Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | addA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | CFK78_RS06630 | Genome accession | NZ_CP032633 |
| Coordinates | 1315177..1318920 (+) | Length | 1247 a.a. |
| NCBI ID | WP_016265072.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Latilactobacillus sakei strain ZFM220 | ||
| Function | homologous recombination; plasmid transformation (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 1310177..1323920
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CFK78_RS06620 (CFK78_06620) | mvk | 1310409..1311356 (-) | 948 | WP_025015793.1 | mevalonate kinase | - |
| CFK78_RS06625 (CFK78_06625) | - | 1311633..1315193 (+) | 3561 | WP_016265071.1 | PD-(D/E)XK nuclease family protein | - |
| CFK78_RS06630 (CFK78_06630) | addA | 1315177..1318920 (+) | 3744 | WP_016265072.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| CFK78_RS06635 (CFK78_06635) | - | 1318986..1321820 (+) | 2835 | WP_085391439.1 | helicase C-terminal domain-containing protein | - |
| CFK78_RS06640 (CFK78_06640) | - | 1321898..1322374 (+) | 477 | WP_011374615.1 | DUF5590 domain-containing protein | - |
| CFK78_RS06645 (CFK78_06645) | asnS | 1322485..1323783 (+) | 1299 | WP_011374616.1 | asparagine--tRNA ligase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1247 a.a. Molecular weight: 141571.43 Da Isoelectric Point: 4.7686
>NTDB_id=276946 CFK78_RS06630 WP_016265072.1 1315177..1318920(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain ZFM220]
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Nucleotide
Download Length: 3744 bp
>NTDB_id=276946 CFK78_RS06630 WP_016265072.1 1315177..1318920(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain ZFM220]
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| addA | Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 |
37.51 |
100 |
0.382 |