Detailed information
Bioinformatically predicted
Overview
| Name | rexA | Type | Machinery gene |
| Locus tag | DQM35_RS06035 | Genome accession | NZ_LS483338 |
| Coordinates | 1161883..1165512 (-) | Length | 1209 a.a. |
| NCBI ID | WP_324293431.1 | Uniprot ID | - |
| Organism | Streptococcus pyogenes strain NCTC12064 | ||
| Function | homologous recombination (predicted from homology) Homologous recombination |
||
Genomic Context
Location: 1156883..1170512
| Locus tag | Gene name | Coordinates (strand) | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| DQM35_RS06010 (NCTC12064_01188) | rpoD | 1157071..1158180 (-) | 1110 | WP_002985187.1 | RNA polymerase sigma factor RpoD | - |
| DQM35_RS06015 (NCTC12064_01189) | dnaG | 1158189..1159949 (-) | 1761 | WP_042361554.1 | DNA primase | - |
| DQM35_RS06020 (NCTC12064_01190) | mscL | 1160124..1160498 (+) | 375 | WP_020833401.1 | large conductance mechanosensitive channel protein MscL | - |
| DQM35_RS06025 (NCTC12064_01191) | rpsU | 1160614..1160790 (-) | 177 | WP_000048058.1 | 30S ribosomal protein S21 | - |
| DQM35_RS06030 (NCTC12064_01192) | - | 1160931..1161743 (-) | 813 | WP_014635388.1 | transporter substrate-binding domain-containing protein | - |
| DQM35_RS06035 (NCTC12064_01193) | rexA | 1161883..1165512 (-) | 3630 | WP_324293431.1 | helicase-exonuclease AddAB subunit AddA | Machinery gene |
| DQM35_RS06040 (NCTC12064_01194) | rexB | 1165512..1168727 (-) | 3216 | WP_020833399.1 | ATP-dependent nuclease subunit B | Machinery gene |
| DQM35_RS06045 (NCTC12064_01195) | - | 1168878..1169795 (+) | 918 | WP_002993034.1 | neutral zinc metallopeptidase | - |
Sequence
Protein
Download Length: 1209 a.a. Molecular weight: 138798.00 Da Isoelectric Point: 6.7048
>NTDB_id=1018485 DQM35_RS06035 WP_324293431.1 1161883..1165512(-) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain NCTC12064]
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Nucleotide
Download Length: 3630 bp
>NTDB_id=1018485 DQM35_RS06035 WP_324293431.1 1161883..1165512(-) (rexA) [Streptococcus pyogenes strain NCTC12064]
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GGTGGAAAGCCAGAAATTGTCGAAGTTTAA
3D structure
| Source | ID | Structure |
|---|
Similar proteins
Only experimentally validated proteins are listed.
| Protein | Organism | Identities (%) | Coverage (%) | Ha-value |
|---|---|---|---|---|
| rexA | Streptococcus pneumoniae R6 |
48.29 |
100 |
0.49 |