Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | QBJ73_RS11885 | Genome accession | NZ_CP121776 |
| Coordinates | 2511669..2516150 (+) | Length | 1493 a.a. |
| NCBI ID | WP_058952134.1 | Uniprot ID | A0AAJ6LEC5 |
| Organism | Acinetobacter johnsonii strain AYTCM | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 2506669..2521150
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| QBJ73_RS11860 (QBJ73_11875) | - | 2507139..2507777 (-) | 639 | WP_094148348.1 | hypothetical protein | - |
| QBJ73_RS11865 (QBJ73_11880) | pilG | 2508058..2508441 (+) | 384 | WP_004694493.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| QBJ73_RS11870 (QBJ73_11885) | - | 2508469..2508837 (+) | 369 | WP_004694491.1 | response regulator | - |
| QBJ73_RS11875 (QBJ73_11890) | - | 2508843..2509379 (+) | 537 | WP_004694490.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| QBJ73_RS11880 (QBJ73_11895) | - | 2509430..2511502 (+) | 2073 | WP_058952135.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| QBJ73_RS11885 (QBJ73_11900) | chpA | 2511669..2516150 (+) | 4482 | WP_058952134.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| QBJ73_RS11890 (QBJ73_11905) | - | 2516155..2516610 (+) | 456 | WP_058952133.1 | hypothetical protein | - |
| QBJ73_RS11895 (QBJ73_11910) | dapE | 2516676..2517809 (-) | 1134 | WP_058952132.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | - |
| QBJ73_RS11900 (QBJ73_11915) | - | 2517928..2518074 (-) | 147 | WP_058952131.1 | entericidin A/B family lipoprotein | - |
| QBJ73_RS11905 (QBJ73_11920) | - | 2518232..2519110 (-) | 879 | WP_058952130.1 | DUF1853 family protein | - |
| QBJ73_RS11910 (QBJ73_11925) | - | 2519208..2519600 (+) | 393 | WP_058952129.1 | YbaN family protein | - |
| QBJ73_RS11915 (QBJ73_11930) | elsL | 2519600..2520103 (+) | 504 | WP_058952128.1 | cell wall-recycling L,D-carboxypeptidase ElsL | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1493 a.a. Molecular weight: 166832.46 Da Isoelectric Point: 4.4098
>NTDB_id=814183 QBJ73_RS11885 WP_058952134.1 2511669..2516150(+) (chpA) [Acinetobacter johnsonii strain AYTCM]
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Nucleotide
Download Length: 4482 bp
>NTDB_id=814183 QBJ73_RS11885 WP_058952134.1 2511669..2516150(+) (chpA) [Acinetobacter johnsonii strain AYTCM]
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ATCAAGAAACCTTGTTGAGCATACGCCGTCACTTCCATACCTTAAAAGGCTCTGGTCGTATGGTGGGAGCAAAGTCAGCA
GGTGAAACAGCATGGGCGGTTGAAGATACCTTAAACCGTGTGATTTCAGGGGCTGTACCGCTTACGGCAACGGTTCAAAA
ATTTGCTAAAACAGTATTTAAACTGTATCAATTTAAACTGTACCCGACTTTTAAAGAGATGCAGAAAATTGATCTTGATC
