Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | I9192_RS03365 | Genome accession | NZ_CP066119 |
| Coordinates | 714278..718771 (+) | Length | 1497 a.a. |
| NCBI ID | WP_005031086.1 | Uniprot ID | N9DH11 |
| Organism | Acinetobacter bereziniae strain GD03185 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 709278..723771
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| I9192_RS03340 (I9192_03340) | - | 709783..710424 (-) | 642 | WP_042066450.1 | hypothetical protein | - |
| I9192_RS03345 (I9192_03345) | pilG | 710709..711092 (+) | 384 | WP_004827613.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| I9192_RS03350 (I9192_03350) | - | 711113..711481 (+) | 369 | WP_004827615.1 | response regulator | - |
| I9192_RS03355 (I9192_03355) | - | 711485..712021 (+) | 537 | WP_004827616.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| I9192_RS03360 (I9192_03360) | - | 712064..714133 (+) | 2070 | WP_004827618.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| I9192_RS03365 (I9192_03365) | chpA | 714278..718771 (+) | 4494 | WP_005031086.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| I9192_RS03370 (I9192_03370) | - | 718780..719247 (+) | 468 | WP_004827624.1 | hypothetical protein | - |
| I9192_RS03375 (I9192_03375) | - | 720202..722265 (+) | 2064 | WP_010591326.1 | EAL domain-containing protein | - |
| I9192_RS03380 (I9192_03380) | fimA | 722663..723199 (+) | 537 | WP_005031083.1 | type 1 fimbrial major subunit FimA | - |
| I9192_RS03385 (I9192_03385) | - | 723253..723750 (+) | 498 | WP_005031082.1 | hypothetical protein | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1497 a.a. Molecular weight: 169200.04 Da Isoelectric Point: 4.4301
>NTDB_id=517478 I9192_RS03365 WP_005031086.1 714278..718771(+) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain GD03185]
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Nucleotide
Download Length: 4494 bp
>NTDB_id=517478 I9192_RS03365 WP_005031086.1 714278..718771(+) (chpA) [Acinetobacter bereziniae strain GD03185]
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AAGATAAGGAATTGGTGAATGTACGTCGCTATTTCCATACCCTTAAAGGCTCTGGACGTATGGTGGGGGCAAAGCGTTCA
GGTGAGTTGGCTTGGACTGTTGAAGATACATTAAATCGTGTAATTGCAAAAAACTTGGAATTAAGTACTGAAATTCAACA
ATATGTCAGTGCTGTATTTAATGTGTATAAGTTCAAATTGTATGCTGAGTTTTTAAATAAACAACCACATCATTTAGATT
TGGCACCATTGGTGTATTTGGGGCAACAATTACAGCAAAAACAGAGTTTAGAACCTGCATTGGCGGATCTACTGTCACTT
GCGCATACCCTCAATCATGAGAATGTGCTGACGGGTTTAGAAATTGCTGATAGCGAGCCACTTGTAGAGCATATAGAAAC
