Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | comEC | Type | Machinery gene |
| Locus tag | CSC54_RS09415 | Genome accession | NZ_CP029655 |
| Coordinates | 1759386..1761587 (+) | Length | 733 a.a. |
| NCBI ID | WP_001557362.1 | Uniprot ID | A0A6K1MRM3 |
| Organism | Staphylococcus aureus strain AR_0469 | ||
| Function | ssDNA transport into the cell (predicted from homology) DNA binding and uptake |
||
Genomic Context
Location: 1754386..1766587
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CSC54_RS09375 (CSC54_1681) | aroE | 1754783..1755589 (+) | 807 | WP_000666757.1 | shikimate dehydrogenase | - |
| CSC54_RS09380 (CSC54_1682) | yhbY | 1755593..1755883 (+) | 291 | WP_000955235.1 | ribosome assembly RNA-binding protein YhbY | - |
| CSC54_RS09385 (CSC54_1683) | nadD | 1755886..1756455 (+) | 570 | WP_000725167.1 | nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase | - |
| CSC54_RS09390 (CSC54_1684) | yqeK | 1756445..1757029 (+) | 585 | WP_001019324.1 | bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical) YqeK | - |
| CSC54_RS09395 (CSC54_1685) | rsfS | 1757030..1757383 (+) | 354 | WP_001088020.1 | ribosome silencing factor | - |
| CSC54_RS09400 (CSC54_1686) | - | 1757386..1758102 (+) | 717 | WP_000084830.1 | class I SAM-dependent methyltransferase | - |
| CSC54_RS09405 (CSC54_1687) | comEA | 1758142..1758828 (+) | 687 | WP_001802022.1 | ComEA family DNA-binding protein | Machinery gene |
| CSC54_RS09410 (CSC54_1688) | - | 1758920..1759381 (+) | 462 | WP_000439693.1 | ComE operon protein 2 | - |
| CSC54_RS09415 (CSC54_1689) | comEC | 1759386..1761587 (+) | 2202 | WP_001557362.1 | DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2 | Machinery gene |
| CSC54_RS09420 (CSC54_1690) | holA | 1761644..1762618 (+) | 975 | WP_001282563.1 | DNA polymerase III subunit delta | - |
| CSC54_RS09425 (CSC54_1691) | rpsT | 1762663..1762914 (-) | 252 | WP_001274017.1 | 30S ribosomal protein S20 | - |
| CSC54_RS09430 (CSC54_1692) | lepA | 1763260..1765083 (+) | 1824 | WP_000368338.1 | translation elongation factor 4 | - |
Sequence
Protein
Download Length: 733 a.a. Molecular weight: 84998.05 Da Isoelectric Point: 10.0028
>NTDB_id=294636 CSC54_RS09415 WP_001557362.1 1759386..1761587(+) (comEC) [Staphylococcus aureus strain AR_0469]
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KVDSNSYGNASGL
Nucleotide
Download Length: 2202 bp
>NTDB_id=294636 CSC54_RS09415 WP_001557362.1 1759386..1761587(+) (comEC) [Staphylococcus aureus strain AR_0469]
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Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| comEC | Staphylococcus aureus N315 |
100 |
100 |
1 |
| comEC | Staphylococcus aureus MW2 |
98.772 |
100 |
0.988 |