Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | addA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | A4W81_RS04765 | Genome accession | NZ_CP016465 |
| Coordinates | 926583..930317 (+) | Length | 1244 a.a. |
| NCBI ID | WP_337962302.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Latilactobacillus sakei strain TMW 1.3 | ||
| Function | homologous recombination; plasmid transformation (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 921583..935317
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A4W81_RS04755 (A4W81_04665) | mvk | 921802..922767 (-) | 966 | WP_337962306.1 | mevalonate kinase | - |
| A4W81_RS04760 (A4W81_04670) | - | 923030..926590 (+) | 3561 | WP_076631863.1 | PD-(D/E)XK nuclease family protein | - |
| A4W81_RS04765 (A4W81_04675) | addA | 926583..930317 (+) | 3735 | WP_337962302.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| A4W81_RS04770 (A4W81_04680) | - | 930383..933217 (+) | 2835 | WP_076631861.1 | helicase C-terminal domain-containing protein | - |
| A4W81_RS04775 (A4W81_04685) | - | 933295..933771 (+) | 477 | WP_011374615.1 | DUF5590 domain-containing protein | - |
| A4W81_RS04780 (A4W81_04690) | asnS | 933882..935180 (+) | 1299 | WP_076631860.1 | asparagine--tRNA ligase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1244 a.a. Molecular weight: 141317.21 Da Isoelectric Point: 4.8148
>NTDB_id=160347 A4W81_RS04765 WP_337962302.1 926583..930317(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain TMW 1.3]
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Nucleotide
Download Length: 3735 bp
>NTDB_id=160347 A4W81_RS04765 WP_337962302.1 926583..930317(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain TMW 1.3]
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GTTTGACTGCCAGTGATTATTTCCAAGAAAAAATATTACCCATTTTACAGCAAACCATCACCGAATGCTTGGAAGCCTTA
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3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| addA | Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 |
37.49 |
100 |
0.384 |