AGTAGCAGCTATGGCAAACCACGAAAATGCCGAAGAGCATGCAGTGGCAGACCCGATTCAAATTGATGAATCTGCAGCGG
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CGGAAGTTCTTCTATGGCGCATATTCAGGATGTATTTGAAGCAAGTGGTAAAGTTGAGCATTTGTTTAAAGTGTTGGTCC
AAGAAGATACGGAGTCTTCTAAAAATGAAAACGCCCTATTGACTTATTATGCTGAATTCGTCAGTGATTATTTGCATGTA
CTCAAGCAAACCGGTGATCAAGATACGCAATTAGCCCAGATTTATCAAAAATTTAATGATGCTTGGGAGCGTTATGATTT
CCAACATCAATATCAACAAGATCATCAGTCACAAGCAGGTTTAGTGACTCAATTGGTCGATTTGGAAATTGATCTATTGT
TGGATGCTGAATTTGAGTTTGATAAACGCGCTCAAGTTGAATATCCAGAATATTTCCAACAACTGATTCAACAGGCTCAG
ATCCTCGTCGATCATACCGACAATCGTGCGTCACAAGGTATTCATGATTTCAGTCTTGCACTCAAAGACGGATATACACA
GATTATTGCCAAGCCTGATTTGTTGAATACAGATTATGCTTTCGAAATATTCTCTAAAGCACATCAAGAATTCATTCATT
TATTTGATACCTTGGCATCTGGTCAGCGTGTCAGCTTGAGTGGTGCAACTCAGGCGATTTTGGATGAGCTTCATGATTAT
GTACATCAAGAAATTGATGTAGATCAGATTCAAATTGCTGAACCAAGCATTGAGCCAGCAGTTCAACATGCGGTAGTAGC
TGTATCTGATATTAACGCTGTTGAGACAGGCAATCATTATGTCTTAACTCAAATTAATCTTGATAAGCAAAATATAGATT
CTGCGCAAAGTCAGCGTGAGTTTGATGCTGACGTTCTTGACATTTTTATTGAGGAGGCCGATGAGCTGTTGGTAGGTATG
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AAAAGGTGGCGCAAATATGGTTCAGGCGACGCATATTGGTTTAATTGCTCATGAACTCGAAACAATTTATGAGCGCGTGA
TTAAAGGTCAGCTCAAAGCTGGACCACAAGTTATTCAATCTATTCGTTTGATTCAAGATGATGTCGCAGATCGTATTCAG
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GCATGATACGAATGTTGAGATAGCTGAAAAAGCCCAAGATGAGATTGTTTTAGTTGACGAGTCTGTTACTCCAGAATTTG
ATGTTATTTCTGCAGATCAGCAGCAAGCAACGCTTGAACAAGCTGAGCCATTCGTTGAACAGATTCAAGTAGATGACTTG
GATGACGCCGAACGTGTTGCTCAAGAAACCTTCATTGAGGAAGCTCGTGAGCTGATTGATGATGGGTTAAATATCTTGAA
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AAATGGTGAAATTGGAAGGTGTTGCGGATATTGCTTATGAGCTTGAAAATGCATTTGAACAATTTGGTCAGCACAACTTT
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TTTTGATGGTTTGAAGTTAAATTTAAACCGTATGCAATATGTCGATGTTTCTGCTCAGCTTCCAGAAAAATTATCTCGAA
CCAATTTGATTTTTGAACAGACCAATAATGAGTTTGTTCAAGGAGATGGAACTGAACCACCATCTATGTTGGGTGAATGG
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CACGTATTCAAGCTGAAATTCAAGAAAGCTTGATGCGTACCCGACTTGTTCCTTTCTCTCGTTTATTACCACGATTACAG
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TTACATGGCTTTGCACATTCATTACCTGTGTTATTGATTAAAGGGAGCTTAGGTCAATCTGTCGCGATTCTGGTTGATCA
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TTGGTTCGCCATCATGAAATTCATCGTGACTTGCCAATTATTATGATTACCTCACGAACAGGTGAAAAACATCGCGAACG
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ATGAAAGAAATATTAAAACATTTAGTTGAACACGTCACTTTACCTGAAGATGCTTATCTTGATCAGGATGATGAGATTTT
AGAAATTTTTGTAGAAGAACTTGAAGAAATTTTTGAACAGTTGCAAGCTTCTCTTGATCAATGGCTAAATGATGAGTCCA
