Protein ID: 67458480 |
T4SS name [ID] | VirB [501] |
Gene symbol | virB4_1 |
Locus tag | RF_0088 |
Strain | Rickettsia felis URRWXCal2 |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_007109] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 91953..94370 [+] |
Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | Q4UNB9 |
KEGG ID | rfe:RF_0088 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 7.9e-69, Aligned region: 194..399 AAA_10 [PF12846], Evalue: 1.9e-37, Aligned region: 452..727 AAA_23 [PF13476], Evalue: 1.4e-05, Aligned region: 444..576 |
Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
>gi|67458480|ref|YP_246104.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia felis URRWXCal2] MKLFRTRAAKELRSKQERPTSHFIPYKCHWDSNTILTKDNSLLQVIKINGFSFETADDEDLDIKKNVRNA LLKNMASGNIVMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGAEWRKKHAGARSFFNELYVSILY KPDTGGAAIVEYFLKKLRQKSNKTAWENDMKEMKENLQEMSTRVVNTFRSYGARLLGVRQTQSGSYCEIL EFLSSLINCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEARSPLGKKYAGMISILEYGPNTSAGIFDGF LQMPFEFVMTQSFVFANRTVAIGKMQLQQNRMIQSGDKATSQIAEINTALDMATSGDIGFGEHHLSLLCS ANNIKALEDILSMAAVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMDYIVRKSTINTLNMASFASQHNYPLG KIRDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPRMFFFDKDRG AEIFIRALNGVYTVIDPGLKCNFNPLQLEDTSENRTFILEWLRVLVTSNGESLTAQDNKILSQAVSGNFR LEKKDRRLSNVIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEVDDIDLQKARVFGFDMTELLKDPVSLA PVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDAAKSRISD TLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDSTTRYFLIKQGIDAVVAKVNLDGMNNIISVL SGRVETVILLDQIREKYGNDPDKWLPIFYEAVKTL |
Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
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Protein ID: 67459642 |
T4SS name [ID] | VirB [501] |
Gene symbol | virB4_2 |
Locus tag | RF_1250 |
Strain | Rickettsia felis URRWXCal2 |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_007109] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 1322075..1324507 [+] |
Product | type IV secretion/conjugal transfer ATPase |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | Q4UK34 |
KEGG ID | rfe:RF_1250 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 1.4e-52, Aligned region: 183..383 AAA_10 [PF12846], Evalue: 3.3e-09, Aligned region: 436..605 |
Protein Sequence: 810 a.a. [Download] |
>gi|67459642|ref|YP_247266.1| type IV secretion/conjugal transfer ATPase [Rickettsia felis URRWXCal2] MFSDLRKFDKDIYNYNAPNFIPIACHYNQNTLLTKDGKLLQIIKIHGINSEKISDNIQNLREMVRVSIKK NITDYDFAFWLHTIREKQNLDDSTPYKKLLPANIHALWQRKNHWNDKFVNTLYISIVHDSAKVDIKNFNS LINSLSNKLITDFENNYLDSAFQKLENITNNILNDLNEFGAEKLGIIFENDNIFSNPLFLYNRIANLNNN DCLVPIIDLSDALGRSIYTISGDKMVVTDHEKNNKFASLLSIKEYQETPSNTLDKFLQLPIELIITEIFY FVSKKQVISKLRGQDHILKITNDSTLLNHKGINKLDAANLDFQFCNQQISIAVIEEDENKLDAAVAKAST ELFKLGIIHVKEDLNIEQIFWSQLPANFAFIRRMSPLSVEYIASLTALHNTTLGNQYNPWGKAITLLRTE KGTPYFMNFHDKTNKGNTCIFGTEKTGKTVLLNFLISESTKYDPTIIYISNNNDSKIFIESIEGKWLEPD KQIINPFLVDDTEKSQAFILEFLKLISGHYISPLSEIEISFLEKLKNKILSIEKEKRIFSDILKLEDFKE EGGIQILDKLKVFTEGQLYFGLFDRPPLNIEEGKVIGFNLYKLSDEPFSKQFYPTERKFLEQFNNNLKKH QAICAGVIYAFTYHLSLVGTKPKIFAADNFDKLYRPEVYYDNINLIYNNLSQNNGIFVSNFNFIYLKSYP KYTIKPWLDLINTKIILPSDVKIEDLDKILGLSEPEIRKLSQLILSARMFLINKDNESIASELSIAALIG IVRILSSRQEEMDIYNKILEQHQGPPDNWINYLYNELNTD |
