Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | rexA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | VB13_RS03130 | Genome accession | NZ_CP077685 |
| Coordinates | 608954..612583 (+) | Length | 1209 a.a. |
| NCBI ID | WP_306823236.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Streptococcus pyogenes strain M49 591 | ||
| Function | homologous recombination (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 603954..617583
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| VB13_RS03120 (VB13_03225) | - | 604671..605588 (-) | 918 | WP_012560586.1 | neutral zinc metallopeptidase | - |
| VB13_RS03125 (VB13_03230) | rexB | 605739..608954 (+) | 3216 | WP_009880800.1 | ATP-dependent nuclease subunit B | Machinery gene |
| VB13_RS03130 (VB13_03235) | rexA | 608954..612583 (+) | 3630 | WP_306823236.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| VB13_RS03135 (VB13_03240) | - | 612723..613535 (+) | 813 | WP_002992700.1 | transporter substrate-binding domain-containing protein | - |
| VB13_RS03140 (VB13_03245) | rpsU | 613676..613852 (+) | 177 | WP_000048058.1 | 30S ribosomal protein S21 | - |
| VB13_RS03145 (VB13_03250) | mscL | 613980..614342 (-) | 363 | WP_002990299.1 | large conductance mechanosensitive channel protein MscL | - |
| VB13_RS03150 (VB13_03255) | dnaG | 614472..616286 (+) | 1815 | WP_012560591.1 | DNA primase | - |
| VB13_RS03155 (VB13_03260) | rpoD | 616295..617404 (+) | 1110 | WP_002985187.1 | RNA polymerase sigma factor RpoD | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1209 a.a. Molecular weight: 138741.91 Da Isoelectric Point: 6.6144
>NTDB_id=506858 VB13_RS03130 WP_306823236.1 608954..612583(+) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain M49 591]
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Nucleotide
Download Length: 3630 bp
>NTDB_id=506858 VB13_RS03130 WP_306823236.1 608954..612583(+) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain M49 591]
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GGTGGAAAGCCAGAAATTGTCGAAGTTTAA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| rexA | Streptococcus pneumoniae R6 |
48.29 |
100 |
0.49 |