Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | rexA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | SPYM_RS06145 | Genome accession | NC_009332 |
| Coordinates | 1211213..1214845 (-) | Length | 1210 a.a. |
| NCBI ID | WP_011889017.1 | Uniprot ID | A2RFA8 |
| Organism | Streptococcus pyogenes str. Manfredo | ||
| Function | homologous recombination (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 1206213..1219845
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SPYM_RS06120 (SpyM51207) | rpoD | 1206394..1207503 (-) | 1110 | WP_002985187.1 | RNA polymerase sigma factor RpoD | - |
| SPYM_RS06125 (SpyM51208) | dnaG | 1207512..1209326 (-) | 1815 | WP_011889016.1 | DNA primase | - |
| SPYM_RS06130 (SpyM51209) | mscL | 1209455..1209817 (+) | 363 | WP_002990299.1 | large conductance mechanosensitive channel protein MscL | - |
| SPYM_RS06135 (SpyM51210) | rpsU | 1209944..1210120 (-) | 177 | WP_000048058.1 | 30S ribosomal protein S21 | - |
| SPYM_RS06140 (SpyM51211) | - | 1210261..1211073 (-) | 813 | WP_011528469.1 | transporter substrate-binding domain-containing protein | - |
| SPYM_RS06145 (SpyM51212) | rexA | 1211213..1214845 (-) | 3633 | WP_011889017.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| SPYM_RS06150 (SpyM51213) | rexB | 1214842..1218057 (-) | 3216 | WP_011889018.1 | ATP-dependent nuclease subunit B | Machinery gene |
| SPYM_RS06155 (SpyM51214) | - | 1218208..1219125 (+) | 918 | WP_010922125.1 | neutral zinc metallopeptidase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1210 a.a. Molecular weight: 138999.10 Da Isoelectric Point: 6.5804
>NTDB_id=26495 SPYM_RS06145 WP_011889017.1 1211213..1214845(-) (rexA) [Streptococcus pyogenes str. Manfredo]
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Nucleotide
Download Length: 3633 bp
>NTDB_id=26495 SPYM_RS06145 WP_011889017.1 1211213..1214845(-) (rexA) [Streptococcus pyogenes str. Manfredo]
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GGAGGTGGAAAGCCAGAAATTGTCGAAGTTTAA
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Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| rexA | Streptococcus pneumoniae R6 |
48.448 |
100 |
0.49 |