Detailed information
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | QHG51_RS03355 | Genome accession | NZ_CP123918 |
| Coordinates | 713188..717681 (+) | Length | 1497 a.a. |
| NCBI ID | WP_005031086.1 | Uniprot ID | N9DH11 |
| Organism | Acinetobacter bereziniae strain UCO-554 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 708188..722681
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| QHG51_RS03330 (QHG51_03330) | - | 708693..709334 (-) | 642 | WP_042066450.1 | hypothetical protein | - |
| QHG51_RS03335 (QHG51_03335) | pilG | 709619..710002 (+) | 384 | WP_004827613.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| QHG51_RS03340 (QHG51_03340) | - | 710023..710391 (+) | 369 | WP_004827615.1 | response regulator | - |
| QHG51_RS03345 (QHG51_03345) | - | 710395..710931 (+) | 537 | WP_004827616.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| QHG51_RS03350 (QHG51_03350) | - | 710974..713043 (+) | 2070 | WP_004827618.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| QHG51_RS03355 (QHG51_03355) | chpA | 713188..717681 (+) | 4494 | WP_005031086.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| QHG51_RS03360 (QHG51_03360) | - | 717690..718157 (+) | 468 | WP_004827624.1 | hypothetical protein | - |
| QHG51_RS03365 (QHG51_03365) | - | 719112..721175 (+) | 2064 | WP_010591326.1 | EAL domain-containing protein | - |
| QHG51_RS03370 (QHG51_03370) | fimA | 721573..722109 (+) | 537 | WP_005031083.1 | type 1 fimbrial major subunit FimA | - |
| QHG51_RS03375 (QHG51_03375) | - | 722163..722660 (+) | 498 | WP_005031082.1 | hypothetical protein | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1497 a.a. Molecular weight: 169200.04 Da Isoelectric Point: 4.4301
>NTDB_id=823107 QHG51_RS03355 WP_005031086.1 713188..717681(+) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain UCO-554]
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Nucleotide
Download Length: 4494 bp
>NTDB_id=823107 QHG51_RS03355 WP_005031086.1 713188..717681(+) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain UCO-554]
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AAGATAAGGAATTGGTGAATGTACGTCGCTATTTCCATACCCTTAAAGGCTCTGGACGTATGGTGGGGGCAAAGCGTTCA
GGTGAGTTGGCTTGGACTGTTGAAGATACATTAAATCGTGTAATTGCAAAAAACTTGGAATTAAGTACTGAAATTCAACA
ATATGTCAGTGCTGTATTTAATGTGTATAAGTTCAAATTGTATGCTGAGTTTTTAAATAAACAACCACATCATTTAGATT
TGGCACCATTGGTGTATTTGGGGCAACAATTACAGCAAAAACAGAGTTTAGAACCTGCATTGGCGGATCTACTGTCACTT
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AAGAAGATACGGAGTCTTCTAAAAATGAAAACGCCCTATTGACTTATTATGCTGAATTCGTCAGTGATTATTTGCATGTA
CTCAAGCAAACCGGTGATCAAGATACGCAATTAGCCCAGATTTATCAAAAATTTAATGATGCTTGGGAGCGTTATGATTT
CCAACATCAATATCAACAAGATCATCAGTCACAAGCAGGTTTAGTGACTCAATTGGTCGATTTGGAAATTGATCTATTGT
TGGATGCTGAATTTGAGTTTGATAAACGCGCTCAAGTTGAATATCCAGAATATTTCCAACAACTGATTCAACAGGCTCAG
ATCCTCGTCGATCATACCGACAATCGTGCGTCACAAGGTATTCATGATTTCAGTCTTGCACTCAAAGACGGATATACACA
GATTATTGCCAAGCCTGATTTGTTGAATACAGATTATGCTTTCGAAATATTCTCTAAAGCACATCAAGAATTCATTCATT
TATTTGATACCTTGGCATCTGGTCAGCGTGTCAGCTTGAGTGGTGCAACTCAGGCGATTTTGGATGAGCTTCATGATTAT
GTACATCAAGAAATTGATGTAGATCAGATTCAAATTGCTGAACCAAGCATTGAGCCAGCAGTTCAACATGCGGTAGTAGC
TGTATCTGATATTAACGCTGTTGAGACAGGCAATCATTATGTCTTAACTCAAATTAATCTTGATAAGCAAAATATAGATT
CTGCGCAAAGTCAGCGTGAGTTTGATGCTGACGTTCTTGACATTTTTATTGAGGAGGCCGATGAGCTGTTGGTAGGTATG
