Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | addA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | B4V05_RS04560 | Genome accession | NZ_CP020459 |
| Coordinates | 888530..892273 (+) | Length | 1247 a.a. |
| NCBI ID | WP_076981411.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Latilactobacillus sakei strain FAM18311 | ||
| Function | homologous recombination; plasmid transformation (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 883530..897273
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| B4V05_RS04550 (B4V05_04540) | mvk | 883758..884723 (-) | 966 | WP_076631864.1 | mevalonate kinase | - |
| B4V05_RS04555 (B4V05_04545) | - | 884986..888546 (+) | 3561 | WP_076631863.1 | PD-(D/E)XK nuclease family protein | - |
| B4V05_RS04560 (B4V05_04550) | addA | 888530..892273 (+) | 3744 | WP_076981411.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| B4V05_RS04565 (B4V05_04555) | - | 892339..895173 (+) | 2835 | WP_076631861.1 | helicase C-terminal domain-containing protein | - |
| B4V05_RS04570 (B4V05_04560) | - | 895251..895727 (+) | 477 | WP_011374615.1 | DUF5590 domain-containing protein | - |
| B4V05_RS04575 (B4V05_04565) | asnS | 895838..897136 (+) | 1299 | WP_076631860.1 | asparagine--tRNA ligase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1247 a.a. Molecular weight: 141584.58 Da Isoelectric Point: 4.8148
>NTDB_id=186845 B4V05_RS04560 WP_076981411.1 888530..892273(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain FAM18311]
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Nucleotide
Download Length: 3744 bp
>NTDB_id=186845 B4V05_RS04560 WP_076981411.1 888530..892273(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain FAM18311]
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GTCTCCAGAAACAAGATAAGGATTTAGCACAACCAACGAGCTTAGAAAATCAGGACGCCATCTCTGTTATGACCATTCAC
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AAAGCCAGTGACCCATAAATATCTCTATTTATTGTCAATTGGCGAGTTGGTTGAGATTAACTAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| addA | Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 |
37.49 |
100 |
0.383 |