MGE detailed information
MGE type: Integrative_Conjugative_Elements MGE length: 126848 bp
Accession: NZ_CP078006 Location: 1319708..1446555 Organism: Pseudomonas aeruginosa strain NDTH7329 Replicon: chromosome
Accession: NZ_CP078006 Location: 1319708..1446555 Organism: Pseudomonas aeruginosa strain NDTH7329 Replicon: chromosome
Gene structure
The 5 kb flanking regions of this MGE are displayed.
| Locus tag | Coordinates | Strand | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| KUU80_RS06270 (KUU80_06270) | 1315369..1316667 | + | 1299 | WP_003086128.1 | Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB | - |
| KUU80_RS06275 (KUU80_06275) | 1316720..1317226 | + | 507 | WP_003111417.1 | peptidoglycan-associated lipoprotein Pal | - |
| KUU80_RS06280 (KUU80_06280) | 1317236..1318060 | + | 825 | WP_025297304.1 | tol-pal system protein YbgF | - |
| KUU80_RS06285 (KUU80_06285) | 1318280..1318927 | + | 648 | WP_003111416.1 | 7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE | - |
| KUU80_RS06290 (KUU80_06290) | 1318943..1319617 | + | 675 | WP_003111415.1 | 7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC | - |
| KUU80_RS06300 (KUU80_06300) | 1320123..1321406 | - | 1284 | WP_070136192.1 | Tyrosine recombinase XerC ; Integrase | Integrase |
| KUU80_RS06305 (KUU80_06305) | 1321403..1323322 | - | 1920 | WP_023132239.1 | MobH family relaxase | - |
| KUU80_RS06310 (KUU80_06310) | 1323709..1324203 | + | 495 | WP_126709954.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06315 (KUU80_06315) | 1324407..1324733 | + | 327 | WP_031637855.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06320 (KUU80_06320) | 1324733..1325158 | + | 426 | WP_124082625.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06325 (KUU80_06325) | 1325233..1326162 | + | 930 | WP_023132233.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06330 (KUU80_06330) | 1326379..1327409 | + | 1031 | Protein_1257 | IS110 family transposase ISAve1 | Transposase |
| KUU80_RS06335 (KUU80_06335) | 1327771..1328718 | + | 948 | WP_023132236.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06340 (KUU80_06340) | 1328799..1329371 | + | 573 | WP_223697232.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06345 (KUU80_06345) | 1329883..1330980 | + | 1098 | WP_023132238.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06350 (KUU80_06350) | 1331279..1333261 | - | 1983 | WP_031685017.1 | UvrD-helicase domain-containing protein | - |
| KUU80_RS06355 (KUU80_06355) | 1333258..1335321 | - | 2064 | WP_031685019.1 | AAA family ATPase | - |
| KUU80_RS06360 (KUU80_06360) | 1335638..1336006 | - | 369 | WP_223697230.1 | molecular chaperone DnaJ | - |
| KUU80_RS06365 (KUU80_06365) | 1336035..1336664 | - | 630 | WP_023132232.1 | His-Xaa-Ser repeat protein HxsA | - |
| KUU80_RS06370 (KUU80_06370) | 1336661..1337890 | - | 1230 | WP_019726887.1 | His-Xaa-Ser system radical SAM maturase HxsC | - |
| KUU80_RS06375 (KUU80_06375) | 1337894..1339381 | - | 1488 | WP_019726886.1 | His-Xaa-Ser system radical SAM maturase HxsB | - |
| KUU80_RS06380 (KUU80_06380) | 1339382..1339684 | - | 303 | WP_023123902.1 | His-Xaa-Ser system protein HxsD | - |
| KUU80_RS06390 (KUU80_06390) | 1341141..1341491 | - | 351 | WP_019726883.1 | type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin | - |
| KUU80_RS06395 (KUU80_06395) | 1341495..1341767 | - | 273 | WP_023123900.1 | type II toxin-antitoxin system ParD family antitoxin | - |
| KUU80_RS06400 (KUU80_06400) | 1341886..1342233 | + | 348 | WP_078452267.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06405 (KUU80_06405) | 1342282..1343808 | - | 1527 | WP_023132230.1 | conjugal transfer protein TraG N-terminal domain-containing protein | - |
| KUU80_RS06410 (KUU80_06410) | 1343805..1344152 | - | 348 | WP_023132229.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06415 (KUU80_06415) | 1344152..1345534 | - | 1383 | WP_023132228.1 | integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06420 (KUU80_06420) | 1345552..1346490 | - | 939 | WP_023132227.1 | TIGR03756 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06425 (KUU80_06425) | 1346490..1346921 | - | 432 | WP_079276319.1 | TIGR03757 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06430 (KUU80_06430) | 1347337..1348785 | + | 1449 | WP_031637852.1 | Catalase | VF |
