Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | addA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | LSAF01_RS04575 | Genome accession | NZ_LT960777 |
| Coordinates | 903540..907283 (+) | Length | 1247 a.a. |
| NCBI ID | WP_056947675.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Latilactobacillus sakei strain FLEC01 | ||
| Function | homologous recombination; plasmid transformation (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 898540..912283
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LSAF01_RS04565 (LSAF01_0916) | mvk | 898768..899715 (-) | 948 | WP_096585801.1 | mevalonate kinase | - |
| LSAF01_RS04570 (LSAF01_0917) | - | 899996..903556 (+) | 3561 | WP_099947652.1 | PD-(D/E)XK nuclease family protein | - |
| LSAF01_RS04575 (LSAF01_0918) | addA | 903540..907283 (+) | 3744 | WP_056947675.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| LSAF01_RS04580 (LSAF01_0919) | - | 907349..910183 (+) | 2835 | WP_099947653.1 | helicase C-terminal domain-containing protein | - |
| LSAF01_RS04585 (LSAF01_0920) | - | 910261..910737 (+) | 477 | WP_011374615.1 | DUF5590 domain-containing protein | - |
| LSAF01_RS04590 (LSAF01_0921) | asnS | 910848..912146 (+) | 1299 | WP_011374616.1 | asparagine--tRNA ligase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1247 a.a. Molecular weight: 141766.78 Da Isoelectric Point: 4.8355
>NTDB_id=1032277 LSAF01_RS04575 WP_056947675.1 903540..907283(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain FLEC01]
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Nucleotide
Download Length: 3744 bp
>NTDB_id=1032277 LSAF01_RS04575 WP_056947675.1 903540..907283(+) (addA) [Latilactobacillus sakei strain FLEC01]
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CTGCAGAACGACTCCTCTTAGCGGATCAAGTATGGCAACGGGTGAGAGAAGCATTCTACAGCCACGAGTATGTTGAAAAG
GGCACCCAAGACACCTTATTTTACGAATTGGCCCAAAATTTCTCGAATGATCGTAACGATGACGGCCTAACCGACATTGT
TTTTGAGTTGCTCGATTTTGCAAATGCCAATCCAAACCCGGTTAAATGGTTAAACGAACTACCCAAAAGCTATGCTGTTG
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GAAGCTTTACAAGAAGCTGAACAGCTCAGTCAAACTAGCGAAAATCTGATGGTTTATGCGCCTCAAATTACCACTACGCA
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TATTGGACTTTAGTGATTTAGAACAACTCTGTCTGACAATTTTATCGGCAGAAGATTCACCAGCAAGAGCCTTTTACCAA
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TGATCATCCACGCAATCTCTTCATGGTCGGGGATGTTAAGCAGTCAATTTATGCTTTCCGATTGGCCGATCCAAGCTTAT
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AATCACCTATTAACCTTCTTTGAAAGTGACTTGGGACAGCAATTATTAGCCCATCCAGAAGCGGTTAAGCGGGAAGTGCC
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AAAGCCAGTGACCCATAAATATCTTTATTTATTGTCAATTGGCGAACTGGTTGAGATTAACTAG
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AAAGCCAGTGACCCATAAATATCTTTATTTATTGTCAATTGGCGAACTGGTTGAGATTAACTAG
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| addA | Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 |
37.52 |
100 |
0.383 |