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TTAAAGGTCAGCTCAAAGCTGGACCACAAGTTATTCAATCTATTCGTTTGATTCAAGATGATGTCGCAGATCGTATTCAG
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GCATGATACGAATGTTGAGATAGCTGAAAAAGCCCAAGATGAGATTGTTTTAGTTGACGAGTCTGTTACTCCAGAATTTG
ATGTTATTTCTGCAGATCAGCAGCAAGCAACGCTTGAACAAGCTGAGCCATTCGTTGAACAGATTCAAGTAGATGACTTG
GATGACGCCGAACGTGTTGCTCAAGAAACCTTCATTGAGGAAGCTCGTGAGCTGATTGATGATGGGTTAAATATCTTGAA
TCAATGGTTTGATCAACGAAGTAACCGTAGTTTACTACTTCAATTGCAACGTATTGCACACAGCTTAAAAGGCGGTGCAA
AAATGGTGAAATTGGAAGGTGTTGCGGATATTGCTTATGAGCTTGAAAATGCATTTGAACAATTTGGTCAGCACAACTTT
AATTCCAATGTCTATGACGGTTTATTGGAAAGTGCTTTTCACTGGTTAGATGCAGCAATTTTCAAACAGAGTTACGATAA
TTTTGATGGTTTGAAGTTAAATTTAAACCGTATGCAATATGTCGATGTTTCTGCTCAGCTTCCAGAAAAATTATCTCGAA
CCAATTTGATTTTTGAACAGACCAATAATGAGTTTGTTCAAGGAGATGGAACTGAACCACCATCTATGTTGGGTGAATGG
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CGATTCAACGTTTGGCAGATCAGCTTCGTCGAATGGAAGGCGAGTTGGAAAGTCAAATTATTGCTAAACATGGGGATTTA
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ATCTGCATCTGACTTGGTGGACTTTAAAACCACCTTAGCGGAGAAAATTCGTGATACTGAAGGCTTATTATTGCAACAGT
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TTACATGGCTTTGCACATTCATTACCTGTGTTATTGATTAAAGGGAGCTTAGGTCAATCTGTCGCGATTCTGGTTGATCA
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TTGGTTCGCCATCATGAAATTCATCGTGACTTGCCAATTATTATGATTACCTCACGAACAGGTGAAAAACATCGCGAACG
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ATGAAAGAAATATTAAAACATTTAGTTGAACACGTCACTTTACCTGAAGATGCTTATCTTGATCAGGATGATGAGATTTT
AGAAATTTTTGTAGAAGAACTTGAAGAAATTTTTGAACAGTTGCAAGCTTCTCTTGATCAATGGCTAAATGATGAGTCCA
AAGATAAGGAATTGGTGAATGTACGTCGCTATTTCCATACCCTTAAAGGCTCTGGACGTATGGTGGGGGCAAAGCGTTCA
GGTGAGTTGGCTTGGACTGTTGAAGATACATTAAATCGTGTAATTGCAAAAAACTTGGAATTAAGTACTGAAATTCAACA
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TGGCACCATTGGTGTATTTGGGGCAACAATTACAGCAAAAACAGAGTTTAGAACCTGCATTGGCGGATCTACTGTCACTT
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GATCATGACCTAAATACATGGTCAAGTCATCCAGATGATACCACTGCACTCAATAATTTAATGCGCTATTTGCACACTTT
AAAAGGTGGCGCAAATATGGTTCAGGCGACGCATATTGGTTTAATTGCTCATGAACTCGAAACAATTTATGAGCGCGTGA
TTAAAGGTCAGCTCAAAGCTGGACCACAAGTTATTCAATCTATTCGTTTGATTCAAGATGATGTCGCAGATCGTATTCAG
TTGATTCGTGAAAAATCTATTGATTATCCTGCAACACACATTCTTGAGGTTTTACAGCATATTGATCAACAGCAATTCTT
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GATGACGCCGAACGTGTTGCTCAAGAAACCTTCATTGAGGAAGCTCGTGAGCTGATTGATGATGGGTTAAATATCTTGAA
TCAATGGTTTGATCAACGAAGTAACCGTAGTTTACTACTTCAATTGCAACGTATTGCACACAGCTTAAAAGGCGGTGCAA
AAATGGTGAAATTGGAAGGTGTTGCGGATATTGCTTATGAGCTTGAAAATGCATTTGAACAATTTGGTCAGCACAACTTT
AATTCCAATGTCTATGACGGTTTATTGGAAAGTGCTTTTCACTGGTTAGATGCAGCAATTTTCAAACAGAGTTACGATAA
TTTTGATGGTTTGAAGTTAAATTTAAACCGTATGCAATATGTCGATGTTTCTGCTCAGCTTCCAGAAAAATTATCTCGAA
CCAATTTGATTTTTGAACAGACCAATAATGAGTTTGTTCAAGGAGATGGAACTGAACCACCATCTATGTTGGGTGAATGG
GATCTTTCTGAAAAAACTGAAACCAATAATGAGATGATTCGTATCTCTGCGGATTTGGTTGAGAAGATGATCGATCTTTC
TGGTGAAAATGCCATTAACCGCTCGCGTATTGAAATGGATTTGGGTCAATTGGGAAATACATTGACCGATATGGAGCTTG
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AGTGCGCGCTATGCGGACTTTGACCCATTGGAAATGGACCAATATTCATCCTTGAATCAATTGTCTAAATCGCTTGCTGA
ATCTGCATCTGACTTGGTGGACTTTAAAACCACCTTAGCGGAGAAAATTCGTGATACTGAAGGCTTATTATTGCAACAGT
CACGTATTCAAGCTGAAATTCAAGAAAGCTTGATGCGTACCCGACTTGTTCCTTTCTCTCGTTTATTACCACGATTACAG
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TGACGGTTAAATAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
59.528 |
100 |
0.607 |