Nucleotide Sequence: 2433 bp [Download] |
>gi|67458392|ref|NC_007109.1|:1322075-1324507 Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome, complete genome GTGTTTAGTGATTTACGAAAATTTGACAAAGATATATATAATTATAATGCTCCTAATTTTATACCTATAG CATGTCATTATAATCAAAATACTTTACTTACCAAAGACGGTAAATTACTACAAATTATAAAAATACACGG CATTAACTCAGAGAAAATAAGCGATAACATACAAAATTTACGTGAAATGGTTAGAGTTTCTATAAAAAAG AATATAACCGATTATGATTTTGCTTTTTGGCTACATACAATACGAGAAAAACAAAATTTAGATGATTCCA CTCCTTACAAAAAATTATTACCGGCAAATATTCATGCACTATGGCAAAGAAAAAACCATTGGAATGATAA ATTCGTTAATACTTTATATATATCTATAGTACATGATTCTGCTAAAGTTGACATCAAAAATTTTAACTCT TTAATAAATTCTTTATCTAATAAATTAATTACTGATTTTGAAAATAACTACTTAGATTCAGCTTTTCAAA AACTAGAAAATATCACTAATAATATTTTAAACGATTTAAACGAATTCGGTGCTGAAAAACTTGGTATAAT ATTTGAAAATGATAATATTTTTTCTAATCCTTTATTTTTATATAATCGAATAGCTAACCTTAATAATAAT GATTGTTTGGTACCTATAATAGATTTATCCGATGCACTAGGTAGAAGTATTTATACAATTAGCGGCGATA AAATGGTAGTTACGGATCATGAGAAAAATAACAAATTCGCTTCTTTACTATCTATAAAAGAATATCAAGA AACTCCTTCTAATACACTGGATAAATTTTTACAGTTACCGATTGAATTAATAATAACTGAAATATTTTAC TTTGTTAGCAAAAAACAAGTAATATCCAAATTGCGTGGTCAAGATCATATTCTAAAAATTACTAACGACT CAACTTTACTTAATCATAAAGGGATTAATAAGCTTGATGCAGCTAATTTAGATTTTCAATTTTGTAATCA GCAAATTTCAATTGCCGTTATAGAAGAAGATGAAAATAAACTAGATGCAGCCGTAGCTAAAGCATCAACC GAACTTTTTAAACTTGGTATTATTCATGTAAAAGAAGATCTTAATATTGAACAAATATTTTGGTCGCAAT TACCTGCTAACTTTGCCTTTATCCGCAGAATGTCACCATTATCCGTAGAATATATTGCTTCTCTTACCGC TCTTCATAATACTACACTCGGTAATCAATATAATCCTTGGGGTAAGGCTATAACTTTACTGCGAACCGAG AAAGGTACTCCATATTTCATGAATTTTCATGATAAAACGAATAAAGGTAATACTTGCATCTTTGGTACGG AAAAAACCGGCAAAACCGTATTATTGAACTTTCTAATATCAGAATCAACTAAATACGATCCAACAATAAT TTATATCTCTAATAATAATGATTCTAAAATTTTTATCGAGTCAATAGAAGGCAAATGGCTAGAACCGGAC AAACAAATTATCAATCCATTTTTAGTAGATGATACAGAAAAATCACAAGCTTTCATTTTAGAATTTTTAA AATTAATCAGCGGTCATTATATTTCACCTCTTAGTGAAATAGAGATATCCTTTCTAGAGAAATTAAAAAA TAAAATTTTATCAATTGAAAAAGAAAAACGTATTTTTTCCGATATTTTAAAATTAGAAGATTTTAAAGAG GAAGGAGGAATACAAATACTTGATAAACTTAAAGTTTTTACCGAAGGACAATTATATTTCGGATTATTTG ACAGACCACCTCTTAACATTGAAGAAGGGAAAGTTATAGGATTCAATTTATATAAACTCTCTGATGAGCC GTTTTCTAAACAATTTTATCCAACGGAGAGGAAATTTTTAGAACAATTTAATAATAATTTAAAGAAACAT CAAGCTATTTGTGCAGGAGTAATTTATGCTTTTACTTATCATTTAAGCCTAGTTGGCACAAAACCTAAAA TATTTGCTGCCGATAATTTTGATAAACTTTACAGACCTGAAGTTTATTATGATAATATAAATTTAATCTA TAATAATTTATCTCAAAATAACGGTATTTTCGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAGTCATATCCA AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATTCTACCGTCTGACGTTAAAATAG AAGATTTAGATAAAATTTTAGGTTTAAGCGAGCCGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATACTTTCTGC AAGAATGTTCTTAATTAATAAGGATAATGAATCGATAGCTTCTGAATTAAGTATTGCCGCTTTAATAGGA ATTGTCCGTATTTTATCAAGCAGACAAGAGGAAATGGATATTTATAACAAAATACTTGAACAACACCAAG GTCCTCCGGATAATTGGATTAATTACCTATATAATGAGTTAAATACGGACTGA |