| KUU80_RS06435 (KUU80_06435) | 1349142..1349999 | - | 858 | WP_023123892.1 | alpha/beta hydrolase | - |
| KUU80_RS06440 (KUU80_06440) | 1350038..1350649 | + | 612 | WP_023123891.1 | glutathione S-transferase family protein | - |
| KUU80_RS06445 (KUU80_06445) | 1351035..1351772 | + | 738 | WP_023123890.1 | pirin family protein | - |
| KUU80_RS06450 (KUU80_06450) | 1351861..1352448 | + | 588 | WP_049874762.1 | isochorismatase family protein | - |
| KUU80_RS06455 (KUU80_06455) | 1352683..1353891 | + | 1209 | WP_023123889.1 | Multidrug export protein EmrA | VF |
| KUU80_RS06460 (KUU80_06460) | 1353907..1355427 | + | 1521 | WP_031637850.1 | MFS transporter | - |
| KUU80_RS06465 (KUU80_06465) | 1355778..1356668 | + | 891 | WP_191519284.1 | HTH-type transcriptional regulator DmlR | VF |
| KUU80_RS06470 (KUU80_06470) | 1356834..1357070 | - | 237 | Protein_1285 | integrase core domain-containing protein | - |
| KUU80_RS06475 (KUU80_06475) | 1357161..1358343 | + | 1183 | Protein_1286 | IS3 family transposase ISButh1 | Transposase |
| KUU80_RS06480 (KUU80_06480) | 1358463..1359548 | - | 1086 | WP_057391219.1 | alkene reductase | - |
| KUU80_RS06485 (KUU80_06485) | 1359841..1360604 | + | 764 | Protein_1288 | IS5 family transposase | - |
| KUU80_RS06490 (KUU80_06490) | 1360796..1361683 | + | 888 | WP_023123882.1 | Glycine cleavage system transcriptional activator | VF |
| KUU80_RS06495 (KUU80_06495) | 1361729..1362634 | - | 906 | WP_023132220.1 | MBL fold metallo-hydrolase | - |
| KUU80_RS06500 (KUU80_06500) | 1363206..1363490 | - | 285 | WP_003086159.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06505 (KUU80_06505) | 1363487..1366429 | - | 2943 | WP_023132219.1 | conjugative transfer ATPase | - |
| KUU80_RS06510 (KUU80_06510) | 1366429..1366872 | - | 444 | WP_003125338.1 | TIGR03751 family conjugal transfer lipoprotein | - |
| KUU80_RS06515 (KUU80_06515) | 1366850..1368355 | - | 1506 | WP_003121021.1 | TIGR03752 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06520 (KUU80_06520) | 1368339..1369223 | - | 885 | WP_003121020.1 | TIGR03749 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06525 (KUU80_06525) | 1369220..1369879 | - | 660 | WP_003117079.1 | TIGR03746 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06530 (KUU80_06530) | 1369876..1370262 | - | 387 | WP_003117078.1 | TIGR03750 family conjugal transfer protein | - |
| KUU80_RS06535 (KUU80_06535) | 1370273..1370629 | - | 357 | WP_015503608.1 | TIGR03745 family integrating conjugative element membrane protein | - |
| KUU80_RS06540 (KUU80_06540) | 1370647..1370886 | - | 240 | WP_003125330.1 | TIGR03758 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06545 (KUU80_06545) | 1370883..1371221 | - | 339 | WP_043541096.1 | RAQPRD family integrative conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06550 (KUU80_06550) | 1371314..1371625 | - | 312 | WP_015503606.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06555 (KUU80_06555) | 1371868..1372731 | + | 864 | WP_071547486.1 | DUF5677 domain-containing protein | - |
| KUU80_RS06560 (KUU80_06560) | 1372803..1373549 | - | 747 | WP_015503605.1 | TIGR03747 family integrating conjugative element membrane protein | - |
| KUU80_RS06565 (KUU80_06565) | 1373549..1375780 | - | 2232 | WP_015503604.1 | type IV conjugative transfer system coupling protein TraD | - |
| KUU80_RS06570 (KUU80_06570) | 1375784..1376053 | - | 270 | WP_015503603.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06575 (KUU80_06575) | 1376062..1376562 | - | 501 | WP_057383618.1 | integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06580 (KUU80_06580) | 1376559..1377140 | - | 582 | WP_023102703.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS06585 (KUU80_06585) | 1377125..1377880 | - | 756 | WP_191519283.1 | TIGR03759 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS06590 (KUU80_06590) | 1377891..1378580 | - | 690 | WP_191519282.1 | methyl-accepting chemotaxis protein | - |
| KUU80_RS06595 (KUU80_06595) | 1378918..1381065 | + | 2148 | WP_191519281.1 | Toxin RTX-I translocation ATP-binding protein | VF |
