Detailed information
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | CQZ96_RS17300 | Genome accession | NZ_CP058272 |
| Coordinates | 3686440..3690966 (+) | Length | 1508 a.a. |
| NCBI ID | WP_105714353.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter sp. MYb10 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 3681440..3695966
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CQZ96_RS17275 (CQZ96_017305) | - | 3681939..3682580 (-) | 642 | WP_105714355.1 | hypothetical protein | - |
| CQZ96_RS17280 (CQZ96_017310) | pilG | 3682865..3683248 (+) | 384 | WP_004723803.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| CQZ96_RS17285 (CQZ96_017315) | - | 3683274..3683642 (+) | 369 | WP_004723801.1 | response regulator | - |
| CQZ96_RS17290 (CQZ96_017320) | - | 3683646..3684182 (+) | 537 | WP_004723799.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| CQZ96_RS17295 (CQZ96_017325) | - | 3684225..3686294 (+) | 2070 | WP_105714354.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| CQZ96_RS17300 (CQZ96_017330) | chpA | 3686440..3690966 (+) | 4527 | WP_105714353.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| CQZ96_RS17305 (CQZ96_017335) | - | 3690975..3691439 (+) | 465 | WP_105714352.1 | hypothetical protein | - |
| CQZ96_RS17310 (CQZ96_017340) | dapE | 3691516..3692649 (-) | 1134 | WP_004723792.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | - |
| CQZ96_RS17315 (CQZ96_017345) | - | 3692806..3692946 (-) | 141 | WP_004723791.1 | entericidin A/B family lipoprotein | - |
| CQZ96_RS17320 (CQZ96_017350) | - | 3693062..3693907 (-) | 846 | WP_105714351.1 | DUF1853 family protein | - |
| CQZ96_RS17325 (CQZ96_017355) | - | 3694134..3694532 (+) | 399 | WP_004723787.1 | YbaN family protein | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1508 a.a. Molecular weight: 170391.58 Da Isoelectric Point: 4.4364
>NTDB_id=463377 CQZ96_RS17300 WP_105714353.1 3686440..3690966(+) (chpA) [Acinetobacter sp. MYb10]
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Nucleotide
Download Length: 4527 bp
>NTDB_id=463377 CQZ96_RS17300 WP_105714353.1 3686440..3690966(+) (chpA) [Acinetobacter sp. MYb10]
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TCAACATTCGCAAACGGGTTTAGTCACACAATTGGTTGATCTTGAGATCGATCTATTGCTTGATGCCGAGTTTGAGTTTG
ATAAGCGTGCCCAAGTTGAATATCCAGCATATTTCCAACAACTGGCTCAACAAGCGCAGATGTTGATAGATCATACCAAT
AATCGTGCTGCACAAGGCATTCATGATTTTAGTCTTGCTTTAAAAGATGGTTATGAACAAGTTATTCGCAAGCCTGATTT
ATTAAATACTGATTATGCTTTTGAAATGTTTTCTAAGGCCCATCAGGAATTTATTCATTTATTCGATACTTTGGCATCAG
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CCCTGTTGAATCAGTAGGGAACTATGTACTGACGCAAATTAATCTGGATAAACAGAATATTGAATCAGAACATAGTCAAC
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ACTTGGTCAATTCATCCTGATGACACAACAGCACTAAACAATTTGATGCGTTATTTGCATACCTTAAAAGGTGGTGCAAA
TATGGTGCAAGCGACCCATATTGGTTTGATTGCGCATGAGTTAGAAACCATTTATGAACGCGTGATTAAAGGTCAACTCA
AAGCAGAACCACACATTATTCAAGCAATTCGTTTAATTCAAGATGATGTGGCAGATCGCATTCAATTGATTCGTGAAAAA
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ATAAGCGTGCCCAAGTTGAATATCCAGCATATTTCCAACAACTGGCTCAACAAGCGCAGATGTTGATAGATCATACCAAT
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ATTAAATACTGATTATGCTTTTGAAATGTTTTCTAAGGCCCATCAGGAATTTATTCATTTATTCGATACTTTGGCATCAG
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ACTTGGTCAATTCATCCTGATGACACAACAGCACTAAACAATTTGATGCGTTATTTGCATACCTTAAAAGGTGGTGCAAA
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AACGTATTGCACACAGCTTAAAAGGCGGTGCAAAAATGGTGAAATTGGAAGAAGTTGCTGATATTGCATATGAATTAGAA
AATGCATTTGAGCAATTTGGTTTACATAATTTTAACTCGAATGTTTATGATGGTTTACTGGAAAAAACCTTTCATTGGCT
AGATGCAGCAATCTTTAAACATCACTACGATAACTTTGAAGGCTTAAAGTCGAGTTTACATGGCATTGAATATGTTGATG
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ATCTCTAAACCAGTTATCAAAATCGTTGGCTGAATCTGCATCTGACTTGGTTGATTTTAAGACCACGTTGGCTGAAAAGA
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ATGCGATTGACCACGGGATTGAAGATGCGGAACAGCGTCAGAAGTCGGGCAAAGCGTTGACAGGTCGAATTGATTTGAAT
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AAGCTGATTTATTGGAAAATATTGAAGCTTTGTTGACGGTTAAATAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
59.043 |
100 |
0.597 |