Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | RG306_RS03355 | Genome accession | NZ_CP133666 |
| Coordinates | 713173..717666 (+) | Length | 1497 a.a. |
| NCBI ID | WP_005031086.1 | Uniprot ID | N9DH11 |
| Organism | Acinetobacter bereziniae strain UCO-553 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 708173..722666
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| RG306_RS03330 (RG306_03330) | - | 708678..709319 (-) | 642 | WP_042066450.1 | hypothetical protein | - |
| RG306_RS03335 (RG306_03335) | pilG | 709604..709987 (+) | 384 | WP_004827613.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| RG306_RS03340 (RG306_03340) | - | 710008..710376 (+) | 369 | WP_004827615.1 | response regulator | - |
| RG306_RS03345 (RG306_03345) | - | 710380..710916 (+) | 537 | WP_004827616.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| RG306_RS03350 (RG306_03350) | - | 710959..713028 (+) | 2070 | WP_004827618.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| RG306_RS03355 (RG306_03355) | chpA | 713173..717666 (+) | 4494 | WP_005031086.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| RG306_RS03360 (RG306_03360) | - | 717675..718142 (+) | 468 | WP_004827624.1 | hypothetical protein | - |
| RG306_RS03365 (RG306_03365) | - | 719097..721160 (+) | 2064 | WP_010591326.1 | EAL domain-containing protein | - |
| RG306_RS03370 (RG306_03370) | fimA | 721558..722094 (+) | 537 | WP_005031083.1 | type 1 fimbrial major subunit FimA | - |
| RG306_RS03375 (RG306_03375) | - | 722148..722645 (+) | 498 | WP_005031082.1 | hypothetical protein | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1497 a.a. Molecular weight: 169200.04 Da Isoelectric Point: 4.4301
>NTDB_id=875758 RG306_RS03355 WP_005031086.1 713173..717666(+) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain UCO-553]
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Nucleotide
Download Length: 4494 bp
>NTDB_id=875758 RG306_RS03355 WP_005031086.1 713173..717666(+) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain UCO-553]
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GGTGAGTTGGCTTGGACTGTTGAAGATACATTAAATCGTGTAATTGCAAAAAACTTGGAATTAAGTACTGAAATTCAACA
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AAGAAGATACGGAGTCTTCTAAAAATGAAAACGCCCTATTGACTTATTATGCTGAATTCGTCAGTGATTATTTGCATGTA
CTCAAGCAAACCGGTGATCAAGATACGCAATTAGCCCAGATTTATCAAAAATTTAATGATGCTTGGGAGCGTTATGATTT
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ATCCTCGTCGATCATACCGACAATCGTGCGTCACAAGGTATTCATGATTTCAGTCTTGCACTCAAAGACGGATATACACA
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GTACATCAAGAAATTGATGTAGATCAGATTCAAATTGCTGAACCAAGCATTGAGCCAGCAGTTCAACATGCGGTAGTAGC
TGTATCTGATATTAACGCTGTTGAGACAGGCAATCATTATGTCTTAACTCAAATTAATCTTGATAAGCAAAATATAGATT
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TTGGTTCGCCATCATGAAATTCATCGTGACTTGCCAATTATTATGATTACCTCACGAACAGGTGAAAAACATCGCGAACG
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AGAAATTTTTGTAGAAGAACTTGAAGAAATTTTTGAACAGTTGCAAGCTTCTCTTGATCAATGGCTAAATGATGAGTCCA
AAGATAAGGAATTGGTGAATGTACGTCGCTATTTCCATACCCTTAAAGGCTCTGGACGTATGGTGGGGGCAAAGCGTTCA
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GATCATGACCTAAATACATGGTCAAGTCATCCAGATGATACCACTGCACTCAATAATTTAATGCGCTATTTGCACACTTT
AAAAGGTGGCGCAAATATGGTTCAGGCGACGCATATTGGTTTAATTGCTCATGAACTCGAAACAATTTATGAGCGCGTGA
TTAAAGGTCAGCTCAAAGCTGGACCACAAGTTATTCAATCTATTCGTTTGATTCAAGATGATGTCGCAGATCGTATTCAG
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GATGACGCCGAACGTGTTGCTCAAGAAACCTTCATTGAGGAAGCTCGTGAGCTGATTGATGATGGGTTAAATATCTTGAA
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AAATGGTGAAATTGGAAGGTGTTGCGGATATTGCTTATGAGCTTGAAAATGCATTTGAACAATTTGGTCAGCACAACTTT
AATTCCAATGTCTATGACGGTTTATTGGAAAGTGCTTTTCACTGGTTAGATGCAGCAATTTTCAAACAGAGTTACGATAA
TTTTGATGGTTTGAAGTTAAATTTAAACCGTATGCAATATGTCGATGTTTCTGCTCAGCTTCCAGAAAAATTATCTCGAA
CCAATTTGATTTTTGAACAGACCAATAATGAGTTTGTTCAAGGAGATGGAACTGAACCACCATCTATGTTGGGTGAATGG
GATCTTTCTGAAAAAACTGAAACCAATAATGAGATGATTCGTATCTCTGCGGATTTGGTTGAGAAGATGATCGATCTTTC
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AGTGCGCGCTATGCGGACTTTGACCCATTGGAAATGGACCAATATTCATCCTTGAATCAATTGTCTAAATCGCTTGCTGA
ATCTGCATCTGACTTGGTGGACTTTAAAACCACCTTAGCGGAGAAAATTCGTGATACTGAAGGCTTATTATTGCAACAGT
CACGTATTCAAGCTGAAATTCAAGAAAGCTTGATGCGTACCCGACTTGTTCCTTTCTCTCGTTTATTACCACGATTACAG
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TGACGGTTAAATAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
59.528 |
100 |
0.607 |