Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | QHG52_RS03355 | Genome accession | NZ_CP123912 |
| Coordinates | 713173..717666 (+) | Length | 1497 a.a. |
| NCBI ID | WP_005031086.1 | Uniprot ID | N9DH11 |
| Organism | Acinetobacter bereziniae strain UCO-553 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 708173..722666
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| QHG52_RS03330 | - | 708678..709319 (-) | 642 | WP_042066450.1 | hypothetical protein | - |
| QHG52_RS03335 | pilG | 709604..709987 (+) | 384 | WP_004827613.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| QHG52_RS03340 | - | 710008..710376 (+) | 369 | WP_004827615.1 | response regulator | - |
| QHG52_RS03345 | - | 710380..710916 (+) | 537 | WP_004827616.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| QHG52_RS03350 | - | 710959..713028 (+) | 2070 | WP_004827618.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| QHG52_RS03355 | chpA | 713173..717666 (+) | 4494 | WP_005031086.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| QHG52_RS03360 | - | 717675..718142 (+) | 468 | WP_004827624.1 | hypothetical protein | - |
| QHG52_RS03365 | - | 719097..721160 (+) | 2064 | WP_010591326.1 | EAL domain-containing protein | - |
| QHG52_RS03370 | fimA | 721558..722094 (+) | 537 | WP_005031083.1 | type 1 fimbrial major subunit FimA | - |
| QHG52_RS03375 | - | 722148..722645 (+) | 498 | WP_005031082.1 | hypothetical protein | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1497 a.a. Molecular weight: 169200.04 Da Isoelectric Point: 4.4301
>NTDB_id=823067 QHG52_RS03355 WP_005031086.1 713173..717666(+) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain UCO-553]
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Nucleotide
Download Length: 4494 bp
>NTDB_id=823067 QHG52_RS03355 WP_005031086.1 713173..717666(+) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain UCO-553]
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AAGATAAGGAATTGGTGAATGTACGTCGCTATTTCCATACCCTTAAAGGCTCTGGACGTATGGTGGGGGCAAAGCGTTCA
GGTGAGTTGGCTTGGACTGTTGAAGATACATTAAATCGTGTAATTGCAAAAAACTTGGAATTAAGTACTGAAATTCAACA
ATATGTCAGTGCTGTATTTAATGTGTATAAGTTCAAATTGTATGCTGAGTTTTTAAATAAACAACCACATCATTTAGATT
TGGCACCATTGGTGTATTTGGGGCAACAATTACAGCAAAAACAGAGTTTAGAACCTGCATTGGCGGATCTACTGTCACTT
GCGCATACCCTCAATCATGAGAATGTGCTGACGGGTTTAGAAATTGCTGATAGCGAGCCACTTGTAGAGCATATAGAAAC
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AAGAAGATACGGAGTCTTCTAAAAATGAAAACGCCCTATTGACTTATTATGCTGAATTCGTCAGTGATTATTTGCATGTA
CTCAAGCAAACCGGTGATCAAGATACGCAATTAGCCCAGATTTATCAAAAATTTAATGATGCTTGGGAGCGTTATGATTT
