATGACCTAAATACATGGTCAAGTCATCCAGATGATACCACTGCACTCAATAATTTAATGCGCTATTTGCACACTTT
AAAAGGTGGCGCAAATATGGTTCAGGCGACGCATATTGGTTTAATTGCTCATGAACTCGAAACAATTTATGAGCGCGTGA
TTAAAGGTCAGCTCAAAGCTGGACCACAAGTTATTCAATCTATTCGTTTGATTCAAGATGATGTCGCAGATCGTATTCAG
TTGATTCGTGAAAAATCTATTGATTATCCTGCAACACACATTCTTGAGGTTTTACAGCATATTGATCAACAGCAATTCTT
GCATGATACGAATGTTGAGATAGCTGAAAAAGCCCAAGATGAGATTGTTTTAGTTGACGAGTCTGTTACTCCAGAATTTG
ATGTTATTTCTGCAGATCAGCAGCAAGCAACGCTTGAACAAGCTGAGCCATTCGTTGAACAGATTCAAGTACATGACTTG
GATGACGCCGAACGTGTTGCTCAAGAAACCTTCATTGAGGAAGCTCGTGAGCTGATTGATGATGGGTTAAATATCTTGAA
TCAATGGTTTGATCAACGAAGTAACCGTAGTTTACTACTTCAATTGCAACGTATTGCACACAGCTTAAAAGGCGGTGCAA
AAATGGTGAAATTGGAAGGTGTTGCGGATATTGCTTATGAGCTTGAAAATGCATTTGAACAATTTGGTCAGCACAACTTT
AATTCCAATGTCTATGACGGTTTATTGGAAAGTGCTTTTCACTGGTTAGATGCAGCAATTTTCAAACAGAGTTACGATAA
TTTTGATGGTTTGAAGTTAAATTTAAACCGTATGCAATATGTCGATGTTTCTGCTCAGCTTCCAGAAAAATTATCTCGAA
CCAATTTGATTTTTGAACAGACCAATAATGAGTTTGTTCAAGGAGATGGAACTGAACCACCATCTATGTTGGGTGAATGG
GATCTTTCTGAAAAAACTGAAACCAATAATGAGATGATTCGTATCTCTGCGGATTTGGTTGAGAAGATGATCGATCTTTC
TGGTGAAAATGCCATCAACCGTTCGCGTATTGAAATGGATTTGGGTCAATTGGGAAATACATTGACCGATATGGAGCTTG
CGATTCAACGTTTGGCAGATCAGCTTCGTCGAATGGAAGGCGAGTTGGAAAGTCAAATTATTGCTAAACATGGGGATTTA
AGTGCGCGCTATGCGGACTTTGACCCATTGGAAATGGACCAATATTCATCCTTGAATCAATTGTCTAAATCGCTTGCTGA
ATCTGCATCCGACTTGGTGGACTTTAAAACCACCTTAGCAGAGAAAATTCGTGATACTGAAGGCTTATTATTGCAACAGT
CACGTATTCAAGCTGAAATTCAAGAAAGCCTGATGCGTACCCGACTTGTTCCTTTCTCTCGTTTATTACCACGATTACAG
CGTTTGGTACGCCAAACAGCCTCGACGGTCAATAAGCCTACCGAACTGTTGGTGAATAATACGGAAGGTGAATTAGATCG
TAATATTTTGGAGAAATTAGTATCTCCATTAGAGCATATGTTGCGTAATGCCATCGACCACGGGATCGAAGATACAGAGC
AGCGACAAAAAGCTGGCAAGCCATTGACTGGTCGAATCGACTTGAATATTAGTCGCCAAGGTACCGATGTTTTGGTGTCC
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GCATTTAGAACCAGAAGAAATTTTACAATTTATTTTCCATCCTGGTTTTAGCACAGCACAACAAGTCACCCAGATTTCTG
GACGCGGTGTTGGACTGGATGTGGTTCAAAGTGAAATTAAATCGTTAGGTGGACAGGTCAGTGTAAGTTCTGAACTGGGG
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TGCATTCAGCTTGGGTGTGACAAACTATATGGGTAAACCATTCCAAGAGGCTGATTTATTAGCCAATATTGATGCTTTGT
TGACGGTTAAATAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
59.398 |
100 |
0.606 |