AAGATAAGGAATTGGTGAATGTACGTCGCTATTTCCATACCCTTAAAGGCTCTGGACGTATGGTGGGGGCAAAGCGTTCA
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TGGCACCATTGGTGTATTTGGGGCAACAATTACAGCAAAAACAGAGTTTAGAACCTGCATTGGCGGATCTACTGTCACTT
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AGTAGCAGCTATGGCAAACCACGAAAATGCCGAAGAGCATGCAGTGGCAGACCCGATTCAAATTGATGAATCTGCAGCGG
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CCAACATCAATATCAACAAGATCATCAGTCACAAGCAGGTTTAGTGACTCAATTGGTCGATTTGGAAATTGATCTATTGT
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GATTATTGCCAAGCCTGATTTGTTGAATACAGATTATGCTTTCGAAATATTCTCTAAAGCACATCAAGAATTCATTCATT
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GATCATGACCTAAATACATGGTCAAGTCATCCAGATGATACCACTGCACTCAATAATTTAATGCGCTATTTGCACACTTT
AAAAGGTGGCGCAAATATGGTTCAGGCGACGCATATTGGTTTAATTGCTCATGAACTCGAAACAATTTATGAGCGCGTGA
TTAAAGGTCAGCTCAAAGCTGGACCACAAGTTATTCAATCTATTCGTTTGATTCAAGATGATGTCGCAGATCGTATTCAG
TTGATTCGTGAAAAATCTATTGATTATCCTGCAACACACATTCTTGAGGTTTTACAGCATATTGATCAACAGCAATTCTT
GCATGATACGAATGTTGAGATAGCTGAAAAAGCCCAAGATGAGATTGTTTTAGTTGACGAGTCTGTTACTCCAGAATTTG
ATGTTATTTCTGCAGATCAGCAGCAAGCAACGCTTGAACAAGCTGAGCCATTCGTTGAACAGATTCAAGTAGATGACTTG
GATGACGCCGAACGTGTTGCTCAAGAAACCTTCATTGAGGAAGCTCGTGAGCTGATTGATGATGGGTTAAATATCTTGAA
TCAATGGTTTGATCAACGAAGTAACCGTAGTTTACTACTTCAATTGCAACGTATTGCACACAGCTTAAAAGGCGGTGCAA
AAATGGTGAAATTGGAAGGTGTTGCGGATATTGCTTATGAGCTTGAAAATGCATTTGAACAATTTGGTCAGCACAACTTT
AATTCCAATGTCTATGACGGTTTATTGGAAAGTGCTTTTCACTGGTTAGATGCAGCAATTTTCAAACAGAGTTACGATAA
TTTTGATGGTTTGAAGTTAAATTTAAACCGTATGCAATATGTCGATGTTTCTGCTCAGCTTCCAGAAAAATTATCTCGAA
CCAATTTGATTTTTGAACAGACCAATAATGAGTTTGTTCAAGGAGATGGAACTGAACCACCATCTATGTTGGGTGAATGG
GATCTTTCTGAAAAAACTGAAACCAATAATGAGATGATTCGTATCTCTGCGGATTTGGTTGAGAAGATGATCGATCTTTC
TGGTGAAAATGCCATTAACCGCTCGCGTATTGAAATGGATTTGGGTCAATTGGGAAATACATTGACCGATATGGAGCTTG
CGATTCAACGTTTGGCAGATCAGCTTCGTCGAATGGAAGGCGAGTTGGAAAGTCAAATTATTGCTAAACATGGGGATTTA
AGTGCGCGCTATGCGGACTTTGACCCATTGGAAATGGACCAATATTCATCCTTGAATCAATTGTCTAAATCGCTTGCTGA
ATCTGCATCTGACTTGGTGGACTTTAAAACCACCTTAGCGGAGAAAATTCGTGATACTGAAGGCTTATTATTGCAACAGT
CACGTATTCAAGCTGAAATTCAAGAAAGCTTGATGCGTACCCGACTTGTTCCTTTCTCTCGTTTATTACCACGATTACAG
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TAATATTTTAGAGAAATTAGTATCTCCATTAGAGCATATGTTGCGTAATGCCATCGACCACGGGATCGAAGATACAGAGC
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TGCATTCAGCTTGGGTGTGACAAACTATATGGGTAAACCATTCCAAGAGGCTGATTTATTAGCCAATATTGATGCTTTGT
TGACGGTTAAATAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
59.528 |
100 |
0.607 |