| KUU80_RS06600 (KUU80_06600) | 1381068..1382483 | + | 1416 | WP_191519280.1 | Hemolysin secretion protein D, chromosomal | VF |
| KUU80_RS06605 (KUU80_06605) | 1382509..1383720 | + | 1212 | WP_191519279.1 | glycosyltransferase family 4 protein | - |
| KUU80_RS06610 (KUU80_06610) | 1384162..1384848 | + | 687 | WP_191519278.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06615 (KUU80_06615) | 1384875..1395152 | + | 10278 | WP_191519277.1 | Bifunctional hemolysin/adenylate cyclase | VF |
| KUU80_RS06620 (KUU80_06620) | 1395337..1397586 | - | 2250 | WP_191519276.1 | DEAD/DEAH box helicase | - |
| KUU80_RS06625 (KUU80_06625) | 1397691..1399136 | - | 1446 | WP_191519275.1 | DUF6094 domain-containing protein | - |
| KUU80_RS06630 (KUU80_06630) | 1399166..1399771 | - | 606 | WP_109242452.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06635 (KUU80_06635) | 1399864..1400118 | - | 255 | WP_003117062.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06640 (KUU80_06640) | 1400186..1400548 | - | 363 | WP_003117061.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06645 (KUU80_06645) | 1400831..1401442 | - | 612 | Protein_1320 | DUF3275 family protein | - |
| KUU80_RS06650 (KUU80_06650) | 1401499..1401849 | - | 351 | WP_003099791.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06655 (KUU80_06655) | 1402085..1402792 | - | 708 | WP_191519273.1 | ABC transporter substrate-binding protein | - |
| KUU80_RS06660 (KUU80_06660) | 1403278..1403475 | - | 198 | WP_009315817.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06665 (KUU80_06665) | 1403550..1403708 | - | 159 | WP_016264236.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06670 (KUU80_06670) | 1403847..1404335 | - | 489 | WP_016264237.1 | STY4534 family ICE replication protein | - |
| KUU80_RS33405 | 1404659..1404793 | - | 135 | WP_003121000.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06675 (KUU80_06675) | 1404795..1404974 | - | 180 | WP_004347955.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06680 (KUU80_06680) | 1405047..1405436 | - | 390 | WP_191519272.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06685 (KUU80_06685) | 1405435..1405806 | + | 372 | WP_191519271.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06690 (KUU80_06690) | 1406350..1406787 | - | 438 | WP_009315821.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS06695 (KUU80_06695) | 1406816..1408144 | - | 1329 | WP_191519270.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS06700 (KUU80_06700) | 1408149..1409090 | - | 942 | WP_003134125.1 | ATPase, T2SS/T4P/T4SS family | - |
| KUU80_RS06705 (KUU80_06705) | 1409087..1409617 | - | 531 | WP_003099765.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS06710 (KUU80_06710) | 1409639..1410718 | - | 1080 | WP_003123335.1 | Toxin coregulated pilus biosynthesis protein E | VF |
| KUU80_RS06715 (KUU80_06715) | 1410718..1412298 | - | 1581 | WP_191519269.1 | Toxin coregulated pilus biosynthesis protein T | VF |
| KUU80_RS06720 (KUU80_06720) | 1412307..1412840 | - | 534 | WP_003099760.1 | type IV pilus biogenesis protein PilP | - |
| KUU80_RS06725 (KUU80_06725) | 1412830..1414155 | - | 1326 | WP_003099758.1 | type 4b pilus protein PilO2 | - |
| KUU80_RS06730 (KUU80_06730) | 1414159..1415868 | - | 1710 | WP_191519268.1 | Outer membrane lipoprotein BfpB | VF |
| KUU80_RS06735 (KUU80_06735) | 1415868..1416992 | - | 1125 | WP_191519267.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS06740 (KUU80_06740) | 1417534..1419888 | + | 2355 | WP_191519266.1 | S-type pyocin domain-containing protein | - |
| KUU80_RS06745 (KUU80_06745) | 1419888..1420355 | + | 468 | WP_191519265.1 | DUF6392 family protein | - |
| KUU80_RS06750 (KUU80_06750) | 1420446..1422452 | - | 2007 | WP_196994075.1 | DEAD/DEAH box helicase | - |
| KUU80_RS06755 (KUU80_06755) | 1422449..1424338 | - | 1890 | WP_191519263.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06760 (KUU80_06760) | 1424450..1425196 | - | 747 | WP_223723588.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06765 (KUU80_06765) | 1425210..1427135 | - | 1926 | WP_191519261.1 | type I DNA topoisomerase | - |
