Detailed information
Overview
| Name | rexA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | DZM45_RS06215 | Genome accession | NZ_CP031638 |
| Coordinates | 1232420..1236052 (-) | Length | 1210 a.a. |
| NCBI ID | WP_021340765.1 | Uniprot ID | Q48UB8 |
| Organism | Streptococcus pyogenes strain MGAS8347 | ||
| Function | homologous recombination (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 1227420..1241052
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| DZM45_RS06190 (DZM45_06190) | rpoD | 1227599..1228708 (-) | 1110 | WP_002985187.1 | RNA polymerase sigma factor RpoD | - |
| DZM45_RS06195 (DZM45_06195) | dnaG | 1228717..1230531 (-) | 1815 | WP_011284666.1 | DNA primase | - |
| DZM45_RS06200 (DZM45_06200) | mscL | 1230661..1231023 (+) | 363 | WP_002990299.1 | large conductance mechanosensitive channel protein MscL | - |
| DZM45_RS06205 (DZM45_06205) | rpsU | 1231151..1231327 (-) | 177 | WP_000048058.1 | 30S ribosomal protein S21 | - |
| DZM45_RS06210 (DZM45_06210) | - | 1231468..1232280 (-) | 813 | WP_002990394.1 | transporter substrate-binding domain-containing protein | - |
| DZM45_RS06215 (DZM45_06215) | rexA | 1232420..1236052 (-) | 3633 | WP_021340765.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| DZM45_RS06220 (DZM45_06220) | rexB | 1236049..1239264 (-) | 3216 | WP_011284663.1 | ATP-dependent nuclease subunit B | Machinery gene |
| DZM45_RS06225 (DZM45_06225) | - | 1239415..1240332 (+) | 918 | WP_011284662.1 | neutral zinc metallopeptidase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1210 a.a. Molecular weight: 138963.11 Da Isoelectric Point: 6.5805
>NTDB_id=268485 DZM45_RS06215 WP_021340765.1 1232420..1236052(-) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain MGAS8347]
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Nucleotide
Download Length: 3633 bp
>NTDB_id=268485 DZM45_RS06215 WP_021340765.1 1232420..1236052(-) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain MGAS8347]
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AACAACAGTTGGAGTTATATGCAGAAGCTCTCACTCAAACGTATAAACTTCCTGTGACTAAGCGCTATCTTGTTTTAATG
GGAGGTGGAAAGCCAGAAATTGTCGAAGTTTAA
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Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| rexA | Streptococcus pneumoniae R6 |
48.366 |
100 |
0.489 |