TTCGTCCATTGGTTTTAATTGGACAACAATTACAACAAAATCAAAGTTTAGAACCTGCTCTAGAAGAGTTGCTACAACTG
TCTAATCATCTAAATAGTAATGATGTCGTGACGGGATTAGAGCTGAGCGATATCGAAGTGGCTGAATCTGAGCCACAAGT
TGCAGACGTTTCTGAGCAGGATGATCAAGTGCATGATGTCCTTGAAGAAACTTTAGCGATCTTCATTGAAGAAGCGGAAG
ACCATTTAGCGACTATCGATCAGTTCTTAAATGCAGATGAAACCAAAGTACAAGATTACAATGGTTTAATCCGGGCTTTA
CATACATTGCGCGGTAGTTCGTCTATGGCGCAAATTGAGCATGTCTTTAATGCCAGCTCAAAAGTTGAAAATCTATTTAA
AACTTTGGTTCAAGAAGAGATCGTTTCTACCTCGAAGGAAATCTCTTTACTCACCCAATATGCTGAATTTGTACGTGACT
ATTTACACGTGCTTGGGCGTGGTACGAACGAACAGCTTGACGTGATTTACGCCACGTTCACTACGGCTTGGGATAACTAT
GGTTTCAGTATTGAAGACGTAGCTGATGAGCTAAACCCACAAGGTATGGTTTCGAAGCTGATCGAGTTAAATATTGATCT
GTTGCTTGATGCCGAGTTTGAGTTTGATCAGCGTGCTAAGGTTGAATATCCAGACTATATTCAGCACTTAGGTGAACAAG
CAAAACAATTGCTAGAATTCACCAATAACCGTGCTGCTCAAGGAATTCATGACTTTACTTCTGAGCTATATGCGGGTTAT
CAAGCCTTACTGGAAAAGCCAGAATTACTCAATGTAGACTATGCATATGAGTTATTTGGTCAGGCACATCAAGAATTTAT
CCATTTATTTGACACTTTAGCTGCGGGTCAGCGTGTTATTCTGACTGAAGAAGTGCATAAAGTTCTGAATGAATTAATGG
CCTTCGTACAGCAAGATGTTGAATCGACTTCGACGACGGTAATTGAACCTGTTGCTGAGGCTATTGTTTCTGGAAATACT
TTACAACCAAGCCTTGATCTTGCGCAGATTTCGCAGCAAATTGCATCGGATCATCAGTACAAGCAATCGAATACGGCCAA
TACCGATTTTGATGATGATTTGCTCGATATCTTCTTGGAAGAAGCCGAAGAATTATTGATGGGGATGGATCAGGATCTTA
ATACTTGGTCTAAAAATGGCAATGATACAGCAGCGCTCAATAATTTAATGCGTTATTTGCACACCTTAAAAGGTGGTGCC
AATATGATTTCTGCACCTTTTATTGGTTCGATTGCACACGAATTAGAGTCTATTTATGAGCGTGTGATTCGTCAGCAAAT
AGCCACAACGCCACAGTTGATCAGCATCATTCGCTTAGTACAGGATGACGTCGCAGACCGAATTCAGGTCATTCGTACGG
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TAATGTAGATAGAACGATTGAAGTTGAAACAGCTGCTGCTGTTGAGTCAGCAACTGCAATTGAAGCGTCAAGTATAGTTG
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AA
ATGAAAGAAATATTAAAACATTTAGTTGAAACGACAACGCTTCCGGAAGATAGTTATCTAGATCAAGATGCAGAAATTCT
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AGCCACAACGCCACAGTTGATCAGCATCATTCGCTTAGTACAGGATGACGTCGCAGACCGAATTCAGGTCATTCGTACGG
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TAGTGACCGTAGTGTGTTACTACAATTGCAACGTGCCGCGCACAGTTTAAAAGGCGGCGCACGTATGGCGGAGAATGAAC
CCGTTGGTGCGATTGCTTATGAACTAGAAACCACATTTGAGCAATTTGCTGTACATAATTTCAGTTCAAACGTGTATGAC
CCATTATTGCAAACCGCATTTGAATGGTTAAAACAAGCCATCTTCAAACGTGATTTTAGTAATTATGATGGTTTGAAAAA
CAGCTTAGCATCTATTGATTATGTGGATGTGATTGCGCAATTACCGACGCGTGTAACTCAAATTGATTTACTTAATGCGG
TACCAAGTTTTGAGTTTGTGCAGGGTGATGGTACTGAGCCGCCAGCAATGCTGGGTGAGTGGAAAGAAACGACTCACTTG
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GACGCACTACATGGGCAAACCATTCCAAGAGGCAGAGTTACTTGCCAACATTCAGCAGTTATTGGCTGAAAAGCAGGGGT
AA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
60.568 |
100 |
0.614 |