| KUU80_RS06770 (KUU80_06770) | 1427441..1427683 | + | 243 | WP_170869361.1 | type II toxin-antitoxin system VapB family antitoxin | Antitoxin Detail |
| KUU80_RS06775 (KUU80_06775) | 1427683..1428093 | + | 411 | WP_003134109.1 | tRNA(fMet)-specific endonuclease VapC | Toxin Detail |
| KUU80_RS06780 (KUU80_06780) | 1428109..1428270 | + | 162 | WP_191519260.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06785 (KUU80_06785) | 1428320..1428538 | + | 219 | WP_023083218.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06790 (KUU80_06790) | 1428604..1428801 | - | 198 | WP_191519259.1 | CrpP family ICE-associated protein | - |
| KUU80_RS06795 (KUU80_06795) | 1429300..1429788 | - | 489 | WP_023104904.1 | single-stranded DNA-binding protein | - |
| KUU80_RS06800 (KUU80_06800) | 1429802..1430332 | - | 531 | WP_121372660.1 | DUF3158 family protein | - |
| KUU80_RS06805 (KUU80_06805) | 1430338..1431066 | - | 729 | WP_009315862.1 | TIGR03761 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS33410 | 1431223..1431735 | - | 513 | WP_223697281.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06820 (KUU80_06820) | 1431732..1433057 | - | 1326 | WP_191519258.1 | STY4528 family pathogenicity island replication protein | - |
| KUU80_RS06825 (KUU80_06825) | 1433054..1433809 | - | 756 | WP_009315870.1 | DUF2857 domain-containing protein | - |
| KUU80_RS06830 (KUU80_06830) | 1433837..1435579 | - | 1743 | WP_191519257.1 | ParB family protein | - |
| KUU80_RS06835 (KUU80_06835) | 1435576..1435830 | - | 255 | WP_009316384.1 | Arc family DNA-binding protein | - |
| KUU80_RS06840 (KUU80_06840) | 1435833..1436849 | - | 1017 | WP_191519256.1 | nucleoid-associated protein YejK | - |
| KUU80_RS06845 (KUU80_06845) | 1436849..1437082 | - | 234 | WP_191519255.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06850 (KUU80_06850) | 1437075..1437569 | - | 495 | WP_191519468.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06855 (KUU80_06855) | 1437562..1437819 | - | 258 | WP_121286401.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06860 (KUU80_06860) | 1437816..1438343 | - | 528 | WP_057389190.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06865 (KUU80_06865) | 1438333..1438518 | - | 186 | WP_079752170.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06870 (KUU80_06870) | 1438696..1439133 | + | 438 | WP_057389191.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06875 (KUU80_06875) | 1439233..1439883 | - | 651 | WP_222821683.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06880 (KUU80_06880) | 1439940..1441283 | - | 1344 | WP_057389192.1 | replicative DNA helicase | - |
| KUU80_RS06885 (KUU80_06885) | 1441280..1441498 | - | 219 | WP_003103847.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06890 (KUU80_06890) | 1441482..1442188 | - | 707 | Protein_1369 | HNH endonuclease | - |
| KUU80_RS06895 (KUU80_06895) | 1442185..1442886 | - | 702 | WP_003103849.1 | DUF2786 domain-containing protein | - |
| KUU80_RS06900 (KUU80_06900) | 1442886..1443572 | - | 687 | WP_128709433.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06905 (KUU80_06905) | 1443569..1444315 | - | 747 | WP_191519463.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06910 (KUU80_06910) | 1444321..1444818 | - | 498 | WP_128709434.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06915 (KUU80_06915) | 1444815..1445552 | - | 738 | WP_128709435.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS06920 (KUU80_06920) | 1445554..1446414 | - | 861 | WP_003158180.1 | ParA family protein | - |
| KUU80_RS33415 | 1446919..1447305 | - | 387 | Protein_1376 | recombinase XerC | - |
| KUU80_RS06930 (KUU80_06930) | 1450481..1450699 | + | 219 | WP_031755419.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS33420 | 1450696..1450848 | - | 153 | Protein_1379 | protein-disulfide isomerase | - |
| KUU80_RS06935 (KUU80_06935) | 1450913..1451363 | + | 451 | Protein_1380 | GNAT family N-acetyltransferase | - |
Similar MGE(s)
Similar MGE(s) is defined as other TA-related MGE(s) with Mash distance < 0.01 to this MGE.
| Detail | Organism | MGE type | Related TA | Genome accession | Coordinates | Mash distance |
|---|