Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | rexA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | JHX98_RS03555 | Genome accession | NZ_CP067010 |
| Coordinates | 659614..663246 (+) | Length | 1210 a.a. |
| NCBI ID | WP_011889017.1 | Uniprot ID | A2RFA8 |
| Organism | Streptococcus pyogenes strain iGAS376 | ||
| Function | homologous recombination (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 654614..668246
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| JHX98_RS03545 (JHX98_03545) | - | 655334..656251 (-) | 918 | WP_010922125.1 | neutral zinc metallopeptidase | - |
| JHX98_RS03550 (JHX98_03550) | rexB | 656402..659617 (+) | 3216 | WP_011889018.1 | ATP-dependent nuclease subunit B | Machinery gene |
| JHX98_RS03555 (JHX98_03555) | rexA | 659614..663246 (+) | 3633 | WP_011889017.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| JHX98_RS03560 (JHX98_03560) | - | 663386..664198 (+) | 813 | WP_011528469.1 | transporter substrate-binding domain-containing protein | - |
| JHX98_RS03565 (JHX98_03565) | rpsU | 664339..664515 (+) | 177 | WP_000048058.1 | 30S ribosomal protein S21 | - |
| JHX98_RS03570 (JHX98_03570) | mscL | 664642..665004 (-) | 363 | WP_002990299.1 | large conductance mechanosensitive channel protein MscL | - |
| JHX98_RS03575 (JHX98_03575) | dnaG | 665133..666947 (+) | 1815 | WP_011889016.1 | DNA primase | - |
| JHX98_RS03580 (JHX98_03580) | rpoD | 666956..668065 (+) | 1110 | WP_002985187.1 | RNA polymerase sigma factor RpoD | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1210 a.a. Molecular weight: 138999.10 Da Isoelectric Point: 6.5804
>NTDB_id=456966 JHX98_RS03555 WP_011889017.1 659614..663246(+) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain iGAS376]
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Nucleotide
Download Length: 3633 bp
>NTDB_id=456966 JHX98_RS03555 WP_011889017.1 659614..663246(+) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain iGAS376]
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GAAATTATTAAGCTTCACAATGATAAGGGTGTCCCTTTTGAAGACATTACGTTACTCGTTTCTTCAAGAACAAGAAATGA
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GGAGGTGGAAAGCCAGAAATTGTCGAAGTTTAA
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Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| rexA | Streptococcus pneumoniae R6 |
48.448 |
100 |
0.49 |