Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | rexA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | JCR30_RS06335 | Genome accession | NZ_CP067008 |
| Coordinates | 1225810..1229442 (-) | Length | 1210 a.a. |
| NCBI ID | WP_011889017.1 | Uniprot ID | A2RFA8 |
| Organism | Streptococcus pyogenes strain iGAS426 | ||
| Function | homologous recombination (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 1220810..1234442
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| JCR30_RS06310 (JCR30_06310) | rpoD | 1220991..1222100 (-) | 1110 | WP_002985187.1 | RNA polymerase sigma factor RpoD | - |
| JCR30_RS06315 (JCR30_06315) | dnaG | 1222109..1223923 (-) | 1815 | WP_011889016.1 | DNA primase | - |
| JCR30_RS06320 (JCR30_06320) | mscL | 1224052..1224414 (+) | 363 | WP_002990299.1 | large conductance mechanosensitive channel protein MscL | - |
| JCR30_RS06325 (JCR30_06325) | rpsU | 1224541..1224717 (-) | 177 | WP_000048058.1 | 30S ribosomal protein S21 | - |
| JCR30_RS06330 (JCR30_06330) | - | 1224858..1225670 (-) | 813 | WP_011528469.1 | transporter substrate-binding domain-containing protein | - |
| JCR30_RS06335 (JCR30_06335) | rexA | 1225810..1229442 (-) | 3633 | WP_011889017.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| JCR30_RS06340 (JCR30_06340) | rexB | 1229439..1232654 (-) | 3216 | WP_011889018.1 | ATP-dependent nuclease subunit B | Machinery gene |
| JCR30_RS06345 (JCR30_06345) | - | 1232805..1233722 (+) | 918 | WP_010922125.1 | neutral zinc metallopeptidase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1210 a.a. Molecular weight: 138999.10 Da Isoelectric Point: 6.5804
>NTDB_id=456797 JCR30_RS06335 WP_011889017.1 1225810..1229442(-) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain iGAS426]
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Nucleotide
Download Length: 3633 bp
>NTDB_id=456797 JCR30_RS06335 WP_011889017.1 1225810..1229442(-) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain iGAS426]
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GGAGGTGGAAAGCCAGAAATTGTCGAAGTTTAA
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Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| rexA | Streptococcus pneumoniae R6 |
48.448 |
100 |
0.49 |