Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | uvrA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | FGL89_RS06700 | Genome accession | NZ_CP042374 |
| Coordinates | 1337353..1340217 (+) | Length | 954 a.a. |
| NCBI ID | WP_014974740.1 | Uniprot ID | K0DB88 |
| Organism | Leuconostoc carnosum strain CBA3620 | ||
| Function | homologous recombination (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 1332353..1345217
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| FGL89_RS06685 (FGL89_06685) | - | 1332506..1332772 (+) | 267 | WP_014974743.1 | YkuJ family protein | - |
| FGL89_RS06690 (FGL89_06690) | - | 1332841..1335000 (+) | 2160 | WP_014974742.1 | LTA synthase family protein | - |
| FGL89_RS06695 (FGL89_06695) | uvrB | 1335223..1337229 (+) | 2007 | WP_014974741.1 | excinuclease ABC subunit UvrB | Machinery gene |
| FGL89_RS06700 (FGL89_06700) | uvrA | 1337353..1340217 (+) | 2865 | WP_014974740.1 | excinuclease ABC subunit UvrA | Machinery gene |
| FGL89_RS08660 | - | 1340270..1340392 (-) | 123 | WP_014974739.1 | putative metal homeostasis protein | - |
| FGL89_RS06705 (FGL89_06705) | - | 1340632..1341606 (+) | 975 | WP_014974738.1 | gluconeogenesis factor YvcK family protein | - |
| FGL89_RS06710 (FGL89_06710) | whiA | 1341606..1342550 (+) | 945 | WP_014974737.1 | DNA-binding protein WhiA | - |
| FGL89_RS06715 (FGL89_06715) | clpP | 1342730..1343332 (+) | 603 | WP_014974736.1 | ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit | Regulator |
| FGL89_RS06720 (FGL89_06720) | - | 1343607..1344602 (+) | 996 | WP_014974735.1 | D-2-hydroxyacid dehydrogenase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 954 a.a. Molecular weight: 105596.99 Da Isoelectric Point: 6.4254
>NTDB_id=331542 FGL89_RS06700 WP_014974740.1 1337353..1340217(+) (uvrA) [Leuconostoc carnosum strain CBA3620]
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Nucleotide
Download Length: 2865 bp
>NTDB_id=331542 FGL89_RS06700 WP_014974740.1 1337353..1340217(+) (uvrA) [Leuconostoc carnosum strain CBA3620]
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Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| uvrA | Streptococcus pneumoniae R6 |
68.365 |
98.742 |
0.675 |
| uvrA | Streptococcus pneumoniae TIGR4 |
68.365 |
98.742 |
0.675 |
| uvrA | Streptococcus pneumoniae D39 |
68.365 |
98.742 |
0.675 |