Detailed information
Overview
| Name | chpA | Type | Regulator |
| Locus tag | FYN22_RS11485 | Genome accession | NZ_CP043307 |
| Coordinates | 2351359..2355858 (-) | Length | 1499 a.a. |
| NCBI ID | WP_148826489.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 | ||
| Function | regulation of type IV pilus assembly (predicted from homology) Competence regulation |
||
Genomic Context
Location: 2346359..2360858
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| FYN22_RS11455 (FYN22_11455) | elsL | 2347407..2347910 (-) | 504 | WP_148826484.1 | cell wall-recycling L,D-carboxypeptidase ElsL | - |
| FYN22_RS11460 (FYN22_11460) | - | 2347910..2348302 (-) | 393 | WP_148826485.1 | YbaN family protein | - |
| FYN22_RS11465 (FYN22_11465) | - | 2348400..2349278 (+) | 879 | WP_148826486.1 | DUF1853 family protein | - |
| FYN22_RS11470 (FYN22_11470) | - | 2349435..2349581 (+) | 147 | WP_126035781.1 | entericidin A/B family lipoprotein | - |
| FYN22_RS11475 (FYN22_11475) | dapE | 2349698..2350831 (+) | 1134 | WP_148826487.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | - |
| FYN22_RS11480 (FYN22_11480) | - | 2350893..2351354 (-) | 462 | WP_148826488.1 | hypothetical protein | - |
| FYN22_RS11485 (FYN22_11485) | chpA | 2351359..2355858 (-) | 4500 | WP_148826489.1 | Hpt domain-containing protein | Regulator |
| FYN22_RS11490 (FYN22_11490) | - | 2356024..2358096 (-) | 2073 | WP_005399922.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| FYN22_RS11495 (FYN22_11495) | - | 2358147..2358683 (-) | 537 | WP_004694490.1 | chemotaxis protein CheW | - |
| FYN22_RS11500 (FYN22_11500) | - | 2358689..2359057 (-) | 369 | WP_004694491.1 | response regulator | - |
| FYN22_RS11505 (FYN22_11505) | pilG | 2359085..2359468 (-) | 384 | WP_004694493.1 | twitching motility response regulator PilG | Regulator |
| FYN22_RS11510 (FYN22_11510) | - | 2359749..2360387 (+) | 639 | WP_087010454.1 | hypothetical protein | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1499 a.a. Molecular weight: 167378.12 Da Isoelectric Point: 4.4030
>NTDB_id=382768 FYN22_RS11485 WP_148826489.1 2351359..2355858(-) (chpA) [Acinetobacter johnsonii strain Acsw19]
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Nucleotide
Download Length: 4500 bp
>NTDB_id=382768 FYN22_RS11485 WP_148826489.1 2351359..2355858(-) (chpA) [Acinetobacter johnsonii strain Acsw19]
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ATCAAGAAACCTTGTTGAGCATACGTCGTCACTTCCATACCTTAAAAGGCTCTGGTCGTATGGTAGGGGCAAAGTCAGCA
GGTGAAACAGCATGGGGGGTTGAAGATACCTTAAATCGTGTGATTTCAGGAGCTGTACCGCTCACAGCAACGGTTCAAAA
ATTTGCTAAGACAGTATTTAAACTGTATCAATTTAAACTGTATCCGACTTTTAAAGCGGTGCAGGAAATTGATCTTGATC
TTCGTCCATTGGTTTTAATTGGACAACAATTACAACAAAATCAAAGTTTAGAACCTGCTCTAGAAGAGTTGCTACAACTG
TCTAATCATCTAAATAGTAATGATGTCGTGACGGGATTAGAGCTGAGCGATATCGAAGTGGCTGAATCTGAGCCACAAGT
TGCAGACGTTTCTGAGCAGGATGATCAAGTGCATGATGTCCTTAAAGAAACTTTAGCGATCTTCATTGAAGAAGCCGAAG
ACCATTTAGCGACTATCGATCAGTTCTTAAATGCAGATGAAACCAAAGTACAAGATTACAATGGCTTAATCCGTGCTTTA
CATACATTGCGCGGTAGTTCGTCTATGGCGCAAATTGAGCATGTTTTTAATGCCAGCTCAAAAGTCGAAAATCTATTTAA
AACCTTGGTTCAAGAAGAGATCGTTTCTACTTCGAAGGAGATCTCTTTACTCACCCAATATGCTGAATTTGTGCGTGATT
ATTTACATGTGCTTGGGCGTGGTACGAACGAACAGCTTGATGTGATTTATGCTACGTTCACTACGGCTTGGGATAACTAT
GGTTTCAGTATAGAAGACGTAGACGATGAACTGAACCCACAAGGTATGGTCTCGAAGCTGATCGAGTTAAATATTGATCT
GTTGCTTGATGCCGAGTTTGAGTTTGATCAGCGTGCTAAGGTTGAATATCCAGACTATATTCAGCACTTAGGTGAACAAG
CAAAACAATTGCTAGAATTTACCAATAACCGTGCTGCTCAAGGAATTCATGACTTTACTTCTGAGCTATATGCTGGTTAT
CAAGCCTTACTGAAAAAGCCAGAATTACTCAATGTAGATTATGCATACGAGTTATTTGGTCAGGCACATCAAGAATTTAT