CCAACATCAATATCAACAAGATCATCAGTCACAAGCAGGTTTAGTGACTCAATTGGTCGATTTGGAAATTGATCTATTGT
TGGATGCTGAATTTGAGTTTGATAAACGCGCTCAAGTTGAATATCCAGAATATTTCCAACAACTGATTCAACAGGCTCAG
ATCCTCGTCGATCATACCGACAATCGTGCGTCACAAGGTATTCATGATTTCAGTCTTGCACTCAAAGACGGATATACACA
GATTATTGCCAAGCCTGATTTGTTGAATACAGATTATGCTTTCGAAATATTCTCTAAAGCACATCAAGAATTCATTCATT
TATTTGATACCTTGGCATCTGGTCAGCGTGTCAGCTTGAGTGGTGCAACTCAGGCGATTTTGGATGAGCTTCATGATTAT
GTACATCAAGAAATTGATGTAGATCAGATTCAAATTGCTGAACCAAGCATTGAGCCAGCAGTTCAACATGCGGTAGTAGC
TGTATCTGATATTAACGCTGTTGAGACAGGCAATCATTATGTCTTAACTCAAATTAATCTTGATAAGCAAAATATAGATT
CTGCGCAAAGTCAGCGTGAGTTTGATGCTGACGTTCTTGACATTTTTATTGAGGAGGCCGATGAGCTGTTGGTAGGTATG
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AAAAGGTGGCGCAAATATGGTTCAGGCGACGCATATTGGTTTAATTGCTCATGAACTCGAAACAATTTATGAGCGCGTGA
TTAAAGGTCAGCTCAAAGCTGGACCACAAGTTATTCAATCTATTCGTTTGATTCAAGATGATGTCGCAGATCGTATTCAG
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GCATGATACGAATGTTGAGATAGCTGAAAAAGCCCAAGATGAGATTGTTTTAGTTGACGAGTCTGTTACTCCAGAATTTG
ATGTTATTTCTGCAGATCAGCAGCAAGCAACGCTTGAACAAGCTGAGCCATTCGTTGAACAGATTCAAGTAGATGACTTG
GATGACGCCGAACGTGTTGCTCAAGAAACCTTCATTGAGGAAGCTCGTGAGCTGATTGATGATGGGTTAAATATCTTGAA
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AAATGGTGAAATTGGAAGGTGTTGCGGATATTGCTTATGAGCTTGAAAATGCATTTGAACAATTTGGTCAGCACAACTTT
AATTCCAATGTCTATGACGGTTTATTGGAAAGTGCTTTTCACTGGTTAGATGCAGCAATTTTCAAACAGAGTTACGATAA
TTTTGATGGTTTGAAGTTAAATTTAAACCGTATGCAATATGTCGATGTTTCTGCTCAGCTTCCAGAAAAATTATCTCGAA
CCAATTTGATTTTTGAACAGACCAATAATGAGTTTGTTCAAGGAGATGGAACTGAACCACCATCTATGTTGGGTGAATGG
GATCTTTCTGAAAAAACTGAAACCAATAATGAGATGATTCGTATCTCTGCGGATTTGGTTGAGAAGATGATCGATCTTTC
TGGTGAAAATGCCATTAACCGCTCGCGTATTGAAATGGATTTGGGTCAATTGGGAAATACATTGACCGATATGGAGCTTG
CGATTCAACGTTTGGCAGATCAGCTTCGTCGAATGGAAGGCGAGTTGGAAAGTCAAATTATTGCTAAACATGGGGATTTA
AGTGCGCGCTATGCGGACTTTGACCCATTGGAAATGGACCAATATTCATCCTTGAATCAATTGTCTAAATCGCTTGCTGA
ATCTGCATCTGACTTGGTGGACTTTAAAACCACCTTAGCGGAGAAAATTCGTGATACTGAAGGCTTATTATTGCAACAGT
CACGTATTCAAGCTGAAATTCAAGAAAGCTTGATGCGTACCCGACTTGTTCCTTTCTCTCGTTTATTACCACGATTACAG
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TTACATGGCTTTGCACATTCATTACCTGTGTTATTGATTAAAGGGAGCTTAGGTCAATCTGTCGCGATTCTGGTTGATCA
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TTGGTTCGCCATCATGAAATTCATCGTGACTTGCCAATTATTATGATTACCTCACGAACAGGTGAAAAACATCGCGAACG
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TGACGGTTAAATAG
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AGAAATTTTTGTAGAAGAACTTGAAGAAATTTTTGAACAGTTGCAAGCTTCTCTTGATCAATGGCTAAATGATGAGTCCA
AAGATAAGGAATTGGTGAATGTACGTCGCTATTTCCATACCCTTAAAGGCTCTGGACGTATGGTGGGGGCAAAGCGTTCA
GGTGAGTTGGCTTGGACTGTTGAAGATACATTAAATCGTGTAATTGCAAAAAACTTGGAATTAAGTACTGAAATTCAACA
