Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | addA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | P3T66_RS04640 | Genome accession | NZ_CP120512 |
| Coordinates | 910607..914350 (+) | Length | 1247 a.a. |
| NCBI ID | WP_016265072.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Latilactobacillus sakei strain PMC104 | ||
| Function | homologous recombination; plasmid transformation (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 905607..919350
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| P3T66_RS04630 (P3T66_04630) | mvk | 905839..906786 (-) | 948 | WP_025015793.1 | mevalonate kinase | - |
| P3T66_RS04635 (P3T66_04635) | - | 907063..910623 (+) | 3561 | WP_016265071.1 | PD-(D/E)XK nuclease family protein | - |
| P3T66_RS04640 (P3T66_04640) | addA | 910607..914350 (+) | 3744 | WP_016265072.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| P3T66_RS04645 (P3T66_04645) | - | 914416..917250 (+) | 2835 | WP_016265073.1 | helicase C-terminal domain-containing protein | - |
| P3T66_RS04650 (P3T66_04650) | - | 917328..917804 (+) | 477 | WP_011374615.1 | DUF5590 domain-containing protein | - |
| P3T66_RS04655 (P3T66_04655) | asnS | 917915..919213 (+) | 1299 | WP_011374616.1 | asparagine--tRNA ligase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1247 a.a. Molecular weight: 141571.43 Da Isoelectric Point: 4.7686
>NTDB_id=732149 P3T66_RS04640 WP_016265072.1 910607..914350(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain PMC104]
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Nucleotide
Download Length: 3744 bp
>NTDB_id=732149 P3T66_RS04640 WP_016265072.1 910607..914350(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain PMC104]
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| addA | Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 |
37.51 |
100 |
0.382 |