Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | pilY1 | Type | Machinery gene |
| Locus tag | DN067_RS01620 | Genome accession | NZ_CP030083 |
| Coordinates | 342099..345953 (+) | Length | 1284 a.a. |
| NCBI ID | WP_000768970.1 | Uniprot ID | A0A7H2A3V4 |
| Organism | Acinetobacter baumannii strain Aba | ||
| Function | assembly of type IV pilus (predicted from homology) DNA binding and uptake |
||
Genomic Context
Location: 337099..350953
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| DN067_RS01590 | gmk | 337371..338000 (-) | 630 | WP_000015937.1 | guanylate kinase | - |
| DN067_RS01595 | ispH | 338123..339073 (+) | 951 | WP_000407064.1 | 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase | - |
| DN067_RS01600 | fimU | 339243..339716 (+) | 474 | WP_001214061.1 | Tfp pilus assembly protein FimT/FimU | Machinery gene |
| DN067_RS01605 | pilV | 339710..340270 (+) | 561 | WP_085916952.1 | type IV pilus modification protein PilV | Machinery gene |
| DN067_RS01610 | pilW | 340271..341272 (+) | 1002 | WP_000079200.1 | PilW family protein | Machinery gene |
| DN067_RS01615 | pilX | 341269..342087 (+) | 819 | WP_000149374.1 | PilX N-terminal domain-containing pilus assembly protein | Machinery gene |
| DN067_RS01620 | pilY1 | 342099..345953 (+) | 3855 | WP_000768970.1 | PilC/PilY family type IV pilus protein | Machinery gene |
| DN067_RS01625 | pilY2 | 345966..346448 (+) | 483 | WP_001046420.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| DN067_RS01630 | pilE | 346445..346870 (+) | 426 | WP_000788342.1 | type IV pilin protein | Machinery gene |
| DN067_RS01635 | rpsP | 347017..347268 (+) | 252 | WP_000260334.1 | 30S ribosomal protein S16 | - |
| DN067_RS01640 | rimM | 347288..347836 (+) | 549 | WP_000189236.1 | ribosome maturation factor RimM | - |
| DN067_RS01645 | trmD | 347882..348622 (+) | 741 | WP_000464598.1 | tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD | - |
| DN067_RS01650 | rplS | 348831..349199 (+) | 369 | WP_000014562.1 | 50S ribosomal protein L19 | - |
| DN067_RS01655 | - | 349252..350193 (-) | 942 | WP_085916958.1 | lipase family alpha/beta hydrolase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1284 a.a. Molecular weight: 138259.74 Da Isoelectric Point: 7.7712
>NTDB_id=298985 DN067_RS01620 WP_000768970.1 342099..345953(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain Aba]
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Nucleotide
Download Length: 3855 bp
>NTDB_id=298985 DN067_RS01620 WP_000768970.1 342099..345953(+) (pilY1) [Acinetobacter baumannii strain Aba]
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TTCAAACAGCATTTGTCGGTTTTGGTAGTGACTTTTCTAGTTTGAGTTCTTCTGATGTAAAAAATGCCTGCCGTTTAAGT
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GGTTATTTACGAGCTTTTGAGCCAAATCCAGCTAACACGTACTTAACATGGCGTGGAAATTTAAAGAAATATCATGTTGT
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| pilY1 | Acinetobacter baumannii D1279779 |
88.527 |
100 |
0.889 |