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TGGCACCATTGGTGTATTTGGGGCAACAATTACAGCAAAAACAGAGTTTAGAACCTGCATTGGCGGATCTACTGTCACTT
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AGTAGCAGCTATGGCAAACCACGAAAATGCCGAAGAGCATGCAGTGGCAGACCCGATTCAAATTGATGAATCTGCAGCGG
AAACAACGCCGACTTCGGATGAAAGTTTAATCTCTGAAACCCTGACGATTTTTGTTGAAGAGTCGGAAGAACATCTGGCA
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GATTATTGCCAAGCCTGATTTGTTGAATACAGATTATGCTTTCGAAATATTCTCTAAAGCACATCAAGAATTCATTCATT
TATTTGATACCTTGGCATCTGGTCAGCGTGTCAGCTTGAGTGGTGCAACTCAGGCGATTTTGGATGAGCTTCATGATTAT
GTACATCAAGAAATTGATGTAGATCAGATTCAAATTGCTGAACCAAGCATTGAGCCAGCAGTTCAACATGCGGTAGTAGC
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CTGCGCAAAGTCAGCGTGAGTTTGATGCTGACGTTCTTGACATTTTTATTGAGGAGGCCGATGAGCTGTTGGTAGGTATG
GATCATGACCTAAATACATGGTCAAGTCATCCAGATGATACCACTGCACTCAATAATTTAATGCGCTATTTGCACACTTT
AAAAGGTGGCGCAAATATGGTTCAGGCGACGCATATTGGTTTAATTGCTCATGAACTCGAAACAATTTATGAGCGCGTGA
TTAAAGGTCAGCTCAAAGCTGGACCACAAGTTATTCAATCTATTCGTTTGATTCAAGATGATGTCGCAGATCGTATTCAG
TTGATTCGTGAAAAATCTATTGATTATCCTGCAACACACATTCTTGAGGTTTTACAGCATATTGATCAACAGCAATTCTT
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ATGTTATTTCTGCAGATCAGCAGCAAGCAACGCTTGAACAAGCTGAGCCATTCGTTGAACAGATTCAAGTAGATGACTTG
GATGACGCCGAACGTGTTGCTCAAGAAACCTTCATTGAGGAAGCTCGTGAGCTGATTGATGATGGGTTAAATATCTTGAA
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AAATGGTGAAATTGGAAGGTGTTGCGGATATTGCTTATGAGCTTGAAAATGCATTTGAACAATTTGGTCAGCACAACTTT
AATTCCAATGTCTATGACGGTTTATTGGAAAGTGCTTTTCACTGGTTAGATGCAGCAATTTTCAAACAGAGTTACGATAA
TTTTGATGGTTTGAAGTTAAATTTAAACCGTATGCAATATGTCGATGTTTCTGCTCAGCTTCCAGAAAAATTATCTCGAA
CCAATTTGATTTTTGAACAGACCAATAATGAGTTTGTTCAAGGAGATGGAACTGAACCACCATCTATGTTGGGTGAATGG
GATCTTTCTGAAAAAACTGAAACCAATAATGAGATGATTCGTATCTCTGCGGATTTGGTTGAGAAGATGATCGATCTTTC
TGGTGAAAATGCCATTAACCGCTCGCGTATTGAAATGGATTTGGGTCAATTGGGAAATACATTGACCGATATGGAGCTTG
CGATTCAACGTTTGGCAGATCAGCTTCGTCGAATGGAAGGCGAGTTGGAAAGTCAAATTATTGCTAAACATGGGGATTTA
AGTGCGCGCTATGCGGACTTTGACCCATTGGAAATGGACCAATATTCATCCTTGAATCAATTGTCTAAATCGCTTGCTGA
ATCTGCATCTGACTTGGTGGACTTTAAAACCACCTTAGCGGAGAAAATTCGTGATACTGAAGGCTTATTATTGCAACAGT
CACGTATTCAAGCTGAAATTCAAGAAAGCTTGATGCGTACCCGACTTGTTCCTTTCTCTCGTTTATTACCACGATTACAG
CGTTTGGTACGCCAAACCGCCTCGGCGGTCAATAAGCCTACCGAACTGTTGGTGAATAATACGGAAGGTGAATTAGATCG
TAATATTTTAGAGAAATTAGTATCTCCATTAGAGCATATGTTGCGTAATGCCATCGACCACGGGATCGAAGATACAGAGC
AGCGACAAAAAGCTGGCAAGCCATTGACTGGTCGAATCGACTTGAATATTAGTCGCCAAGGTACCGATGTTTTGGTGTCC
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TGACGGTTAAATAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
59.528 |
100 |
0.607 |