Detailed information
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | GBN93_RS04485 | Genome accession | NZ_CP045103 |
| Coordinates | 967662..972161 (+) | Length | 1499 a.a. |
| NCBI ID | WP_234965501.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter johnsonii strain AJ413 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 962662..977161
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| GBN93_RS04460 (GBN93_04470) | - | 963134..963772 (-) | 639 | WP_234965499.1 | hypothetical protein | - |
| GBN93_RS04465 (GBN93_04475) | pilG | 964053..964436 (+) | 384 | WP_004694493.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| GBN93_RS04470 (GBN93_04480) | - | 964464..964832 (+) | 369 | WP_004694491.1 | response regulator | - |
| GBN93_RS04475 (GBN93_04485) | - | 964838..965374 (+) | 537 | WP_004694490.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| GBN93_RS04480 (GBN93_04490) | - | 965425..967497 (+) | 2073 | WP_234965500.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| GBN93_RS04485 (GBN93_04495) | chpA | 967662..972161 (+) | 4500 | WP_234965501.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| GBN93_RS04490 (GBN93_04500) | - | 972166..972621 (+) | 456 | WP_114837795.1 | hypothetical protein | - |
| GBN93_RS04495 (GBN93_04505) | dapE | 972687..973820 (-) | 1134 | WP_234965502.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | - |
| GBN93_RS04500 (GBN93_04510) | - | 973941..974081 (-) | 141 | WP_087010462.1 | entericidin A/B family lipoprotein | - |
| GBN93_RS04505 (GBN93_04515) | - | 974239..975117 (-) | 879 | WP_234965503.1 | DUF1853 family protein | - |
| GBN93_RS04510 (GBN93_04520) | - | 975215..975607 (+) | 393 | WP_234965504.1 | YbaN family protein | - |
| GBN93_RS04515 (GBN93_04525) | elsL | 975607..976110 (+) | 504 | WP_234965505.1 | cell wall-recycling L,D-carboxypeptidase ElsL | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1499 a.a. Molecular weight: 167304.91 Da Isoelectric Point: 4.3566
>NTDB_id=391951 GBN93_RS04485 WP_234965501.1 967662..972161(+) (chpA) [Acinetobacter johnsonii strain AJ413]
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Nucleotide
Download Length: 4500 bp
>NTDB_id=391951 GBN93_RS04485 WP_234965501.1 967662..972161(+) (chpA) [Acinetobacter johnsonii strain AJ413]
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ATCAAGAAACTTTGTTGAGCATACGCCGTCATTTCCATACCTTAAAAGGCTCTGGTCGTATGGTGGGGGCAAAGTCAGCA
GGTGAAACAGCGTGGGCAGTTGAAGACACCTTAAACCGTGTGATTTCAGGGGCTGTACCGCTTACGGCAACGGTTCAAAA
ATTTGCTAAAACAGTATTCAAACTGTTTCAATTTAAACTGTATCCGATATTCAAAGCGGTACAGGAGATTGATCTTGACC
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TCTAATCATCTAAATAGTGATAATGATGCGACAGGATTAGAGCTGAGTGATATCGAAGTGGCTGAATCTGAGCCACAAGT
TGCAGCTGCTCCTGAACAGGATGATCAAGTGCATGATGTCCTAGAAGAAACTTTAGCGATCTTCATTGAAGAGGCGGAAG
ATCATTTAGCAACTATCGATCAGTTTTTAAATGCAGATGAAGCAAAAGTACAAGATTACAATGGTTTAATCCGTGCTTTA
CATACACTGCGCGGTAGCTCGTCTATGGCGCAAATTGAGCATGTTTTTAATGCCAGCTCAAAAGTCGAAAATCTATTTAA
AACCTTGGTTCAAGAAGAGATCGTTTCTACCTCAAAGGAAATCTCTTTACTCACCCAATATGCTGAATTTGTACGTGACT
ATTTACACGTGCTTGGGCGTGGTACGAACGAACAGCTTGACGTGATTTACGCCACGTTCACTACGGCTTGGGATAACTAT
GGTTTCAGTATTGAAGACGTAGATGATGAGCTAAACCCACAAGGTATGGTCTCGAAGCTGATCGAGTTAAATATTGATCT
GTTGCTTGATGCCGAGTTTGAGTTTGATCAGCGTGCTAAGGTTGAATATCCTGAATATATTCAGCACTTAGGTGAACAAG
CAAAACAATTGCTAGAATTTACCAATAACCGTGCTGCTCAAGGAATTCATGACTTTACTTCTGAGTTATATGCGGGTTAT
CAAGCCTTACTGGAAAAGCCAGAATTACTTAATGTAGACTATGCATATGAGTTATTTGGTCAGGCACATCAAGAATTTAT
