Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | pilY1 | Type | Machinery gene |
| Locus tag | ABUS37_RS01645 | Genome accession | NZ_CP169809 |
| Coordinates | 346936..350790 (+) | Length | 1284 a.a. |
| NCBI ID | WP_000768954.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter baumannii strain Lv347 | ||
| Function | assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake |
||
Genomic Context
Location: 341936..355790
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ABUS37_RS01615 | gmk | 342208..342837 (-) | 630 | WP_000015937.1 | guanylate kinase | - |
| ABUS37_RS01620 | ispH | 342960..343910 (+) | 951 | WP_000407064.1 | 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase | - |
| ABUS37_RS01625 | fimU | 344080..344553 (+) | 474 | WP_001214065.1 | Tfp pilus assembly protein FimT/FimU | Machinery gene |
| ABUS37_RS01630 | pilV | 344547..345107 (+) | 561 | WP_002194578.1 | type IV pilus modification protein PilV | Machinery gene |
| ABUS37_RS01635 | pilW | 345108..346109 (+) | 1002 | WP_000079197.1 | PilW family protein | Machinery gene |
| ABUS37_RS01640 | pilX | 346106..346924 (+) | 819 | WP_000149374.1 | PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein | Machinery gene |
| ABUS37_RS01645 | pilY1 | 346936..350790 (+) | 3855 | WP_000768954.1 | PilC/PilY family type IV pilus protein | Machinery gene |
| ABUS37_RS01650 | pilY2 | 350803..351285 (+) | 483 | WP_001046423.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| ABUS37_RS01655 | pilE | 351282..351707 (+) | 426 | WP_000788337.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| ABUS37_RS01660 | rpsP | 351854..352105 (+) | 252 | WP_000260334.1 | 30S ribosomal protein S16 | - |
| ABUS37_RS01665 | rimM | 352125..352673 (+) | 549 | WP_000189236.1 | ribosome maturation factor RimM | - |
| ABUS37_RS01670 | trmD | 352719..353459 (+) | 741 | WP_000464599.1 | tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD | - |
| ABUS37_RS01675 | rplS | 353667..354035 (+) | 369 | WP_000014562.1 | 50S ribosomal protein L19 | - |
| ABUS37_RS01680 | - | 354088..355029 (-) | 942 | WP_085943974.1 | triacylglycerol lipase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1284 a.a. Molecular weight: 137967.42 Da Isoelectric Point: 7.8762
>NTDB_id=1053283 ABUS37_RS01645 WP_000768954.1 346936..350790(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain Lv347]
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Nucleotide
Download Length: 3855 bp
>NTDB_id=1053283 ABUS37_RS01645 WP_000768954.1 346936..350790(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain Lv347]
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GGTTATTTACGAGCTTTTGAGCCAAATCCAGCTAACACGTACTTGACATGGCGTGGAAATTTAAAGAAATATCATGTGGT
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| pilY1 | Acinetobacter baumannii D1279779 |
88.527 |
100 |
0.889 |