MGE detailed information
MGE type: Non-Mobilizable plasmid MGE length: 52983 bp
Accession: NZ_CP077996 Location: 1..52983 Organism: Pseudomonas aeruginosa strain SRRSH2790 Replicon: plasmid p2
Accession: NZ_CP077996 Location: 1..52983 Organism: Pseudomonas aeruginosa strain SRRSH2790 Replicon: plasmid p2
Gene structure
The 5 kb flanking regions of this MGE are displayed.
Locus tag | Coordinates | Strand | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
---|---|---|---|---|---|---|
KUU72_RS32760 (KUU72_32755) | 1..816 | + | 816 | WP_196994190.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32765 (KUU72_32760) | 1847..2641 | + | 795 | WP_031655076.1 | DUF3560 domain-containing protein | - |
KUU72_RS32770 (KUU72_32765) | 2913..3983 | + | 1071 | WP_196994191.1 | DNA-binding protein | - |
KUU72_RS32775 (KUU72_32770) | 4022..4288 | + | 267 | WP_196994192.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32780 (KUU72_32775) | 4364..4555 | + | 192 | WP_196994193.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32785 (KUU72_32780) | 4584..4883 | + | 300 | WP_196994194.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32790 (KUU72_32785) | 4996..5202 | + | 207 | WP_152996423.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32795 (KUU72_32790) | 5229..5483 | + | 255 | WP_196994195.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32800 (KUU72_32795) | 6069..6746 | + | 678 | WP_034018017.1 | SOS response-associated peptidase | - |
KUU72_RS32805 (KUU72_32800) | 6855..7157 | + | 303 | WP_023131919.1 | anti-CRISPR protein AcrE1 | - |
KUU72_RS32810 (KUU72_32805) | 7180..7602 | + | 423 | WP_196994196.1 | anti-CRISPR protein AcrF3 | - |
KUU72_RS32815 (KUU72_32810) | 7615..7854 | + | 240 | WP_196994197.1 | anti-CRISPR protein | - |
KUU72_RS33345 | 7851..8054 | + | 204 | WP_031757130.1 | helix-turn-helix transcriptional regulator | - |
KUU72_RS32820 (KUU72_32815) | 8150..8470 | + | 321 | WP_196994198.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32825 (KUU72_32820) | 8952..9368 | + | 417 | WP_196994199.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32830 (KUU72_32825) | 9459..9734 | - | 276 | WP_019727125.1 | type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin | Toxin Detail |
KUU72_RS32835 (KUU72_32830) | 9734..10009 | - | 276 | WP_019727126.1 | ribbon-helix-helix domain-containing protein | Antitoxin Detail |
KUU72_RS32840 (KUU72_32835) | 10284..10670 | + | 387 | WP_019727127.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32845 (KUU72_32840) | 10731..11024 | + | 294 | WP_019727128.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32850 (KUU72_32845) | 11348..11656 | + | 309 | WP_019727129.1 | TrfB-related DNA-binding protein | - |
KUU72_RS32855 (KUU72_32850) | 12306..12758 | + | 453 | WP_019727132.1 | DNA repair protein RadC | - |
KUU72_RS32860 (KUU72_32855) | 13196..13444 | + | 249 | WP_058130600.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32865 (KUU72_32860) | 13494..13745 | - | 252 | WP_058130599.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32870 (KUU72_32865) | 13804..14088 | + | 285 | WP_019727136.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32875 (KUU72_32870) | 14215..14493 | - | 279 | WP_222825899.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32880 (KUU72_32875) | 14907..16880 | + | 1974 | WP_196994200.1 | ParB/RepB/Spo0J family partition protein | - |
KUU72_RS32885 (KUU72_32880) | 16911..17234 | + | 324 | WP_025982297.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32890 (KUU72_32885) | 17447..17962 | - | 516 | WP_128570131.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32895 (KUU72_32890) | 17972..18349 | - | 378 | WP_128652626.1 | helix-turn-helix domain-containing protein | - |
KUU72_RS32900 (KUU72_32895) | 18370..18657 | - | 288 | WP_196994201.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32905 (KUU72_32900) | 18670..18876 | - | 207 | WP_196994202.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32910 (KUU72_32905) | 18896..19243 | - | 348 | WP_079263052.1 | helix-turn-helix transcriptional regulator | - |
