Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | pilY1 | Type | Machinery gene |
| Locus tag | ABUS28_RS01695 | Genome accession | NZ_CP169866 |
| Coordinates | 356431..360285 (+) | Length | 1284 a.a. |
| NCBI ID | WP_000768951.1 | Uniprot ID | A0A241Z9A7 |
| Organism | Acinetobacter baumannii strain Rp779 | ||
| Function | assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake |
||
Genomic Context
Location: 351431..365285
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ABUS28_RS01665 | gmk | 351703..352332 (-) | 630 | WP_000015937.1 | guanylate kinase | - |
| ABUS28_RS01670 | ispH | 352455..353405 (+) | 951 | WP_000407064.1 | 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase | - |
| ABUS28_RS01675 | fimU | 353575..354048 (+) | 474 | WP_001214065.1 | Tfp pilus assembly protein FimT/FimU | Machinery gene |
| ABUS28_RS01680 | pilV | 354042..354602 (+) | 561 | WP_002194578.1 | type IV pilus modification protein PilV | Machinery gene |
| ABUS28_RS01685 | pilW | 354603..355604 (+) | 1002 | WP_002057668.1 | PilW family protein | Machinery gene |
| ABUS28_RS01690 | pilX | 355601..356419 (+) | 819 | WP_000149374.1 | PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein | Machinery gene |
| ABUS28_RS01695 | pilY1 | 356431..360285 (+) | 3855 | WP_000768951.1 | PilC/PilY family type IV pilus protein | Machinery gene |
| ABUS28_RS01700 | pilY2 | 360298..360780 (+) | 483 | WP_001046417.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| ABUS28_RS01705 | pilE | 360777..361202 (+) | 426 | WP_000788342.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| ABUS28_RS01710 | rpsP | 361349..361600 (+) | 252 | WP_000260334.1 | 30S ribosomal protein S16 | - |
| ABUS28_RS01715 | rimM | 361620..362168 (+) | 549 | WP_000189236.1 | ribosome maturation factor RimM | - |
| ABUS28_RS01720 | trmD | 362214..362954 (+) | 741 | WP_002057664.1 | tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD | - |
| ABUS28_RS01725 | rplS | 363162..363530 (+) | 369 | WP_000014562.1 | 50S ribosomal protein L19 | - |
| ABUS28_RS01730 | - | 363583..364524 (-) | 942 | WP_085943440.1 | triacylglycerol lipase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1284 a.a. Molecular weight: 137950.43 Da Isoelectric Point: 7.7510
>NTDB_id=1053803 ABUS28_RS01695 WP_000768951.1 356431..360285(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain Rp779]
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Nucleotide
Download Length: 3855 bp
>NTDB_id=1053803 ABUS28_RS01695 WP_000768951.1 356431..360285(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain Rp779]
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TACTATACTTATTACTACACCACTTTTAATTATGCTGTAGCAAATGCAGATAGCGGTATTCCAAAATCTAAATCAAATGA
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GGTTATTTACGAGCTTTTGAGCCAAATCCAGCTAACACGTACTTAACATGGCGTGGAAATTTAAAGAAATATCATGTTGT
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| pilY1 | Acinetobacter baumannii D1279779 |
88.527 |
100 |
0.889 |