Detailed information
Overview
| Name | pilY1 | Type | Machinery gene |
| Locus tag | EA667_RS01770 | Genome accession | NZ_CP039930 |
| Coordinates | 360100..363954 (+) | Length | 1284 a.a. |
| NCBI ID | WP_024432273.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter baumannii strain TG29392 | ||
| Function | assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake |
||
Genomic Context
Location: 355100..368954
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| EA667_RS01740 (EA667_001740) | gmk | 355372..356001 (-) | 630 | WP_000015937.1 | guanylate kinase | - |
| EA667_RS01745 (EA667_001745) | ispH | 356124..357074 (+) | 951 | WP_000407064.1 | 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase | - |
| EA667_RS01750 (EA667_001750) | fimU | 357244..357717 (+) | 474 | WP_001214065.1 | Tfp pilus assembly protein FimT/FimU | Machinery gene |
| EA667_RS01755 (EA667_001755) | pilV | 357711..358271 (+) | 561 | WP_002194578.1 | type IV pilus modification protein PilV | Machinery gene |
| EA667_RS01760 (EA667_001760) | pilW | 358272..359273 (+) | 1002 | WP_000079197.1 | PilW family protein | Machinery gene |
| EA667_RS01765 (EA667_001765) | pilX | 359270..360088 (+) | 819 | WP_000149374.1 | PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein | Machinery gene |
| EA667_RS01770 (EA667_001770) | pilY1 | 360100..363954 (+) | 3855 | WP_024432273.1 | PilC/PilY family type IV pilus protein | Machinery gene |
| EA667_RS01775 (EA667_001775) | pilY2 | 363967..364449 (+) | 483 | WP_001046416.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| EA667_RS01780 (EA667_001780) | pilE | 364446..364871 (+) | 426 | WP_000788339.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| EA667_RS01785 (EA667_001785) | rpsP | 365018..365269 (+) | 252 | WP_000260334.1 | 30S ribosomal protein S16 | - |
| EA667_RS01790 (EA667_001790) | rimM | 365289..365837 (+) | 549 | WP_000189236.1 | ribosome maturation factor RimM | - |
| EA667_RS01795 (EA667_001795) | trmD | 365883..366623 (+) | 741 | WP_000464598.1 | tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD | - |
| EA667_RS01800 (EA667_001800) | rplS | 366831..367199 (+) | 369 | WP_000014562.1 | 50S ribosomal protein L19 | - |
| EA667_RS01805 (EA667_001805) | - | 367252..368193 (-) | 942 | WP_086223958.1 | lipase family alpha/beta hydrolase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1284 a.a. Molecular weight: 138018.47 Da Isoelectric Point: 7.7511
>NTDB_id=361046 EA667_RS01770 WP_024432273.1 360100..363954(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain TG29392]
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Nucleotide
Download Length: 3855 bp
>NTDB_id=361046 EA667_RS01770 WP_024432273.1 360100..363954(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain TG29392]
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GGTTATTTACGAGCTTTTGAGCCAAATCCAGCTAACACGTACTTAACATGGCGTGGAAATTTAAAGAAATATCATGTTGT
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TTTGATCCATCAACTGGACAAAATATTTTAAAAGCTTTTCCTATAAGCTTGAAATTAAAAATATTAAATTATTTAGGTTA
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| pilY1 | Acinetobacter baumannii D1279779 |
88.45 |
100 |
0.889 |