Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | addA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | A4W85_RS04820 | Genome accession | NZ_CP017570 |
| Coordinates | 924755..928498 (+) | Length | 1247 a.a. |
| NCBI ID | WP_056947675.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Latilactobacillus sakei strain TMW 1.578 | ||
| Function | homologous recombination; plasmid transformation (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 919755..933498
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A4W85_RS04810 (A4W85_04760) | mvk | 919983..920948 (-) | 966 | WP_231952314.1 | mevalonate kinase | - |
| A4W85_RS04815 (A4W85_04765) | - | 921211..924771 (+) | 3561 | WP_056947677.1 | PD-(D/E)XK nuclease family protein | - |
| A4W85_RS04820 (A4W85_04770) | addA | 924755..928498 (+) | 3744 | WP_056947675.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| A4W85_RS04825 (A4W85_04775) | - | 928564..931398 (+) | 2835 | WP_056947673.1 | helicase C-terminal domain-containing protein | - |
| A4W85_RS04830 (A4W85_04780) | - | 931476..931952 (+) | 477 | WP_011374615.1 | DUF5590 domain-containing protein | - |
| A4W85_RS04835 (A4W85_04785) | asnS | 932063..933361 (+) | 1299 | WP_011374616.1 | asparagine--tRNA ligase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1247 a.a. Molecular weight: 141766.78 Da Isoelectric Point: 4.8355
>NTDB_id=169353 A4W85_RS04820 WP_056947675.1 924755..928498(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain TMW 1.578]
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Nucleotide
Download Length: 3744 bp
>NTDB_id=169353 A4W85_RS04820 WP_056947675.1 924755..928498(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain TMW 1.578]
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GCATGCTTTTTGTTTAAAAGTCATTAAACAATTTTATTACGTGATTGACCGTGATCCCGTATTCCGCTTATTGAGTGATA
CTGCAGAACGACTCCTCTTAGCGGATCAAGTATGGCAACGGGTGAGAGAAGCATTCTACAGCCACGAGTATGTTGAAAAG
GGCACCCAAGACACCTTATTTTACGAATTGGCCCAAAATTTCTCGAATGATCGTAACGATGACGGCCTAACCGACATTGT
TTTTGAGTTGCTCGATTTTGCAAATGCCAATCCAAACCCGGTTAAATGGTTAAACGAACTACCCAAAAGCTATGCTGTTG
ATGAGACTGGTTTGACTGCCAGTCGCTATTTCCAAGAAAAAATATTACCGATATTACAGCAAACACTCACCGAATGCTTA
GAAGCTTTACAAGAAGCTGAACAGCTCAGTCAAACTAGCGAAAATCTGATGGTTTATGCGCCTCAAATTACCACTACGCA
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TATTGGACTTTAGTGATTTAGAACAACTCTGTCTGACAATTTTATCGGCAGAAGATTCACCAGCAAGAGCCTTTTACCAA
CAAAAATTTAGCGAAGTGCTAGTTGATGAATACCAAGATACCAATCCGCTCCAAGAAACGATTATCCAAAAGGTCACTTC
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CGAAAATGCCGCCTTACAATATGGTGCTCGTTATTATCCTGACCAGCACCCAACCGCGCCAACCGAACTCTTGCTTTATG
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TTTACTAGCCCCAACCCGCGGTAATAATTTGTTTATCCTGGATTACTTTAAACGCTTCGGCTTGCCGGTTGTGATTAAGG
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GACGGATGATTATTATCAAGCGGTCTTTAACTTTATTGACCAATATAATGAGCAGAAAGTCGGCCACTTAGGCCAACAAG
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GTCTTCAAAAACAAGATAAGGATTTAGCACAACCAACGAGCTTAGAAAATCAAGACGCCATCTCTGTTATGACCATTCAC
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AATCACCTATTAACCTTCTTTGAAAGTGACTTGGGACAGCAATTATTAGCCCATCCAGAAGCGGTTAAGCGGGAAGTGCC
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AAAGCCAGTGACCCATAAATATCTTTATTTATTGTCAATTGGCGAACTGGTTGAGATTAACTAG
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GAGAAAGCGACCGAGCCAGCTGTTAAACAACGTTTACGGCAACAACTGAGTCTCGTGCCAACCGCACAAATCAGTACGCT
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TTTTGAGTTGCTCGATTTTGCAAATGCCAATCCAAACCCGGTTAAATGGTTAAACGAACTACCCAAAAGCTATGCTGTTG
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GAAGCTTTACAAGAAGCTGAACAGCTCAGTCAAACTAGCGAAAATCTGATGGTTTATGCGCCTCAAATTACCACTACGCA
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TAGGACCTGCTAAACGCACTAAGAAATTAGAGCCTGATGAACAAATTAATAAAGACCGTCTGAAAGCCGATTTAGATGAT
GTCAAAAAGAAAATCCAAACGTTATTAGACACTTATTTTGTGTTTGATGAAGCAACCACCACTAATATTCAGCGCCAAGC
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AAAGCCAGTGACCCATAAATATCTTTATTTATTGTCAATTGGCGAACTGGTTGAGATTAACTAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| addA | Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 |
37.52 |
100 |
0.383 |