KUU72_RS32915 (KUU72_32910) | 19258..19482 | - | 225 | WP_019727142.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32920 (KUU72_32915) | 20124..20435 | + | 312 | WP_126620957.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32925 (KUU72_32920) | 20493..20693 | - | 201 | WP_023123722.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32930 (KUU72_32925) | 20707..21327 | - | 621 | WP_196994203.1 | Tn3 family transposase TnpR_TnEc1 | Transposase |
KUU72_RS32935 (KUU72_32930) | 21511..21681 | + | 171 | WP_196994204.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32940 (KUU72_32935) | 21759..22034 | - | 276 | WP_031655097.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32945 (KUU72_32940) | 22034..22315 | - | 282 | WP_023123759.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32950 (KUU72_32945) | 23484..25304 | - | 1821 | WP_049956023.1 | type IA DNA topoisomerase | - |
KUU72_RS32955 (KUU72_32950) | 25313..25921 | - | 609 | WP_078458668.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32960 (KUU72_32955) | 25921..26352 | - | 432 | WP_196994205.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32965 (KUU72_32960) | 26363..27385 | - | 1023 | WP_196994206.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32970 (KUU72_32965) | 27382..28191 | - | 810 | WP_023123756.1 | ParA family protein | - |
KUU72_RS32975 (KUU72_32970) | 28194..30314 | - | 2121 | WP_128570136.1 | TraM recognition domain-containing protein | - |
KUU72_RS32980 (KUU72_32975) | 32117..32875 | + | 759 | WP_126620954.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS32985 (KUU72_32980) | 32872..33909 | + | 1038 | WP_044069758.1 | Putative conjugal transfer protein | VF |
KUU72_RS32995 (KUU72_32990) | 34576..34821 | - | 246 | WP_203327833.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33000 (KUU72_32995) | 35009..35578 | - | 570 | WP_023123752.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33005 (KUU72_33000) | 36035..36226 | - | 192 | WP_124176250.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33010 (KUU72_33005) | 36780..37190 | + | 411 | WP_023123751.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33015 (KUU72_33010) | 37195..37530 | + | 336 | WP_019727098.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33020 (KUU72_33015) | 37533..40085 | + | 2553 | WP_222825893.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33025 (KUU72_33020) | 40104..40955 | + | 852 | WP_222825894.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33030 (KUU72_33025) | 40965..41495 | + | 531 | WP_222825895.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33035 (KUU72_33030) | 41630..41905 | + | 276 | WP_222825896.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33040 (KUU72_33035) | 41916..42446 | + | 531 | WP_126620960.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33045 (KUU72_33040) | 42493..43623 | + | 1131 | WP_126633629.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33050 (KUU72_33045) | 43636..44424 | + | 789 | WP_058151249.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33055 (KUU72_33050) | 44421..45266 | + | 846 | WP_031757119.1 | TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein | - |
KUU72_RS33060 (KUU72_33055) | 45272..46675 | + | 1404 | WP_222825897.1 | TrbI/VirB10 family protein | - |
KUU72_RS33065 (KUU72_33060) | 46653..47027 | + | 375 | WP_034073804.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33070 (KUU72_33065) | 47027..47224 | + | 198 | WP_019727106.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33075 (KUU72_33070) | 47235..47957 | + | 723 | WP_160511456.1 | lytic transglycosylase domain-containing protein | - |
KUU72_RS33080 (KUU72_33075) | 47954..48277 | + | 324 | WP_023123742.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33085 (KUU72_33080) | 48274..48669 | + | 396 | WP_042159139.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33090 (KUU72_33085) | 48697..49041 | + | 345 | Protein_66 | single-stranded DNA-binding protein | - |
KUU72_RS33095 (KUU72_33090) | 49140..49730 | + | 591 | WP_152989013.1 | hypothetical protein | - |
KUU72_RS33100 (KUU72_33095) | 49790..51688 | + | 1899 | WP_222825898.1 | Autotransporter adhesin UpaG | VF |
KUU72_RS33105 (KUU72_33100) | 51700..52326 | + | 627 | WP_019727114.1 | DUF6012 family protein | - |
Similar MGE(s)
Similar MGE(s) is defined as other TA-related MGE(s) with Mash distance < 0.01 to this MGE.
Detail | Organism | MGE type | Related TA | Genome accession | Coordinates | Mash distance |
---|