CCATTTATTTGACACTTTAGCTGCGGGTCAGCGCGTCATTCTGACTGAAGAAGTGCATAAAGTTTTGAATGAATTAATGG
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TTACAACCAAGTCTTGATCTTGCACAGATTTCGCAGCAAATTGCATCGGATCATCAGTACAAGCAATCGAATACAGCCAA
TACCGATTTTGATGATGATTTGCTTGATATCTTCTTGGAAGAAGCCGAAGAATTATTGATGGGGATGGATCAGGATCTCA
ATACTTGGTCTAAAAATGGCAATGATACCGCAGCGCTCAATAATTTAATGCGTTATTTGCACACCTTAAAAGGTGGTGCA
AATATGATTTCTGCACCTTTTATTGGTTCGATTGCACACGAATTAGAGTCTATTTATGAGCGTGTGATTCGTCAGCAAAT
AGCCACAACGCCACAGTTGATCAGCATCATTCGCTTAGTACAGGATGACGTCGCAGACCGAATTCAGGTCATTCGTACGG
AGAAGGTTGATTACCCAGCAACAGCGACCATTAAGGTATTGCATAACATTCAGAGCTTGGTTGAGGGTACGACTCTTACC
GCTTCAGCATCTGAGCCTTTGGTTGAGGCGTTTGTTAAAGCAATTGAAGAGGCTCAGCCTTCAGTTCAAGAACCTTTATC
TAATGTAGATAGCATAATTGAAGTTGAAATAACTGCTGTTGAGTCAGCAACTGCAATTGAAGCGTCGAGTGTAGTTGAAA
ACACTGATGTTACTGTCATTGAACAGCTGGATACTCCGTCACTTGTCCAAGAAGAAGCAGTCAGCGCTGTTGAAGAAGCA
GCTAGTCTTTTATCAATTGTTGAAGAAACTTTCTTGGAAGAAGCTGAAGAAATTTTAGCGACTACGGATGGCTTACTGAA
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AGTTCAAACGTGTATGACCCATTATTGCAAACCGCATTTGAATGGTTAAAACAAGCCATCTTCAAACGTGATTTTAGTAA
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TACAATTCTTGAACGTTTGGTTACGCCGTTTGAGCATATGCTACGTAACGCAATCGACCACGGTATTGAAGATACGGAAC
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TTGAGTAATATTGGACATTCATTGCCAGTGTTGTTAATTAAAGGCAATAGTGGACAAACCATTGCATTATTAGTCGATCA
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ATGAAAGAAATATTAAAACATTTAGTTGAAACTACAACGCTTCCGGAAGATAGTTATCTAGATCAAGATGCAGAAATTCT
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ATCAAGAAACCTTGTTGAGCATACGTCGTCACTTCCATACCTTAAAAGGCTCTGGTCGTATGGTAGGGGCAAAGTCAGCA
GGTGAAACAGCATGGGGGGTTGAAGATACCTTAAATCGTGTGATTTCAGGAGCTGTACCGCTCACAGCAACGGTTCAAAA
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TTCGTCCATTGGTTTTAATTGGACAACAATTACAACAAAATCAAAGTTTAGAACCTGCTCTAGAAGAGTTGCTACAACTG
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TGCAGACGTTTCTGAGCAGGATGATCAAGTGCATGATGTCCTTAAAGAAACTTTAGCGATCTTCATTGAAGAAGCCGAAG
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AACCTTGGTTCAAGAAGAGATCGTTTCTACTTCGAAGGAGATCTCTTTACTCACCCAATATGCTGAATTTGTGCGTGATT
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GGTTTCAGTATAGAAGACGTAGACGATGAACTGAACCCACAAGGTATGGTCTCGAAGCTGATCGAGTTAAATATTGATCT
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CAAAACAATTGCTAGAATTTACCAATAACCGTGCTGCTCAAGGAATTCATGACTTTACTTCTGAGCTATATGCTGGTTAT
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CCATTTATTTGACACTTTAGCTGCGGGTCAGCGCGTCATTCTGACTGAAGAAGTGCATAAAGTTTTGAATGAATTAATGG
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TTACAACCAAGTCTTGATCTTGCACAGATTTCGCAGCAAATTGCATCGGATCATCAGTACAAGCAATCGAATACAGCCAA
TACCGATTTTGATGATGATTTGCTTGATATCTTCTTGGAAGAAGCCGAAGAATTATTGATGGGGATGGATCAGGATCTCA
ATACTTGGTCTAAAAATGGCAATGATACCGCAGCGCTCAATAATTTAATGCGTTATTTGCACACCTTAAAAGGTGGTGCA
AATATGATTTCTGCACCTTTTATTGGTTCGATTGCACACGAATTAGAGTCTATTTATGAGCGTGTGATTCGTCAGCAAAT
AGCCACAACGCCACAGTTGATCAGCATCATTCGCTTAGTACAGGATGACGTCGCAGACCGAATTCAGGTCATTCGTACGG
AGAAGGTTGATTACCCAGCAACAGCGACCATTAAGGTATTGCATAACATTCAGAGCTTGGTTGAGGGTACGACTCTTACC
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GTATGGCGGAGAATGAACCCGTTGGTGCGATTGCTTATGAGCTAGAAACCACATTTGAGCAATTTGCTGTACATAATTTC
AGTTCAAACGTGTATGACCCATTATTGCAAACCGCATTTGAATGGTTAAAACAAGCCATCTTCAAACGTGATTTTAGTAA
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TTTAAAGATGATGGTAAGGGTATTGATGAAAGCACGATTAAAGCGAAAGCGCTAAACTTAGGTTTAATTAAAGCCGATCA
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TGGCTGAAAAGCAGGGGTAA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| chpA | Acinetobacter baumannii strain A118 |
60.395 |
100 |
0.612 |