CCATTTATTTGATACTTTAGCAGCTGGTCAGCGCGTCATTCTGACTGAAGATGTACATAAAGTTCTGAATGAATTAATGG
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TTACAACCAAGCCTTGATCTTGCACAGATTTCGCAGCAAATTGCATCGGATCATCAGTACAAGCAATCGAATACAGCCAA
TACCGATTTTGATGATGATTTGCTTGATATCTTCTTGGAAGAAGCTGAAGAATTATTGATGGGGATGGATCAGGATCTTA
ATACTTGGTCTAAAAATGGCAATGATCCAGCAGCACTCAACAATTTAATGCGTTATTTGCACACCTTAAAAGGTGGTGCC
AATATGATTTCTGCACCTTTTATTGGTTCGATTGCACACGAATTAGAGTCTATTTATGAGCGTGTGATTCGTCAGCAAAT
AGCCACAACGCCACAGTTGATCAGCATCATTCGCTTAGTACAGGATGACGTCACAGACCGAATTCAGGTCATTCGTACCG
AGAAGGTTGATTATCCAGCAACAGCGACGATCAATGTACTGCATAACATTCAGAGCTTAGTTGAGGGTACGACTGTTACA
ACTACAGTATCTGAGCCTTTGGTTGAGGCGGTTGTCGCAGCAATTGAAGAGACTCAACCTCTAGTTCAAGAACCTTTATC
TAATGTAGACAGAATAATTGAAGTTGAAATAACTGCTGTTGAGTCAGCAACTGCGATTGAAGAGCCGAGTATAGTTGATA
ACACTGACGTTACTGTCGTTGAACAGCTGGATACTCCGTCACTTGTCCAAGAAGAAGCAGTCAGCGCTGTTGAAGAAGCA
GCTAGTCTTTTATCAATTGTTGAAGAAACCTTCTTGGAAGAAGCTGAAGAAATTTTAGCGACTACGGATGGCTTACTGAA
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AGTTCAAACGTGTATGACCCATTATTGCAAACTGCATTTGAATGGTTAAAACAAGCCATCTTCAAACGTGATTTTAGTAA
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AACTCGCGCTACGCAGACTTTGACCCCTTGGAAATGGACCAATATTCATCGCTGAATCAATTGTCTAAATCCTTAGCCGA
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ATCAAGAAACTTTGTTGAGCATACGCCGTCATTTCCATACCTTAAAAGGCTCTGGTCGTATGGTGGGGGCAAAGTCAGCA
GGTGAAACAGCGTGGGCAGTTGAAGACACCTTAAACCGTGTGATTTCAGGGGCTGTACCGCTTACGGCAACGGTTCAAAA
ATTTGCTAAAACAGTATTCAAACTGTTTCAATTTAAACTGTATCCGATATTCAAAGCGGTACAGGAGATTGATCTTGACC
TTCGACCACTGGTTTTAATTGGACAACAATTACAACAAAATCAAAGTTTAGAACCTGCACTAGAAGATTTGCTACAACTG
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TGCAGCTGCTCCTGAACAGGATGATCAAGTGCATGATGTCCTAGAAGAAACTTTAGCGATCTTCATTGAAGAGGCGGAAG
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CAAAACAATTGCTAGAATTTACCAATAACCGTGCTGCTCAAGGAATTCATGACTTTACTTCTGAGTTATATGCGGGTTAT
CAAGCCTTACTGGAAAAGCCAGAATTACTTAATGTAGACTATGCATATGAGTTATTTGGTCAGGCACATCAAGAATTTAT
CCATTTATTTGATACTTTAGCAGCTGGTCAGCGCGTCATTCTGACTGAAGATGTACATAAAGTTCTGAATGAATTAATGG
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TTACAACCAAGCCTTGATCTTGCACAGATTTCGCAGCAAATTGCATCGGATCATCAGTACAAGCAATCGAATACAGCCAA
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ATACTTGGTCTAAAAATGGCAATGATCCAGCAGCACTCAACAATTTAATGCGTTATTTGCACACCTTAAAAGGTGGTGCC
AATATGATTTCTGCACCTTTTATTGGTTCGATTGCACACGAATTAGAGTCTATTTATGAGCGTGTGATTCGTCAGCAAAT
AGCCACAACGCCACAGTTGATCAGCATCATTCGCTTAGTACAGGATGACGTCACAGACCGAATTCAGGTCATTCGTACCG
AGAAGGTTGATTATCCAGCAACAGCGACGATCAATGTACTGCATAACATTCAGAGCTTAGTTGAGGGTACGACTGTTACA
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TAATGTAGACAGAATAATTGAAGTTGAAATAACTGCTGTTGAGTCAGCAACTGCGATTGAAGAGCCGAGTATAGTTGATA
ACACTGACGTTACTGTCGTTGAACAGCTGGATACTCCGTCACTTGTCCAAGAAGAAGCAGTCAGCGCTGTTGAAGAAGCA
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GTATGGCGGAGAATGAACCCGTTGGTGCGATTGCTTATGAACTAGAAACTACATTTGAGCAATTTGCTGTACATAATTTC
AGTTCAAACGTGTATGACCCATTATTGCAAACTGCATTTGAATGGTTAAAACAAGCCATCTTCAAACGTGATTTTAGTAA
TTATGATGGTTTGAAAAATAGCTTAGCATCTATTGATTATGTGGATGTGATTGCGCAATTACCGACGCGTGTAACTCAAA
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CGGTGAAAATGCAATTAACCGTTCACGTATTGAAATGGATTTAGGTCAACTCGGCAATACGTTGAACGAGATGGAGCTTG
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AACGTAGCGCTGCGAAAAAATCAGCGACAGGCCAAATTGAACTAAACATTAGCCGTCAAGGTACAGACGTTATCGTCAGC
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GACGTGGTGTCGGTCTTGATGTGGTGCAAAGTGAAATTAAAGCACTGGGTGGACATGTTACGGTTGAGTCGGAAATTGGA
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
60.672 |
100 |
0.614 |