Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | addA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | CW750_RS09055 | Genome accession | NZ_CP025136 |
| Coordinates | 1799081..1802815 (+) | Length | 1244 a.a. |
| NCBI ID | WP_226474277.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Latilactobacillus sakei strain WiKim0072 | ||
| Function | homologous recombination; plasmid transformation (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 1794081..1807815
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CW750_RS09045 (CW750_09055) | mvk | 1794304..1795251 (-) | 948 | WP_025015793.1 | mevalonate kinase | - |
| CW750_RS09050 (CW750_09060) | - | 1795528..1799088 (+) | 3561 | WP_099960287.1 | PD-(D/E)XK nuclease family protein | - |
| CW750_RS09055 (CW750_09065) | addA | 1799081..1802815 (+) | 3735 | WP_226474277.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| CW750_RS09060 (CW750_09070) | - | 1802881..1805715 (+) | 2835 | WP_129584163.1 | helicase C-terminal domain-containing protein | - |
| CW750_RS09065 (CW750_09075) | - | 1805793..1806269 (+) | 477 | WP_011374615.1 | DUF5590 domain-containing protein | - |
| CW750_RS09070 (CW750_09080) | asnS | 1806380..1807678 (+) | 1299 | WP_011374616.1 | asparagine--tRNA ligase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1244 a.a. Molecular weight: 141274.03 Da Isoelectric Point: 4.7686
>NTDB_id=217431 CW750_RS09055 WP_226474277.1 1799081..1802815(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain WiKim0072]
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Nucleotide
Download Length: 3735 bp
>NTDB_id=217431 CW750_RS09055 WP_226474277.1 1799081..1802815(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain WiKim0072]
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| addA | Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 |
37.51 |
100 |
0.383 |